Protein–RNA interactions for Protein: Q12146

PSF3, DNA replication complex GINS protein PSF3, yeastyeast

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PSF3Q12146 YML009W-BYML009W-B 477 nt24.59■■□□□ 1.53
PSF3Q12146 NOP1YDL014W 984 nt24.09■■□□□ 1.45
PSF3Q12146 NSR1YGR159C 1245 nt24.08■■□□□ 1.45
PSF3Q12146 YKL036CYKL036C 393 nt22.51■■□□□ 1.19
PSF3Q12146 YJL027CYJL027C 417 nt21.11■□□□□ 0.97
PSF3Q12146 Q0297Q0297 156 nt21.1■□□□□ 0.97
PSF3Q12146 MDJ1YFL016C 1536 nt21.02■□□□□ 0.96
PSF3Q12146 SRX1YKL086W 384 nt20.96■□□□□ 0.95
PSF3Q12146 SCS3YGL126W 1143 nt20.61■□□□□ 0.89
PSF3Q12146 YCR051WYCR051W 669 nt20■□□□□ 0.79
PSF3Q12146 YOL085CYOL085C 342 nt19.43■□□□□ 0.7
PSF3Q12146 PKP1YIL042C 1185 nt19.13■□□□□ 0.65
PSF3Q12146 RPP1BYDL130W 321 nt18.96■□□□□ 0.63
PSF3Q12146 SCJ1YMR214W 1134 nt18.72■□□□□ 0.59
PSF3Q12146 TRN1tP(UGG)A 72 nt18.71■□□□□ 0.59
PSF3Q12146 SUF9tP(UGG)F 72 nt18.71■□□□□ 0.59
PSF3Q12146 SUF8tP(UGG)H 72 nt18.71■□□□□ 0.59
PSF3Q12146 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt18.71■□□□□ 0.59
PSF3Q12146 SUF7tP(UGG)M 72 nt18.71■□□□□ 0.59
PSF3Q12146 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt18.71■□□□□ 0.59
PSF3Q12146 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt18.71■□□□□ 0.59
PSF3Q12146 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt18.71■□□□□ 0.59
PSF3Q12146 SUF11tP(UGG)O2 72 nt18.71■□□□□ 0.59
PSF3Q12146 DBP2YNL112W 1641 nt18.64■□□□□ 0.57
PSF3Q12146 CCC1YLR220W 969 nt18.63■□□□□ 0.57
PSF3Q12146 ATS1YAL020C 1002 nt18.54■□□□□ 0.56
PSF3Q12146 SCR1SCR1 522 nt18.07■□□□□ 0.48
PSF3Q12146 PET122YER153C 765 nt18.05■□□□□ 0.48
PSF3Q12146 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.85■□□□□ 0.45
PSF3Q12146 YBR190WYBR190W 312 nt17.85■□□□□ 0.45
PSF3Q12146 RVS167YDR388W 1449 nt17.82■□□□□ 0.44
PSF3Q12146 RRN5YLR141W 1092 nt17.58■□□□□ 0.4
PSF3Q12146 RTC3YHR087W 336 nt17.57■□□□□ 0.4
PSF3Q12146 RSB1YOR049C 1065 nt17.39■□□□□ 0.37
PSF3Q12146 YDJ1YNL064C 1230 nt17.26■□□□□ 0.35
PSF3Q12146 YER088W-BYER088W-B 147 nt17.22■□□□□ 0.35
PSF3Q12146 SHR5YOL110W 714 nt17.2■□□□□ 0.34
PSF3Q12146 PST2YDR032C 597 nt17.07■□□□□ 0.32
PSF3Q12146 GAR1YHR089C 618 nt16.86■□□□□ 0.29
PSF3Q12146 YKL097CYKL097C 411 nt16.68■□□□□ 0.26
PSF3Q12146 DEP1YAL013W 1218 nt16.62■□□□□ 0.25
PSF3Q12146 URN1YPR152C 1398 nt16.51■□□□□ 0.23
PSF3Q12146 RPN10YHR200W 807 nt16.44■□□□□ 0.22
PSF3Q12146 YNL208WYNL208W 600 nt16.4■□□□□ 0.22
PSF3Q12146 SHU1YHL006C 453 nt16.3■□□□□ 0.2
PSF3Q12146 TIR1YER011W 765 nt16.26■□□□□ 0.19
PSF3Q12146 OPI9YLR338W 858 nt16.17■□□□□ 0.18
PSF3Q12146 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.97■□□□□ 0.15
