Protein–RNA interactions for Protein: P35999

OCT1, Mitochondrial intermediate peptidase, yeastyeast

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
OCT1P35999 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.67■■□□□ 1.38
OCT1P35999 NOP1YDL014W 984 nt23.23■■□□□ 1.31
OCT1P35999 NSR1YGR159C 1245 nt23.1■■□□□ 1.29
OCT1P35999 YKL036CYKL036C 393 nt21.88■■□□□ 1.09
OCT1P35999 YJL027CYJL027C 417 nt20.52■□□□□ 0.88
OCT1P35999 Q0297Q0297 156 nt20.47■□□□□ 0.87
OCT1P35999 SRX1YKL086W 384 nt20.28■□□□□ 0.84
OCT1P35999 SCS3YGL126W 1143 nt20.14■□□□□ 0.81
OCT1P35999 MDJ1YFL016C 1536 nt20.02■□□□□ 0.8
OCT1P35999 YCR051WYCR051W 669 nt19.3■□□□□ 0.68
OCT1P35999 YOL085CYOL085C 342 nt18.91■□□□□ 0.62
OCT1P35999 PKP1YIL042C 1185 nt18.58■□□□□ 0.56
OCT1P35999 SCJ1YMR214W 1134 nt18.47■□□□□ 0.55
OCT1P35999 RPP1BYDL130W 321 nt18.38■□□□□ 0.53
OCT1P35999 ATS1YAL020C 1002 nt18.15■□□□□ 0.5
OCT1P35999 TRN1tP(UGG)A 72 nt18.03■□□□□ 0.48
OCT1P35999 SUF9tP(UGG)F 72 nt18.03■□□□□ 0.48
OCT1P35999 SUF8tP(UGG)H 72 nt18.03■□□□□ 0.48
OCT1P35999 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt18.03■□□□□ 0.48
OCT1P35999 SUF7tP(UGG)M 72 nt18.03■□□□□ 0.48
OCT1P35999 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt18.03■□□□□ 0.48
OCT1P35999 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt18.03■□□□□ 0.48
OCT1P35999 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt18.03■□□□□ 0.48
OCT1P35999 SUF11tP(UGG)O2 72 nt18.03■□□□□ 0.48
OCT1P35999 CCC1YLR220W 969 nt17.89■□□□□ 0.45
OCT1P35999 DBP2YNL112W 1641 nt17.89■□□□□ 0.45
OCT1P35999 PET122YER153C 765 nt17.48■□□□□ 0.39
OCT1P35999 SCR1SCR1 522 nt17.48■□□□□ 0.39
OCT1P35999 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.23■□□□□ 0.35
OCT1P35999 RRN5YLR141W 1092 nt17.04■□□□□ 0.32
OCT1P35999 RVS167YDR388W 1449 nt17■□□□□ 0.31
OCT1P35999 YBR190WYBR190W 312 nt16.97■□□□□ 0.31
OCT1P35999 RSB1YOR049C 1065 nt16.85■□□□□ 0.29
OCT1P35999 RTC3YHR087W 336 nt16.81■□□□□ 0.28
OCT1P35999 PST2YDR032C 597 nt16.72■□□□□ 0.27
OCT1P35999 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.69■□□□□ 0.26
OCT1P35999 YDJ1YNL064C 1230 nt16.66■□□□□ 0.26
OCT1P35999 SHR5YOL110W 714 nt16.5■□□□□ 0.23
OCT1P35999 YKL097CYKL097C 411 nt16.34■□□□□ 0.21
OCT1P35999 GAR1YHR089C 618 nt16.22■□□□□ 0.19
OCT1P35999 SHU1YHL006C 453 nt15.93■□□□□ 0.14
OCT1P35999 DEP1YAL013W 1218 nt15.87■□□□□ 0.13
OCT1P35999 URN1YPR152C 1398 nt15.75■□□□□ 0.11
OCT1P35999 YNL208WYNL208W 600 nt15.68■□□□□ 0.1
OCT1P35999 TIR1YER011W 765 nt15.66■□□□□ 0.1
OCT1P35999 RPN10YHR200W 807 nt15.65■□□□□ 0.1
OCT1P35999 YOR139CYOR139C 393 nt15.56■□□□□ 0.08
OCT1P35999 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.55■□□□□ 0.08
OCT1P35999 OPI9YLR338W 858 nt15.41■□□□□ 0.06
