Protein–RNA interactions for Protein: P38721

YHL050C, Uncharacterized protein YHL050C, yeastyeast

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL050CP38721 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.96■■□□□ 1.43
YHL050CP38721 NSR1YGR159C 1245 nt23.54■■□□□ 1.36
YHL050CP38721 NOP1YDL014W 984 nt23.2■■□□□ 1.3
YHL050CP38721 YKL036CYKL036C 393 nt21.66■■□□□ 1.06
YHL050CP38721 MDJ1YFL016C 1536 nt20.91■□□□□ 0.94
YHL050CP38721 Q0297Q0297 156 nt20.45■□□□□ 0.86
YHL050CP38721 SRX1YKL086W 384 nt20.36■□□□□ 0.85
YHL050CP38721 YJL027CYJL027C 417 nt20.27■□□□□ 0.84
YHL050CP38721 SCS3YGL126W 1143 nt19.89■□□□□ 0.77
YHL050CP38721 YCR051WYCR051W 669 nt19.36■□□□□ 0.69
YHL050CP38721 YOL085CYOL085C 342 nt18.8■□□□□ 0.6
YHL050CP38721 PKP1YIL042C 1185 nt18.58■□□□□ 0.56
YHL050CP38721 DBP2YNL112W 1641 nt18.57■□□□□ 0.56
YHL050CP38721 TRN1tP(UGG)A 72 nt18.36■□□□□ 0.53
YHL050CP38721 SUF9tP(UGG)F 72 nt18.36■□□□□ 0.53
YHL050CP38721 SUF8tP(UGG)H 72 nt18.36■□□□□ 0.53
YHL050CP38721 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt18.36■□□□□ 0.53
YHL050CP38721 SUF7tP(UGG)M 72 nt18.36■□□□□ 0.53
YHL050CP38721 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt18.36■□□□□ 0.53
YHL050CP38721 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt18.36■□□□□ 0.53
YHL050CP38721 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt18.36■□□□□ 0.53
YHL050CP38721 SUF11tP(UGG)O2 72 nt18.36■□□□□ 0.53
YHL050CP38721 RPP1BYDL130W 321 nt18.35■□□□□ 0.53
YHL050CP38721 CCC1YLR220W 969 nt18.19■□□□□ 0.5
YHL050CP38721 ATS1YAL020C 1002 nt17.79■□□□□ 0.44
YHL050CP38721 SCJ1YMR214W 1134 nt17.68■□□□□ 0.42
YHL050CP38721 YBR190WYBR190W 312 nt17.64■□□□□ 0.41
YHL050CP38721 PET122YER153C 765 nt17.6■□□□□ 0.41
YHL050CP38721 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.41■□□□□ 0.38
YHL050CP38721 RVS167YDR388W 1449 nt17.32■□□□□ 0.36
YHL050CP38721 SCR1SCR1 522 nt17.31■□□□□ 0.36
YHL050CP38721 RTC3YHR087W 336 nt17.29■□□□□ 0.36
YHL050CP38721 RRN5YLR141W 1092 nt17.08■□□□□ 0.32
YHL050CP38721 SHR5YOL110W 714 nt16.82■□□□□ 0.28
YHL050CP38721 YDJ1YNL064C 1230 nt16.78■□□□□ 0.28
YHL050CP38721 RSB1YOR049C 1065 nt16.77■□□□□ 0.28
YHL050CP38721 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.75■□□□□ 0.27
YHL050CP38721 PST2YDR032C 597 nt16.46■□□□□ 0.23
YHL050CP38721 GAR1YHR089C 618 nt16.46■□□□□ 0.23
YHL050CP38721 DEP1YAL013W 1218 nt16.39■□□□□ 0.21
YHL050CP38721 URN1YPR152C 1398 nt16.28■□□□□ 0.2
YHL050CP38721 YNL208WYNL208W 600 nt16.03■□□□□ 0.16
YHL050CP38721 OPI9YLR338W 858 nt15.99■□□□□ 0.15
YHL050CP38721 RPN10YHR200W 807 nt15.97■□□□□ 0.15
YHL050CP38721 PUT4YOR348C 1884 nt15.97■□□□□ 0.15
YHL050CP38721 SAH1YER043C 1350 nt15.9■□□□□ 0.14
YHL050CP38721 TIR1YER011W 765 nt15.88■□□□□ 0.13
YHL050CP38721 YKL097CYKL097C 411 nt15.88■□□□□ 0.13
YHL050CP38721 Q0182Q0182 405 nt15.81■□□□□ 0.12
YHL050CP38721 SHU1YHL006C 453 nt15.8■□□□□ 0.12