PSF3Q12146 SAH1YER043C 1350 nt15.97■□□□□ 0.15
PSF3Q12146 SSA1YAL005C 1929 nt15.92■□□□□ 0.14
PSF3Q12146 PUT4YOR348C 1884 nt15.84■□□□□ 0.13
PSF3Q12146 YOR139CYOR139C 393 nt15.83■□□□□ 0.12
PSF3Q12146 YJR018WYJR018W 363 nt15.78■□□□□ 0.12
PSF3Q12146 NPL3YDR432W 1245 nt15.77■□□□□ 0.12
PSF3Q12146 PUN1YLR414C 792 nt15.76■□□□□ 0.11
PSF3Q12146 ARE1YCR048W 1833 nt15.67■□□□□ 0.1
PSF3Q12146 YGR021WYGR021W 873 nt15.67■□□□□ 0.1
PSF3Q12146 RPP2BYDR382W 333 nt15.64■□□□□ 0.09
PSF3Q12146 SRB2YHR041C 633 nt15.63■□□□□ 0.09
PSF3Q12146 WWM1YFL010C 636 nt15.58■□□□□ 0.08
PSF3Q12146 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.55■□□□□ 0.08
PSF3Q12146 HOM6YJR139C 1080 nt15.54■□□□□ 0.08
PSF3Q12146 MNP1YGL068W 585 nt15.53■□□□□ 0.08
PSF3Q12146 PTC2YER089C 1395 nt15.48■□□□□ 0.07
PSF3Q12146 YOL037CYOL037C 354 nt15.47■□□□□ 0.07
PSF3Q12146 YJR120WYJR120W 351 nt15.46■□□□□ 0.07
PSF3Q12146 POA1YBR022W 534 nt15.45■□□□□ 0.06
PSF3Q12146 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt15.35■□□□□ 0.05
PSF3Q12146 RKM5YLR137W 1104 nt15.34■□□□□ 0.05
PSF3Q12146 BDH2YAL061W 1254 nt15.3■□□□□ 0.04
PSF3Q12146 BUD23YCR047C 828 nt15.29■□□□□ 0.04
PSF3Q12146 NAB2YGL122C 1578 nt15.23■□□□□ 0.03
PSF3Q12146 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt15.21■□□□□ 0.03
PSF3Q12146 IMT4tM(CAU)E 72 nt15.21■□□□□ 0.03
PSF3Q12146 IMT3tM(CAU)J3 72 nt15.21■□□□□ 0.03
PSF3Q12146 IMT1tM(CAU)O1 72 nt15.21■□□□□ 0.03
PSF3Q12146 IMT2tM(CAU)P 72 nt15.21■□□□□ 0.03
PSF3Q12146 INM2YDR287W 879 nt15.2■□□□□ 0.02
PSF3Q12146 LSM3YLR438C-A 270 nt15.17■□□□□ 0.02
PSF3Q12146 FPR4YLR449W 1179 nt15.15■□□□□ 0.02
PSF3Q12146 YBL100CYBL100C 315 nt15.1■□□□□ 0.01
PSF3Q12146 DAL1YIR027C 1383 nt15.1■□□□□ 0.01
PSF3Q12146 PUS2YGL063W 1113 nt15.05■□□□□ -0
PSF3Q12146 SSA3YBL075C 1950 nt15.04■□□□□ -0
PSF3Q12146 YLR281CYLR281C 468 nt15.03■□□□□ -0
PSF3Q12146 BSC6YOL137W 1494 nt15.02■□□□□ -0
PSF3Q12146 TRM9YML014W 840 nt15.01□□□□□ -0.01
PSF3Q12146 FIS1YIL065C 468 nt14.96□□□□□ -0.01
PSF3Q12146 WHI5YOR083W 888 nt14.96□□□□□ -0.01
PSF3Q12146 PHO4YFR034C 939 nt14.93□□□□□ -0.02
PSF3Q12146 FUN26YAL022C 1554 nt14.91□□□□□ -0.02
PSF3Q12146 MOT3YMR070W 1473 nt14.77□□□□□ -0.04
PSF3Q12146 CCT6YDR188W 1641 nt14.75□□□□□ -0.05
PSF3Q12146 ALF1YNL148C 765 nt14.72□□□□□ -0.05
PSF3Q12146 SUF2tP(AGG)C 72 nt14.71□□□□□ -0.05
PSF3Q12146 SUF10tP(AGG)N 72 nt14.71□□□□□ -0.05
PSF3Q12146 DSK2YMR276W 1122 nt14.7□□□□□ -0.06
PSF3Q12146 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt14.69□□□□□ -0.06
PSF3Q12146 FMP45YDL222C 930 nt14.68□□□□□ -0.06
PSF3Q12146 IMP2'YIL154C 1041 nt14.68□□□□□ -0.06
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