OCT1P35999 NPL3YDR432W 1245 nt15.38■□□□□ 0.05
OCT1P35999 SSA1YAL005C 1929 nt15.34■□□□□ 0.05
OCT1P35999 SAH1YER043C 1350 nt15.17■□□□□ 0.02
OCT1P35999 SRB2YHR041C 633 nt15.14■□□□□ 0.01
OCT1P35999 YGR021WYGR021W 873 nt15.13■□□□□ 0.01
OCT1P35999 SSA3YBL075C 1950 nt15.09■□□□□ 0.01
OCT1P35999 HOM6YJR139C 1080 nt15.07■□□□□ 0
OCT1P35999 MNP1YGL068W 585 nt15.06■□□□□ 0
OCT1P35999 YJR018WYJR018W 363 nt15.06■□□□□ 0
OCT1P35999 WWM1YFL010C 636 nt15.04■□□□□ -0
OCT1P35999 YOL037CYOL037C 354 nt15.03■□□□□ -0
OCT1P35999 PUT4YOR348C 1884 nt14.98□□□□□ -0.01
OCT1P35999 PUN1YLR414C 792 nt14.98□□□□□ -0.01
OCT1P35999 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.93□□□□□ -0.02
OCT1P35999 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.93□□□□□ -0.02
OCT1P35999 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.93□□□□□ -0.02
OCT1P35999 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.93□□□□□ -0.02
OCT1P35999 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.93□□□□□ -0.02
OCT1P35999 RPP2BYDR382W 333 nt14.91□□□□□ -0.02
OCT1P35999 ARE1YCR048W 1833 nt14.87□□□□□ -0.03
OCT1P35999 YJR120WYJR120W 351 nt14.86□□□□□ -0.03
OCT1P35999 RKM5YLR137W 1104 nt14.85□□□□□ -0.03
OCT1P35999 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.8□□□□□ -0.04
OCT1P35999 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.7□□□□□ -0.06
OCT1P35999 PTC2YER089C 1395 nt14.7□□□□□ -0.06
OCT1P35999 PUS2YGL063W 1113 nt14.67□□□□□ -0.06
OCT1P35999 BDH2YAL061W 1254 nt14.67□□□□□ -0.06
OCT1P35999 YLR281CYLR281C 468 nt14.63□□□□□ -0.07
OCT1P35999 POA1YBR022W 534 nt14.59□□□□□ -0.07
OCT1P35999 LSM3YLR438C-A 270 nt14.58□□□□□ -0.08
OCT1P35999 MOT3YMR070W 1473 nt14.54□□□□□ -0.08
OCT1P35999 WHI5YOR083W 888 nt14.52□□□□□ -0.09
OCT1P35999 INM2YDR287W 879 nt14.47□□□□□ -0.09
OCT1P35999 NAB2YGL122C 1578 nt14.44□□□□□ -0.1
OCT1P35999 BUD23YCR047C 828 nt14.44□□□□□ -0.1
OCT1P35999 YBL100CYBL100C 315 nt14.4□□□□□ -0.1
OCT1P35999 BSC6YOL137W 1494 nt14.38□□□□□ -0.11
OCT1P35999 FPR4YLR449W 1179 nt14.35□□□□□ -0.11
OCT1P35999 DAL1YIR027C 1383 nt14.34□□□□□ -0.11
OCT1P35999 TRM9YML014W 840 nt14.33□□□□□ -0.12
OCT1P35999 FMP45YDL222C 930 nt14.29□□□□□ -0.12
OCT1P35999 DSK2YMR276W 1122 nt14.27□□□□□ -0.13
OCT1P35999 FIS1YIL065C 468 nt14.25□□□□□ -0.13
OCT1P35999 IMP2'YIL154C 1041 nt14.24□□□□□ -0.13
OCT1P35999 FUN26YAL022C 1554 nt14.23□□□□□ -0.13
OCT1P35999 YPR011CYPR011C 981 nt14.21□□□□□ -0.13
OCT1P35999 PHO4YFR034C 939 nt14.19□□□□□ -0.14
OCT1P35999 YCH1YGR203W 447 nt14.19□□□□□ -0.14
OCT1P35999 MRPL8YJL063C 717 nt14.17□□□□□ -0.14
OCT1P35999 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt14.17□□□□□ -0.14
OCT1P35999 YLR236CYLR236C 324 nt14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.4 ms