Protein–RNA interactions for Protein: P53292

MRPS35, 37S ribosomal protein S35, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MRPS35P53292 YML009W-BYML009W-B 477 nt24.37■■□□□ 1.49
MRPS35P53292 NSR1YGR159C 1245 nt24.14■■□□□ 1.45
MRPS35P53292 NOP1YDL014W 984 nt23.56■■□□□ 1.36
MRPS35P53292 YKL036CYKL036C 393 nt21.79■■□□□ 1.08
MRPS35P53292 MDJ1YFL016C 1536 nt21.59■■□□□ 1.05
MRPS35P53292 Q0297Q0297 156 nt20.67■□□□□ 0.9
MRPS35P53292 SRX1YKL086W 384 nt20.64■□□□□ 0.89
MRPS35P53292 YJL027CYJL027C 417 nt20.36■□□□□ 0.85
MRPS35P53292 SCS3YGL126W 1143 nt19.89■□□□□ 0.77
MRPS35P53292 YCR051WYCR051W 669 nt19.63■□□□□ 0.73
MRPS35P53292 DBP2YNL112W 1641 nt19.11■□□□□ 0.65
MRPS35P53292 YOL085CYOL085C 342 nt18.92■□□□□ 0.62
MRPS35P53292 TRN1tP(UGG)A 72 nt18.71■□□□□ 0.59
MRPS35P53292 SUF9tP(UGG)F 72 nt18.71■□□□□ 0.59
MRPS35P53292 SUF8tP(UGG)H 72 nt18.71■□□□□ 0.59
MRPS35P53292 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt18.71■□□□□ 0.59
MRPS35P53292 SUF7tP(UGG)M 72 nt18.71■□□□□ 0.59
MRPS35P53292 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt18.71■□□□□ 0.59
MRPS35P53292 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt18.71■□□□□ 0.59
MRPS35P53292 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt18.71■□□□□ 0.59
MRPS35P53292 SUF11tP(UGG)O2 72 nt18.71■□□□□ 0.59
MRPS35P53292 PKP1YIL042C 1185 nt18.71■□□□□ 0.59
MRPS35P53292 CCC1YLR220W 969 nt18.57■□□□□ 0.56
MRPS35P53292 RPP1BYDL130W 321 nt18.56■□□□□ 0.56
MRPS35P53292 YBR190WYBR190W 312 nt18.29■□□□□ 0.52
MRPS35P53292 RTC3YHR087W 336 nt17.93■□□□□ 0.46
MRPS35P53292 SCJ1YMR214W 1134 nt17.88■□□□□ 0.45
MRPS35P53292 PET122YER153C 765 nt17.8■□□□□ 0.44
MRPS35P53292 RVS167YDR388W 1449 nt17.8■□□□□ 0.44
MRPS35P53292 ATS1YAL020C 1002 nt17.76■□□□□ 0.43
MRPS35P53292 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.7■□□□□ 0.42
MRPS35P53292 SCR1SCR1 522 nt17.49■□□□□ 0.39
MRPS35P53292 RRN5YLR141W 1092 nt17.28■□□□□ 0.36
MRPS35P53292 SHR5YOL110W 714 nt17.23■□□□□ 0.35
MRPS35P53292 YDJ1YNL064C 1230 nt17.05■□□□□ 0.32
MRPS35P53292 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.93■□□□□ 0.3
MRPS35P53292 RSB1YOR049C 1065 nt16.9■□□□□ 0.3
MRPS35P53292 DEP1YAL013W 1218 nt16.86■□□□□ 0.29
MRPS35P53292 URN1YPR152C 1398 nt16.8■□□□□ 0.28
MRPS35P53292 GAR1YHR089C 618 nt16.77■□□□□ 0.28
MRPS35P53292 PUT4YOR348C 1884 nt16.7■□□□□ 0.26
MRPS35P53292 OPI9YLR338W 858 nt16.52■□□□□ 0.24
MRPS35P53292 SAH1YER043C 1350 nt16.5■□□□□ 0.23
MRPS35P53292 YNL208WYNL208W 600 nt16.47■□□□□ 0.23
MRPS35P53292 PST2YDR032C 597 nt16.46■□□□□ 0.23
MRPS35P53292 RPN10YHR200W 807 nt16.43■□□□□ 0.22
MRPS35P53292 ARE1YCR048W 1833 nt16.42■□□□□ 0.22
MRPS35P53292 POA1YBR022W 534 nt16.2■□□□□ 0.18
MRPS35P53292 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt16.19■□□□□ 0.18
