Protein–RNA interactions for Protein: Q06132

SGD1, Suppressor of glycerol defect protein 1, yeastyeast

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Length 899 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGD1Q06132 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.32■■□□□ 1.32
SGD1Q06132 NOP1YDL014W 984 nt22.99■■□□□ 1.27
SGD1Q06132 NSR1YGR159C 1245 nt22.72■■□□□ 1.23
SGD1Q06132 YKL036CYKL036C 393 nt21.85■■□□□ 1.09
SGD1Q06132 MDJ1YFL016C 1536 nt20.55■□□□□ 0.88
SGD1Q06132 YJL027CYJL027C 417 nt20.52■□□□□ 0.88
SGD1Q06132 Q0297Q0297 156 nt20.36■□□□□ 0.85
SGD1Q06132 SCS3YGL126W 1143 nt20.23■□□□□ 0.83
SGD1Q06132 SRX1YKL086W 384 nt20.08■□□□□ 0.81
SGD1Q06132 YCR051WYCR051W 669 nt19.08■□□□□ 0.64
SGD1Q06132 YOL085CYOL085C 342 nt18.89■□□□□ 0.61
SGD1Q06132 SCJ1YMR214W 1134 nt18.85■□□□□ 0.61
SGD1Q06132 PKP1YIL042C 1185 nt18.48■□□□□ 0.55
SGD1Q06132 ATS1YAL020C 1002 nt18.3■□□□□ 0.52
SGD1Q06132 RPP1BYDL130W 321 nt18.26■□□□□ 0.51
SGD1Q06132 DBP2YNL112W 1641 nt18.08■□□□□ 0.48
SGD1Q06132 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.75■□□□□ 0.43
SGD1Q06132 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.75■□□□□ 0.43
SGD1Q06132 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.75■□□□□ 0.43
SGD1Q06132 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.75■□□□□ 0.43
SGD1Q06132 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.75■□□□□ 0.43
SGD1Q06132 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.75■□□□□ 0.43
SGD1Q06132 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.75■□□□□ 0.43
SGD1Q06132 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.75■□□□□ 0.43
SGD1Q06132 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.75■□□□□ 0.43
SGD1Q06132 YBR190WYBR190W 312 nt17.61■□□□□ 0.41
SGD1Q06132 CCC1YLR220W 969 nt17.52■□□□□ 0.4
SGD1Q06132 SCR1SCR1 522 nt17.37■□□□□ 0.37
SGD1Q06132 PET122YER153C 765 nt17.33■□□□□ 0.36
SGD1Q06132 RTC3YHR087W 336 nt17.14■□□□□ 0.33
SGD1Q06132 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.01■□□□□ 0.31
SGD1Q06132 RRN5YLR141W 1092 nt16.91■□□□□ 0.3
SGD1Q06132 PST2YDR032C 597 nt16.84■□□□□ 0.29
SGD1Q06132 RVS167YDR388W 1449 nt16.79■□□□□ 0.28
SGD1Q06132 RSB1YOR049C 1065 nt16.77■□□□□ 0.28
SGD1Q06132 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.59■□□□□ 0.25
SGD1Q06132 YKL097CYKL097C 411 nt16.54■□□□□ 0.24
SGD1Q06132 YDJ1YNL064C 1230 nt16.47■□□□□ 0.23
SGD1Q06132 PUT4YOR348C 1884 nt16.32■□□□□ 0.2
SGD1Q06132 SHR5YOL110W 714 nt16.17■□□□□ 0.18
SGD1Q06132 SSA3YBL075C 1950 nt16.13■□□□□ 0.17
SGD1Q06132 SHU1YHL006C 453 nt15.96■□□□□ 0.15
SGD1Q06132 GAR1YHR089C 618 nt15.95■□□□□ 0.14
SGD1Q06132 URN1YPR152C 1398 nt15.95■□□□□ 0.14
SGD1Q06132 ARE1YCR048W 1833 nt15.91■□□□□ 0.14
SGD1Q06132 DEP1YAL013W 1218 nt15.83■□□□□ 0.12
