Protein–RNA interactions for Protein: P40157

VID27, Vacuolar import and degradation protein 27, yeastyeast

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Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VID27P40157 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.87■■□□□ 1.41
VID27P40157 NSR1YGR159C 1245 nt23.54■■□□□ 1.36
VID27P40157 NOP1YDL014W 984 nt23.25■■□□□ 1.31
VID27P40157 YKL036CYKL036C 393 nt21.66■■□□□ 1.06
VID27P40157 MDJ1YFL016C 1536 nt20.75■□□□□ 0.91
VID27P40157 Q0297Q0297 156 nt20.45■□□□□ 0.86
VID27P40157 SRX1YKL086W 384 nt20.34■□□□□ 0.85
VID27P40157 YJL027CYJL027C 417 nt20.25■□□□□ 0.83
VID27P40157 SCS3YGL126W 1143 nt19.83■□□□□ 0.77
VID27P40157 YCR051WYCR051W 669 nt19.31■□□□□ 0.68
VID27P40157 YOL085CYOL085C 342 nt18.78■□□□□ 0.6
VID27P40157 PKP1YIL042C 1185 nt18.49■□□□□ 0.55
VID27P40157 DBP2YNL112W 1641 nt18.46■□□□□ 0.55
VID27P40157 RPP1BYDL130W 321 nt18.35■□□□□ 0.53
VID27P40157 TRN1tP(UGG)A 72 nt18.29■□□□□ 0.52
VID27P40157 SUF9tP(UGG)F 72 nt18.29■□□□□ 0.52
VID27P40157 SUF8tP(UGG)H 72 nt18.29■□□□□ 0.52
VID27P40157 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt18.29■□□□□ 0.52
VID27P40157 SUF7tP(UGG)M 72 nt18.29■□□□□ 0.52
VID27P40157 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt18.29■□□□□ 0.52
VID27P40157 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt18.29■□□□□ 0.52
VID27P40157 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt18.29■□□□□ 0.52
VID27P40157 SUF11tP(UGG)O2 72 nt18.29■□□□□ 0.52
VID27P40157 CCC1YLR220W 969 nt18.11■□□□□ 0.49
VID27P40157 ATS1YAL020C 1002 nt17.79■□□□□ 0.44
VID27P40157 SCJ1YMR214W 1134 nt17.78■□□□□ 0.44
VID27P40157 YBR190WYBR190W 312 nt17.61■□□□□ 0.41
VID27P40157 PET122YER153C 765 nt17.53■□□□□ 0.4
VID27P40157 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.37■□□□□ 0.37
VID27P40157 SCR1SCR1 522 nt17.34■□□□□ 0.37
VID27P40157 RVS167YDR388W 1449 nt17.32■□□□□ 0.36
VID27P40157 RTC3YHR087W 336 nt17.23■□□□□ 0.35
VID27P40157 RRN5YLR141W 1092 nt17.04■□□□□ 0.32
VID27P40157 SHR5YOL110W 714 nt16.8■□□□□ 0.28
VID27P40157 YDJ1YNL064C 1230 nt16.78■□□□□ 0.28
VID27P40157 RSB1YOR049C 1065 nt16.73■□□□□ 0.27
VID27P40157 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.71■□□□□ 0.27
VID27P40157 PST2YDR032C 597 nt16.45■□□□□ 0.22
VID27P40157 GAR1YHR089C 618 nt16.39■□□□□ 0.21
VID27P40157 DEP1YAL013W 1218 nt16.28■□□□□ 0.2
VID27P40157 URN1YPR152C 1398 nt16.22■□□□□ 0.19
VID27P40157 YNL208WYNL208W 600 nt16.02■□□□□ 0.16
VID27P40157 RPN10YHR200W 807 nt15.97■□□□□ 0.15
VID27P40157 OPI9YLR338W 858 nt15.93■□□□□ 0.14
VID27P40157 YKL097CYKL097C 411 nt15.88■□□□□ 0.13
VID27P40157 PUT4YOR348C 1884 nt15.86■□□□□ 0.13
VID27P40157 TIR1YER011W 765 nt15.83■□□□□ 0.12
VID27P40157 SAH1YER043C 1350 nt15.8■□□□□ 0.12
VID27P40157 SHU1YHL006C 453 nt15.75■□□□□ 0.11
