Protein–RNA interactions for Protein: Q12102

CFT2, Cleavage factor two protein 2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CFT2Q12102 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.48■■□□□ 1.35
CFT2Q12102 NOP1YDL014W 984 nt23.04■■□□□ 1.28
CFT2Q12102 NSR1YGR159C 1245 nt22.88■■□□□ 1.25
CFT2Q12102 YKL036CYKL036C 393 nt21.75■■□□□ 1.07
CFT2Q12102 YJL027CYJL027C 417 nt20.41■□□□□ 0.86
CFT2Q12102 Q0297Q0297 156 nt20.33■□□□□ 0.85
CFT2Q12102 SRX1YKL086W 384 nt20.13■□□□□ 0.81
CFT2Q12102 SCS3YGL126W 1143 nt20.03■□□□□ 0.8
CFT2Q12102 MDJ1YFL016C 1536 nt19.8■□□□□ 0.76
CFT2Q12102 YCR051WYCR051W 669 nt19.15■□□□□ 0.66
CFT2Q12102 YOL085CYOL085C 342 nt18.81■□□□□ 0.6
CFT2Q12102 PKP1YIL042C 1185 nt18.47■□□□□ 0.55
CFT2Q12102 SCJ1YMR214W 1134 nt18.41■□□□□ 0.54
CFT2Q12102 RPP1BYDL130W 321 nt18.25■□□□□ 0.51
CFT2Q12102 ATS1YAL020C 1002 nt18.08■□□□□ 0.48
CFT2Q12102 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.87■□□□□ 0.45
CFT2Q12102 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.87■□□□□ 0.45
CFT2Q12102 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.87■□□□□ 0.45
CFT2Q12102 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.87■□□□□ 0.45
CFT2Q12102 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.87■□□□□ 0.45
CFT2Q12102 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.87■□□□□ 0.45
CFT2Q12102 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.87■□□□□ 0.45
CFT2Q12102 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.87■□□□□ 0.45
CFT2Q12102 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.87■□□□□ 0.45
CFT2Q12102 CCC1YLR220W 969 nt17.74■□□□□ 0.43
CFT2Q12102 DBP2YNL112W 1641 nt17.72■□□□□ 0.43
CFT2Q12102 PET122YER153C 765 nt17.36■□□□□ 0.37
CFT2Q12102 SCR1SCR1 522 nt17.35■□□□□ 0.37
CFT2Q12102 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.1■□□□□ 0.33
CFT2Q12102 RRN5YLR141W 1092 nt16.94■□□□□ 0.3
CFT2Q12102 RVS167YDR388W 1449 nt16.82■□□□□ 0.28
CFT2Q12102 RTC3YHR087W 336 nt16.77■□□□□ 0.28
CFT2Q12102 RSB1YOR049C 1065 nt16.75■□□□□ 0.27
CFT2Q12102 YBR190WYBR190W 312 nt16.75■□□□□ 0.27
CFT2Q12102 PST2YDR032C 597 nt16.66■□□□□ 0.26
CFT2Q12102 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.59■□□□□ 0.25
CFT2Q12102 YDJ1YNL064C 1230 nt16.53■□□□□ 0.24
CFT2Q12102 SHR5YOL110W 714 nt16.34■□□□□ 0.21
CFT2Q12102 YKL097CYKL097C 411 nt16.28■□□□□ 0.2
CFT2Q12102 GAR1YHR089C 618 nt16.1■□□□□ 0.17
CFT2Q12102 SHU1YHL006C 453 nt15.85■□□□□ 0.13
CFT2Q12102 DEP1YAL013W 1218 nt15.72■□□□□ 0.11
CFT2Q12102 URN1YPR152C 1398 nt15.56■□□□□ 0.08
CFT2Q12102 TIR1YER011W 765 nt15.52■□□□□ 0.08
CFT2Q12102 YNL208WYNL208W 600 nt15.52■□□□□ 0.08
CFT2Q12102 YOR139CYOR139C 393 nt15.51■□□□□ 0.07
CFT2Q12102 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.47■□□□□ 0.07
CFT2Q12102 RPN10YHR200W 807 nt15.46■□□□□ 0.07