MRPS35P53292 TIR1YER011W 765 nt16.18■□□□□ 0.18
MRPS35P53292 SSA1YAL005C 1929 nt16.04■□□□□ 0.16
MRPS35P53292 YJR018WYJR018W 363 nt16■□□□□ 0.15
MRPS35P53292 PUN1YLR414C 792 nt16■□□□□ 0.15
MRPS35P53292 PTC2YER089C 1395 nt15.88■□□□□ 0.13
MRPS35P53292 SRB2YHR041C 633 nt15.88■□□□□ 0.13
MRPS35P53292 YJR120WYJR120W 351 nt15.86■□□□□ 0.13
MRPS35P53292 SHU1YHL006C 453 nt15.84■□□□□ 0.13
MRPS35P53292 BSC6YOL137W 1494 nt15.83■□□□□ 0.12
MRPS35P53292 BUD23YCR047C 828 nt15.81■□□□□ 0.12
MRPS35P53292 YKL097CYKL097C 411 nt15.76■□□□□ 0.11
MRPS35P53292 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.66■□□□□ 0.1
MRPS35P53292 NAB2YGL122C 1578 nt15.62■□□□□ 0.09
MRPS35P53292 RPP2BYDR382W 333 nt15.61■□□□□ 0.09
MRPS35P53292 SSA3YBL075C 1950 nt15.56■□□□□ 0.08
MRPS35P53292 WWM1YFL010C 636 nt15.52■□□□□ 0.08
MRPS35P53292 FIS1YIL065C 468 nt15.48■□□□□ 0.07
MRPS35P53292 FPR4YLR449W 1179 nt15.45■□□□□ 0.06
MRPS35P53292 DAL1YIR027C 1383 nt15.43■□□□□ 0.06
MRPS35P53292 INM2YDR287W 879 nt15.37■□□□□ 0.05
MRPS35P53292 BDH2YAL061W 1254 nt15.34■□□□□ 0.05
MRPS35P53292 HOM6YJR139C 1080 nt15.33■□□□□ 0.04
MRPS35P53292 PHO4YFR034C 939 nt15.32■□□□□ 0.04
MRPS35P53292 MNP1YGL068W 585 nt15.32■□□□□ 0.04
MRPS35P53292 YGR021WYGR021W 873 nt15.29■□□□□ 0.04
MRPS35P53292 YBL100CYBL100C 315 nt15.29■□□□□ 0.04
MRPS35P53292 YOR139CYOR139C 393 nt15.22■□□□□ 0.03
MRPS35P53292 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt15.16■□□□□ 0.02
MRPS35P53292 SPT5YML010W 3192 nt15.12■□□□□ 0.01
MRPS35P53292 FUN26YAL022C 1554 nt15.11■□□□□ 0.01
MRPS35P53292 RKM5YLR137W 1104 nt15.1■□□□□ 0.01
MRPS35P53292 LSM3YLR438C-A 270 nt15.1■□□□□ 0.01
MRPS35P53292 TRM9YML014W 840 nt15.04■□□□□ -0
MRPS35P53292 YPS1YLR120C 1710 nt15.03■□□□□ -0
MRPS35P53292 NPL3YDR432W 1245 nt15.01□□□□□ -0.01
MRPS35P53292 YOL037CYOL037C 354 nt14.92□□□□□ -0.02
MRPS35P53292 YDR095CYDR095C 411 nt14.91□□□□□ -0.02
MRPS35P53292 CCT6YDR188W 1641 nt14.9□□□□□ -0.02
MRPS35P53292 ALF1YNL148C 765 nt14.85□□□□□ -0.03
MRPS35P53292 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.84□□□□□ -0.03
MRPS35P53292 MEP2YNL142W 1500 nt14.83□□□□□ -0.04
MRPS35P53292 SUF2tP(AGG)C 72 nt14.71□□□□□ -0.05
MRPS35P53292 SUF10tP(AGG)N 72 nt14.71□□□□□ -0.05
MRPS35P53292 DCW1YKL046C 1350 nt14.7□□□□□ -0.06
MRPS35P53292 SIS1YNL007C 1059 nt14.66□□□□□ -0.06
MRPS35P53292 PTP1YDL230W 1008 nt14.65□□□□□ -0.06
MRPS35P53292 YLR281CYLR281C 468 nt14.64□□□□□ -0.07
MRPS35P53292 RPP2AYOL039W 321 nt14.62□□□□□ -0.07
MRPS35P53292 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.61□□□□□ -0.07
MRPS35P53292 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.61□□□□□ -0.07
MRPS35P53292 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14 ms