Protein–RNA interactions for Protein: Q05788

PNP1, Purine nucleoside phosphorylase, yeastyeast

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PNP1Q05788 NSR1YGR159C 1245 nt20.89■□□□□ 0.93
PNP1Q05788 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.69■□□□□ 0.9
PNP1Q05788 NOP1YDL014W 984 nt19.89■□□□□ 0.77
PNP1Q05788 MDJ1YFL016C 1536 nt19■□□□□ 0.63
PNP1Q05788 YKL036CYKL036C 393 nt18.03■□□□□ 0.48
PNP1Q05788 SRX1YKL086W 384 nt17.44■□□□□ 0.38
PNP1Q05788 YJL027CYJL027C 417 nt17.41■□□□□ 0.38
PNP1Q05788 Q0297Q0297 156 nt17.36■□□□□ 0.37
PNP1Q05788 DBP2YNL112W 1641 nt16.7■□□□□ 0.26
PNP1Q05788 YCR051WYCR051W 669 nt16.48■□□□□ 0.23
PNP1Q05788 SCS3YGL126W 1143 nt16.26■□□□□ 0.19
PNP1Q05788 YBR190WYBR190W 312 nt16.25■□□□□ 0.19
PNP1Q05788 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.04■□□□□ 0.16
PNP1Q05788 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.04■□□□□ 0.16
PNP1Q05788 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.04■□□□□ 0.16
PNP1Q05788 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.04■□□□□ 0.16
PNP1Q05788 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.04■□□□□ 0.16
PNP1Q05788 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.04■□□□□ 0.16
PNP1Q05788 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.04■□□□□ 0.16
PNP1Q05788 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.04■□□□□ 0.16
PNP1Q05788 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.04■□□□□ 0.16
PNP1Q05788 RTC3YHR087W 336 nt15.83■□□□□ 0.12
PNP1Q05788 CCC1YLR220W 969 nt15.82■□□□□ 0.12
PNP1Q05788 YOL085CYOL085C 342 nt15.67■□□□□ 0.1
PNP1Q05788 RPP1BYDL130W 321 nt15.56■□□□□ 0.08
PNP1Q05788 PKP1YIL042C 1185 nt15.49■□□□□ 0.07
PNP1Q05788 Q0182Q0182 405 nt15.45■□□□□ 0.06
PNP1Q05788 SCJ1YMR214W 1134 nt15.45■□□□□ 0.06
PNP1Q05788 RVS167YDR388W 1449 nt15.43■□□□□ 0.06
PNP1Q05788 MOT3YMR070W 1473 nt15.17■□□□□ 0.02
PNP1Q05788 PUT4YOR348C 1884 nt15.13■□□□□ 0.01
PNP1Q05788 SSA3YBL075C 1950 nt15.09■□□□□ 0.01
PNP1Q05788 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.02■□□□□ -0
PNP1Q05788 PET122YER153C 765 nt14.96□□□□□ -0.01
PNP1Q05788 SHR5YOL110W 714 nt14.88□□□□□ -0.03
PNP1Q05788 ARE1YCR048W 1833 nt14.74□□□□□ -0.05
PNP1Q05788 URN1YPR152C 1398 nt14.72□□□□□ -0.05
PNP1Q05788 SAH1YER043C 1350 nt14.62□□□□□ -0.07
PNP1Q05788 DEP1YAL013W 1218 nt14.61□□□□□ -0.07
PNP1Q05788 OPI9YLR338W 858 nt14.59□□□□□ -0.07
PNP1Q05788 POA1YBR022W 534 nt14.59□□□□□ -0.07
PNP1Q05788 SCR1SCR1 522 nt14.57□□□□□ -0.08
PNP1Q05788 YDJ1YNL064C 1230 nt14.53□□□□□ -0.08
PNP1Q05788 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.52□□□□□ -0.09
PNP1Q05788 RRN5YLR141W 1092 nt14.46□□□□□ -0.09
PNP1Q05788 ATS1YAL020C 1002 nt14.41□□□□□ -0.1