SGD1Q06132 OPI9YLR338W 858 nt15.82■□□□□ 0.12
SGD1Q06132 SAH1YER043C 1350 nt15.8■□□□□ 0.12
SGD1Q06132 YOR139CYOR139C 393 nt15.73■□□□□ 0.11
SGD1Q06132 POA1YBR022W 534 nt15.73■□□□□ 0.11
SGD1Q06132 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.67■□□□□ 0.1
SGD1Q06132 RPN10YHR200W 807 nt15.59■□□□□ 0.09
SGD1Q06132 YNL208WYNL208W 600 nt15.54■□□□□ 0.08
SGD1Q06132 BSC6YOL137W 1494 nt15.49■□□□□ 0.07
SGD1Q06132 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.47■□□□□ 0.07
SGD1Q06132 NPL3YDR432W 1245 nt15.45■□□□□ 0.06
SGD1Q06132 TIR1YER011W 765 nt15.41■□□□□ 0.06
SGD1Q06132 PUN1YLR414C 792 nt15.33■□□□□ 0.04
SGD1Q06132 BUD23YCR047C 828 nt15.24■□□□□ 0.03
SGD1Q06132 PTC2YER089C 1395 nt15.21■□□□□ 0.02
SGD1Q06132 YJR018WYJR018W 363 nt15.19■□□□□ 0.02
SGD1Q06132 SPT5YML010W 3192 nt15.12■□□□□ 0.01
SGD1Q06132 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt15.07■□□□□ 0
SGD1Q06132 IMT4tM(CAU)E 72 nt15.07■□□□□ 0
SGD1Q06132 IMT3tM(CAU)J3 72 nt15.07■□□□□ 0
SGD1Q06132 IMT1tM(CAU)O1 72 nt15.07■□□□□ 0
SGD1Q06132 IMT2tM(CAU)P 72 nt15.07■□□□□ 0
SGD1Q06132 YOL037CYOL037C 354 nt15.06■□□□□ 0
SGD1Q06132 NAB2YGL122C 1578 nt15.06■□□□□ 0
SGD1Q06132 SSA1YAL005C 1929 nt15.05■□□□□ 0
SGD1Q06132 YGR021WYGR021W 873 nt15.01□□□□□ -0.01
SGD1Q06132 YJR120WYJR120W 351 nt14.98□□□□□ -0.01
SGD1Q06132 MNP1YGL068W 585 nt14.97□□□□□ -0.01
SGD1Q06132 HOM6YJR139C 1080 nt14.97□□□□□ -0.01
SGD1Q06132 SRB2YHR041C 633 nt14.92□□□□□ -0.02
SGD1Q06132 FIS1YIL065C 468 nt14.87□□□□□ -0.03
SGD1Q06132 WWM1YFL010C 636 nt14.82□□□□□ -0.04
SGD1Q06132 DAL1YIR027C 1383 nt14.8□□□□□ -0.04
SGD1Q06132 MOT3YMR070W 1473 nt14.77□□□□□ -0.04
SGD1Q06132 RKM5YLR137W 1104 nt14.74□□□□□ -0.05
SGD1Q06132 RPP2BYDR382W 333 nt14.73□□□□□ -0.05
SGD1Q06132 FPR4YLR449W 1179 nt14.7□□□□□ -0.06
SGD1Q06132 SSA4YER103W 1929 nt14.69□□□□□ -0.06
SGD1Q06132 INM2YDR287W 879 nt14.68□□□□□ -0.06
SGD1Q06132 PUS2YGL063W 1113 nt14.68□□□□□ -0.06
SGD1Q06132 PHO4YFR034C 939 nt14.67□□□□□ -0.06
SGD1Q06132 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.62□□□□□ -0.07
SGD1Q06132 YLR281CYLR281C 468 nt14.62□□□□□ -0.07
SGD1Q06132 MEP2YNL142W 1500 nt14.58□□□□□ -0.08
SGD1Q06132 YPS1YLR120C 1710 nt14.53□□□□□ -0.08
SGD1Q06132 MRPL8YJL063C 717 nt14.49□□□□□ -0.09
SGD1Q06132 YBL100CYBL100C 315 nt14.49□□□□□ -0.09
SGD1Q06132 WHI5YOR083W 888 nt14.46□□□□□ -0.09
SGD1Q06132 BDH2YAL061W 1254 nt14.43□□□□□ -0.1
SGD1Q06132 YDR095CYDR095C 411 nt14.4□□□□□ -0.1
SGD1Q06132 DCW1YKL046C 1350 nt14.36□□□□□ -0.11
SGD1Q06132 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.34□□□□□ -0.11
SGD1Q06132 FUN26YAL022C 1554 nt14.32□□□□□ -0.12
SGD1Q06132 FMP45YDL222C 930 nt14.32□□□□□ -0.12
SGD1Q06132 LSM3YLR438C-A 270 nt14.3□□□□□ -0.12
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