YHL050CP38721 ARE1YCR048W 1833 nt15.75■□□□□ 0.11
YHL050CP38721 SSA1YAL005C 1929 nt15.71■□□□□ 0.11
YHL050CP38721 SRB2YHR041C 633 nt15.61■□□□□ 0.09
YHL050CP38721 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.55■□□□□ 0.08
YHL050CP38721 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.55■□□□□ 0.08
YHL050CP38721 YJR018WYJR018W 363 nt15.53■□□□□ 0.08
YHL050CP38721 POA1YBR022W 534 nt15.49■□□□□ 0.07
YHL050CP38721 PUN1YLR414C 792 nt15.48■□□□□ 0.07
YHL050CP38721 YJR120WYJR120W 351 nt15.47■□□□□ 0.07
YHL050CP38721 MOT3YMR070W 1473 nt15.46■□□□□ 0.07
YHL050CP38721 PTC2YER089C 1395 nt15.33■□□□□ 0.04
YHL050CP38721 YOR139CYOR139C 393 nt15.31■□□□□ 0.04
YHL050CP38721 WWM1YFL010C 636 nt15.27■□□□□ 0.04
YHL050CP38721 MNP1YGL068W 585 nt15.2■□□□□ 0.02
YHL050CP38721 BUD23YCR047C 828 nt15.19■□□□□ 0.02
YHL050CP38721 RPP2BYDR382W 333 nt15.18■□□□□ 0.02
YHL050CP38721 HOM6YJR139C 1080 nt15.15■□□□□ 0.02
YHL050CP38721 BSC6YOL137W 1494 nt15.13■□□□□ 0.01
YHL050CP38721 YGR021WYGR021W 873 nt15.1■□□□□ 0.01
YHL050CP38721 SSA3YBL075C 1950 nt15.07■□□□□ 0
YHL050CP38721 NAB2YGL122C 1578 nt15.03■□□□□ -0
YHL050CP38721 NPL3YDR432W 1245 nt15.03■□□□□ -0
YHL050CP38721 FIS1YIL065C 468 nt14.97□□□□□ -0.01
YHL050CP38721 BDH2YAL061W 1254 nt14.97□□□□□ -0.01
YHL050CP38721 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.92□□□□□ -0.02
YHL050CP38721 RKM5YLR137W 1104 nt14.92□□□□□ -0.02
YHL050CP38721 FPR4YLR449W 1179 nt14.92□□□□□ -0.02
YHL050CP38721 DAL1YIR027C 1383 nt14.91□□□□□ -0.02
YHL050CP38721 INM2YDR287W 879 nt14.87□□□□□ -0.03
YHL050CP38721 YOL037CYOL037C 354 nt14.86□□□□□ -0.03
YHL050CP38721 YBL100CYBL100C 315 nt14.84□□□□□ -0.03
YHL050CP38721 PHO4YFR034C 939 nt14.81□□□□□ -0.04
YHL050CP38721 LSM3YLR438C-A 270 nt14.75□□□□□ -0.05
YHL050CP38721 FUN26YAL022C 1554 nt14.68□□□□□ -0.06
YHL050CP38721 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.65□□□□□ -0.06
YHL050CP38721 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.65□□□□□ -0.06
YHL050CP38721 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.65□□□□□ -0.06
YHL050CP38721 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.65□□□□□ -0.06
YHL050CP38721 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.65□□□□□ -0.06
YHL050CP38721 TRM9YML014W 840 nt14.62□□□□□ -0.07
YHL050CP38721 YLR281CYLR281C 468 nt14.54□□□□□ -0.08
YHL050CP38721 CCT6YDR188W 1641 nt14.49□□□□□ -0.09
YHL050CP38721 PUS2YGL063W 1113 nt14.48□□□□□ -0.09
YHL050CP38721 WHI5YOR083W 888 nt14.48□□□□□ -0.09
YHL050CP38721 YPS1YLR120C 1710 nt14.44□□□□□ -0.1
YHL050CP38721 YDR095CYDR095C 411 nt14.39□□□□□ -0.11
YHL050CP38721 ALF1YNL148C 765 nt14.38□□□□□ -0.11
YHL050CP38721 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt14.32□□□□□ -0.12
YHL050CP38721 YPR011CYPR011C 981 nt14.29□□□□□ -0.12
YHL050CP38721 SUF2tP(AGG)C 72 nt14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.5 ms