Protein–RNA interactions for Protein: P53104

ATG1, Serine/threonine-protein kinase ATG1, yeastyeast

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Length 897 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG1P53104 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.25■■□□□ 1.31
ATG1P53104 NOP1YDL014W 984 nt22.92■■□□□ 1.26
ATG1P53104 NSR1YGR159C 1245 nt22.63■■□□□ 1.21
ATG1P53104 YKL036CYKL036C 393 nt21.67■■□□□ 1.06
ATG1P53104 YJL027CYJL027C 417 nt20.34■□□□□ 0.85
ATG1P53104 Q0297Q0297 156 nt20.23■□□□□ 0.83
ATG1P53104 SRX1YKL086W 384 nt20■□□□□ 0.79
ATG1P53104 SCS3YGL126W 1143 nt19.99■□□□□ 0.79
ATG1P53104 MDJ1YFL016C 1536 nt19.44■□□□□ 0.7
ATG1P53104 YCR051WYCR051W 669 nt18.99■□□□□ 0.63
ATG1P53104 YOL085CYOL085C 342 nt18.72■□□□□ 0.59
ATG1P53104 SCJ1YMR214W 1134 nt18.56■□□□□ 0.56
ATG1P53104 PKP1YIL042C 1185 nt18.32■□□□□ 0.52
ATG1P53104 RPP1BYDL130W 321 nt18.15■□□□□ 0.5
ATG1P53104 ATS1YAL020C 1002 nt18.07■□□□□ 0.48
ATG1P53104 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.71■□□□□ 0.43
ATG1P53104 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.71■□□□□ 0.43
ATG1P53104 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.71■□□□□ 0.43
ATG1P53104 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.71■□□□□ 0.43
ATG1P53104 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.71■□□□□ 0.43
ATG1P53104 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.71■□□□□ 0.43
ATG1P53104 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.71■□□□□ 0.43
ATG1P53104 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.71■□□□□ 0.43
ATG1P53104 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.71■□□□□ 0.43
ATG1P53104 CCC1YLR220W 969 nt17.5■□□□□ 0.39
ATG1P53104 DBP2YNL112W 1641 nt17.45■□□□□ 0.38
ATG1P53104 SCR1SCR1 522 nt17.28■□□□□ 0.36
ATG1P53104 PET122YER153C 765 nt17.22■□□□□ 0.35
ATG1P53104 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.94■□□□□ 0.3
ATG1P53104 RRN5YLR141W 1092 nt16.79■□□□□ 0.28
ATG1P53104 RTC3YHR087W 336 nt16.78■□□□□ 0.28
ATG1P53104 RVS167YDR388W 1449 nt16.64■□□□□ 0.25
ATG1P53104 RSB1YOR049C 1065 nt16.64■□□□□ 0.25
ATG1P53104 PST2YDR032C 597 nt16.63■□□□□ 0.25
ATG1P53104 YBR190WYBR190W 312 nt16.49■□□□□ 0.23
ATG1P53104 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.47■□□□□ 0.23
ATG1P53104 YDJ1YNL064C 1230 nt16.42■□□□□ 0.22
ATG1P53104 YKL097CYKL097C 411 nt16.31■□□□□ 0.2
ATG1P53104 SHR5YOL110W 714 nt16.18■□□□□ 0.18
ATG1P53104 GAR1YHR089C 618 nt15.91■□□□□ 0.14
ATG1P53104 SHU1YHL006C 453 nt15.78■□□□□ 0.12
ATG1P53104 Q0182Q0182 405 nt15.58■□□□□ 0.08
ATG1P53104 YOR139CYOR139C 393 nt15.48■□□□□ 0.07
ATG1P53104 DEP1YAL013W 1218 nt15.44■□□□□ 0.06
ATG1P53104 TIR1YER011W 765 nt15.37■□□□□ 0.05
ATG1P53104 YNL208WYNL208W 600 nt15.35■□□□□ 0.05
ATG1P53104 URN1YPR152C 1398 nt15.32■□□□□ 0.04
ATG1P53104 RPN10YHR200W 807 nt15.31■□□□□ 0.04