CFT2Q12102 NPL3YDR432W 1245 nt15.3■□□□□ 0.04
CFT2Q12102 OPI9YLR338W 858 nt15.22■□□□□ 0.03
CFT2Q12102 SSA1YAL005C 1929 nt15.21■□□□□ 0.03
CFT2Q12102 SSA3YBL075C 1950 nt15.2■□□□□ 0.02
CFT2Q12102 SRB2YHR041C 633 nt15.03■□□□□ -0
CFT2Q12102 YGR021WYGR021W 873 nt15.01□□□□□ -0.01
CFT2Q12102 SAH1YER043C 1350 nt14.99□□□□□ -0.01
CFT2Q12102 MNP1YGL068W 585 nt14.97□□□□□ -0.01
CFT2Q12102 HOM6YJR139C 1080 nt14.97□□□□□ -0.01
CFT2Q12102 WWM1YFL010C 636 nt14.93□□□□□ -0.02
CFT2Q12102 YOL037CYOL037C 354 nt14.93□□□□□ -0.02
CFT2Q12102 YJR018WYJR018W 363 nt14.89□□□□□ -0.03
CFT2Q12102 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.88□□□□□ -0.03
CFT2Q12102 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.88□□□□□ -0.03
CFT2Q12102 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.88□□□□□ -0.03
CFT2Q12102 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.88□□□□□ -0.03
CFT2Q12102 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.88□□□□□ -0.03
CFT2Q12102 PUN1YLR414C 792 nt14.8□□□□□ -0.04
CFT2Q12102 PUT4YOR348C 1884 nt14.78□□□□□ -0.04
CFT2Q12102 RPP2BYDR382W 333 nt14.75□□□□□ -0.05
CFT2Q12102 RKM5YLR137W 1104 nt14.74□□□□□ -0.05
CFT2Q12102 YJR120WYJR120W 351 nt14.72□□□□□ -0.05
CFT2Q12102 ARE1YCR048W 1833 nt14.69□□□□□ -0.06
CFT2Q12102 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.68□□□□□ -0.06
CFT2Q12102 PUS2YGL063W 1113 nt14.61□□□□□ -0.07
CFT2Q12102 YLR281CYLR281C 468 nt14.55□□□□□ -0.08
CFT2Q12102 PTC2YER089C 1395 nt14.52□□□□□ -0.08
CFT2Q12102 BDH2YAL061W 1254 nt14.52□□□□□ -0.09
CFT2Q12102 MOT3YMR070W 1473 nt14.5□□□□□ -0.09
CFT2Q12102 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.5□□□□□ -0.09
CFT2Q12102 LSM3YLR438C-A 270 nt14.44□□□□□ -0.1
CFT2Q12102 WHI5YOR083W 888 nt14.44□□□□□ -0.1
CFT2Q12102 POA1YBR022W 534 nt14.4□□□□□ -0.1
CFT2Q12102 BSC6YOL137W 1494 nt14.37□□□□□ -0.11
CFT2Q12102 INM2YDR287W 879 nt14.3□□□□□ -0.12
CFT2Q12102 NAB2YGL122C 1578 nt14.26□□□□□ -0.13
CFT2Q12102 BUD23YCR047C 828 nt14.24□□□□□ -0.13
CFT2Q12102 FMP45YDL222C 930 nt14.23□□□□□ -0.13
CFT2Q12102 YBL100CYBL100C 315 nt14.23□□□□□ -0.13
CFT2Q12102 TRM9YML014W 840 nt14.19□□□□□ -0.14
CFT2Q12102 DSK2YMR276W 1122 nt14.19□□□□□ -0.14
CFT2Q12102 FPR4YLR449W 1179 nt14.18□□□□□ -0.14
CFT2Q12102 YPR011CYPR011C 981 nt14.17□□□□□ -0.14
CFT2Q12102 DAL1YIR027C 1383 nt14.17□□□□□ -0.14
CFT2Q12102 IMP2'YIL154C 1041 nt14.13□□□□□ -0.15
CFT2Q12102 MRPL8YJL063C 717 nt14.13□□□□□ -0.15
CFT2Q12102 YCH1YGR203W 447 nt14.12□□□□□ -0.15
CFT2Q12102 YLR236CYLR236C 324 nt14.09□□□□□ -0.15
CFT2Q12102 FUN26YAL022C 1554 nt14.09□□□□□ -0.15
CFT2Q12102 FIS1YIL065C 468 nt14.07□□□□□ -0.16
CFT2Q12102 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt14.05□□□□□ -0.16
CFT2Q12102 PHO4YFR034C 939 nt14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.4 ms