VID27P40157 ARE1YCR048W 1833 nt15.65■□□□□ 0.1
VID27P40157 SSA1YAL005C 1929 nt15.63■□□□□ 0.09
VID27P40157 SSA3YBL075C 1950 nt15.55■□□□□ 0.08
VID27P40157 YJR018WYJR018W 363 nt15.48■□□□□ 0.07
VID27P40157 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.46■□□□□ 0.07
VID27P40157 SRB2YHR041C 633 nt15.45■□□□□ 0.06
VID27P40157 PUN1YLR414C 792 nt15.45■□□□□ 0.06
VID27P40157 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.43■□□□□ 0.06
VID27P40157 POA1YBR022W 534 nt15.39■□□□□ 0.05
VID27P40157 YJR120WYJR120W 351 nt15.34■□□□□ 0.05
VID27P40157 PTC2YER089C 1395 nt15.25■□□□□ 0.03
VID27P40157 YOR139CYOR139C 393 nt15.25■□□□□ 0.03
VID27P40157 RPP2BYDR382W 333 nt15.19■□□□□ 0.02
VID27P40157 WWM1YFL010C 636 nt15.19■□□□□ 0.02
VID27P40157 YGR021WYGR021W 873 nt15.11■□□□□ 0.01
VID27P40157 HOM6YJR139C 1080 nt15.11■□□□□ 0.01
VID27P40157 BUD23YCR047C 828 nt15.08■□□□□ 0
VID27P40157 MNP1YGL068W 585 nt15.08■□□□□ 0
VID27P40157 NPL3YDR432W 1245 nt15.03■□□□□ -0
VID27P40157 NAB2YGL122C 1578 nt15.02□□□□□ -0.01
VID27P40157 BSC6YOL137W 1494 nt15.01□□□□□ -0.01
VID27P40157 BDH2YAL061W 1254 nt14.95□□□□□ -0.02
VID27P40157 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.91□□□□□ -0.02
VID27P40157 RKM5YLR137W 1104 nt14.89□□□□□ -0.03
VID27P40157 INM2YDR287W 879 nt14.88□□□□□ -0.03
VID27P40157 YOL037CYOL037C 354 nt14.86□□□□□ -0.03
VID27P40157 DAL1YIR027C 1383 nt14.85□□□□□ -0.03
VID27P40157 FIS1YIL065C 468 nt14.85□□□□□ -0.03
VID27P40157 FPR4YLR449W 1179 nt14.84□□□□□ -0.03
VID27P40157 YBL100CYBL100C 315 nt14.79□□□□□ -0.04
VID27P40157 LSM3YLR438C-A 270 nt14.78□□□□□ -0.04
VID27P40157 PHO4YFR034C 939 nt14.74□□□□□ -0.05
VID27P40157 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.64□□□□□ -0.07
VID27P40157 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.64□□□□□ -0.07
VID27P40157 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.64□□□□□ -0.07
VID27P40157 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.64□□□□□ -0.07
VID27P40157 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.64□□□□□ -0.07
VID27P40157 FUN26YAL022C 1554 nt14.63□□□□□ -0.07
VID27P40157 TRM9YML014W 840 nt14.62□□□□□ -0.07
VID27P40157 YLR281CYLR281C 468 nt14.54□□□□□ -0.08
VID27P40157 CCT6YDR188W 1641 nt14.48□□□□□ -0.09
VID27P40157 PUS2YGL063W 1113 nt14.46□□□□□ -0.09
VID27P40157 WHI5YOR083W 888 nt14.46□□□□□ -0.09
VID27P40157 YPS1YLR120C 1710 nt14.37□□□□□ -0.11
VID27P40157 ALF1YNL148C 765 nt14.35□□□□□ -0.11
VID27P40157 YDR095CYDR095C 411 nt14.32□□□□□ -0.12
VID27P40157 SUF2tP(AGG)C 72 nt14.3□□□□□ -0.12
VID27P40157 SUF10tP(AGG)N 72 nt14.3□□□□□ -0.12
VID27P40157 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt14.29□□□□□ -0.12
VID27P40157 Q0182Q0182 405 nt14.26□□□□□ -0.13
VID27P40157 YPR011CYPR011C 981 nt14.2□□□□□ -0.14
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