PNP1Q05788 BSC6YOL137W 1494 nt14.37□□□□□ -0.11
PNP1Q05788 RPN10YHR200W 807 nt14.32□□□□□ -0.12
PNP1Q05788 YNL208WYNL208W 600 nt14.3□□□□□ -0.12
PNP1Q05788 GAR1YHR089C 618 nt14.26□□□□□ -0.13
PNP1Q05788 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.19□□□□□ -0.14
PNP1Q05788 PUN1YLR414C 792 nt14.12□□□□□ -0.15
PNP1Q05788 BUD23YCR047C 828 nt14.1□□□□□ -0.15
PNP1Q05788 SPT5YML010W 3192 nt14.1□□□□□ -0.15
PNP1Q05788 PTC2YER089C 1395 nt14.05□□□□□ -0.16
PNP1Q05788 RSB1YOR049C 1065 nt14.01□□□□□ -0.17
PNP1Q05788 YJR018WYJR018W 363 nt14□□□□□ -0.17
PNP1Q05788 NAB2YGL122C 1578 nt13.9□□□□□ -0.18
PNP1Q05788 YJR120WYJR120W 351 nt13.84□□□□□ -0.19
PNP1Q05788 TIR1YER011W 765 nt13.8□□□□□ -0.2
PNP1Q05788 SSA1YAL005C 1929 nt13.78□□□□□ -0.2
PNP1Q05788 FIS1YIL065C 468 nt13.77□□□□□ -0.21
PNP1Q05788 SSA4YER103W 1929 nt13.7□□□□□ -0.22
PNP1Q05788 DAL1YIR027C 1383 nt13.65□□□□□ -0.22
PNP1Q05788 FPR4YLR449W 1179 nt13.58□□□□□ -0.24
PNP1Q05788 SRB2YHR041C 633 nt13.57□□□□□ -0.24
PNP1Q05788 PHO4YFR034C 939 nt13.56□□□□□ -0.24
PNP1Q05788 RPP2BYDR382W 333 nt13.54□□□□□ -0.24
PNP1Q05788 INM2YDR287W 879 nt13.52□□□□□ -0.25
PNP1Q05788 MEP2YNL142W 1500 nt13.52□□□□□ -0.25
PNP1Q05788 YPS1YLR120C 1710 nt13.44□□□□□ -0.26
PNP1Q05788 PST2YDR032C 597 nt13.44□□□□□ -0.26
PNP1Q05788 YBL100CYBL100C 315 nt13.36□□□□□ -0.27
PNP1Q05788 DCW1YKL046C 1350 nt13.34□□□□□ -0.27
PNP1Q05788 YDR095CYDR095C 411 nt13.3□□□□□ -0.28
PNP1Q05788 BDH2YAL061W 1254 nt13.27□□□□□ -0.29
PNP1Q05788 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.26□□□□□ -0.29
PNP1Q05788 BDF1YLR399C 2061 nt13.25□□□□□ -0.29
PNP1Q05788 FUN26YAL022C 1554 nt13.2□□□□□ -0.3
PNP1Q05788 WWM1YFL010C 636 nt13.16□□□□□ -0.3
PNP1Q05788 EMI2YDR516C 1503 nt13.12□□□□□ -0.31
PNP1Q05788 PTP1YDL230W 1008 nt13.1□□□□□ -0.31
PNP1Q05788 NME1NME1 340 nt13.07□□□□□ -0.32
PNP1Q05788 TAT1YBR069C 1860 nt13.06□□□□□ -0.32
PNP1Q05788 CAC2YML102W 1407 nt13.05□□□□□ -0.32
PNP1Q05788 TRM9YML014W 840 nt13.04□□□□□ -0.32
PNP1Q05788 YBR220CYBR220C 1683 nt13.03□□□□□ -0.32
PNP1Q05788 ALF1YNL148C 765 nt13.02□□□□□ -0.33
PNP1Q05788 LSM3YLR438C-A 270 nt13.01□□□□□ -0.33
PNP1Q05788 RPP2AYOL039W 321 nt13.01□□□□□ -0.33
PNP1Q05788 CCT6YDR188W 1641 nt13□□□□□ -0.33
PNP1Q05788 SHU1YHL006C 453 nt13□□□□□ -0.33
PNP1Q05788 YDL221WYDL221W 552 nt12.99□□□□□ -0.33
PNP1Q05788 YMR090WYMR090W 684 nt12.94□□□□□ -0.34
PNP1Q05788 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.92□□□□□ -0.34
PNP1Q05788 SIS1YNL007C 1059 nt12.92□□□□□ -0.34
PNP1Q05788 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.91□□□□□ -0.34
PNP1Q05788 SDH1YKL148C 1923 nt12.91□□□□□ -0.34
PNP1Q05788 HOM6YJR139C 1080 nt12.9□□□□□ -0.34
PNP1Q05788 YGR021WYGR021W 873 nt12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.3 ms