ATG1P53104 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.31■□□□□ 0.04
ATG1P53104 NPL3YDR432W 1245 nt15.29■□□□□ 0.04
ATG1P53104 MOT3YMR070W 1473 nt15.26■□□□□ 0.03
ATG1P53104 PUT4YOR348C 1884 nt15.04■□□□□ -0
ATG1P53104 SSA1YAL005C 1929 nt15.03■□□□□ -0
ATG1P53104 OPI9YLR338W 858 nt14.99□□□□□ -0.01
ATG1P53104 YGR021WYGR021W 873 nt14.95□□□□□ -0.02
ATG1P53104 YOL037CYOL037C 354 nt14.93□□□□□ -0.02
ATG1P53104 SSA3YBL075C 1950 nt14.88□□□□□ -0.03
ATG1P53104 HOM6YJR139C 1080 nt14.87□□□□□ -0.03
ATG1P53104 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.86□□□□□ -0.03
ATG1P53104 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.86□□□□□ -0.03
ATG1P53104 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.86□□□□□ -0.03
ATG1P53104 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.86□□□□□ -0.03
ATG1P53104 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.86□□□□□ -0.03
ATG1P53104 MNP1YGL068W 585 nt14.84□□□□□ -0.03
ATG1P53104 SRB2YHR041C 633 nt14.82□□□□□ -0.04
ATG1P53104 WWM1YFL010C 636 nt14.75□□□□□ -0.05
ATG1P53104 SAH1YER043C 1350 nt14.7□□□□□ -0.06
ATG1P53104 ARE1YCR048W 1833 nt14.67□□□□□ -0.06
ATG1P53104 YJR018WYJR018W 363 nt14.67□□□□□ -0.06
ATG1P53104 RKM5YLR137W 1104 nt14.66□□□□□ -0.06
ATG1P53104 PUN1YLR414C 792 nt14.59□□□□□ -0.07
ATG1P53104 RPP2BYDR382W 333 nt14.58□□□□□ -0.08
ATG1P53104 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.58□□□□□ -0.08
ATG1P53104 PUS2YGL063W 1113 nt14.54□□□□□ -0.08
ATG1P53104 YJR120WYJR120W 351 nt14.5□□□□□ -0.09
ATG1P53104 POA1YBR022W 534 nt14.5□□□□□ -0.09
ATG1P53104 YLR281CYLR281C 468 nt14.49□□□□□ -0.09
ATG1P53104 BSC6YOL137W 1494 nt14.48□□□□□ -0.09
ATG1P53104 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.43□□□□□ -0.1
ATG1P53104 BDH2YAL061W 1254 nt14.37□□□□□ -0.11
ATG1P53104 WHI5YOR083W 888 nt14.34□□□□□ -0.11
ATG1P53104 LSM3YLR438C-A 270 nt14.32□□□□□ -0.12
ATG1P53104 PTC2YER089C 1395 nt14.25□□□□□ -0.13
ATG1P53104 MRPL8YJL063C 717 nt14.25□□□□□ -0.13
ATG1P53104 FMP45YDL222C 930 nt14.16□□□□□ -0.14
ATG1P53104 DSK2YMR276W 1122 nt14.14□□□□□ -0.15
ATG1P53104 IMP2'YIL154C 1041 nt14.12□□□□□ -0.15
ATG1P53104 INM2YDR287W 879 nt14.11□□□□□ -0.15
ATG1P53104 YCH1YGR203W 447 nt14.09□□□□□ -0.15
ATG1P53104 YBL100CYBL100C 315 nt14.04□□□□□ -0.16
ATG1P53104 YPR011CYPR011C 981 nt14.04□□□□□ -0.16
ATG1P53104 BUD23YCR047C 828 nt14.03□□□□□ -0.16
ATG1P53104 NAB2YGL122C 1578 nt14.03□□□□□ -0.16
ATG1P53104 ADO1YJR105W 1023 nt14.01□□□□□ -0.17
ATG1P53104 YLR236CYLR236C 324 nt14□□□□□ -0.17
ATG1P53104 TRM9YML014W 840 nt13.99□□□□□ -0.17
ATG1P53104 SPT5YML010W 3192 nt13.98□□□□□ -0.17
ATG1P53104 DAL1YIR027C 1383 nt13.96□□□□□ -0.18
ATG1P53104 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.93□□□□□ -0.18
ATG1P53104 FPR4YLR449W 1179 nt13.9□□□□□ -0.18
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