Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 MED25-207ENST00000595185 760 ntTSL 1 (best)15.17■□□□□ 0.027e-10■■■■□ 23.1
RBM22Q9NW64 ACSM3-213ENST00000568235 558 ntTSL 412.05□□□□□ -0.487e-10■■■■□ 23.1
RBM22Q9NW64 ACSM3-205ENST00000561584 561 ntTSL 411.62□□□□□ -0.557e-10■■■■□ 23.1
RBM22Q9NW64 MED25-209ENST00000612791 881 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.667e-10■■■■□ 23.1
RBM22Q9NW64 ACSM3-202ENST00000440284 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.747e-10■■■■□ 23.1
RBM22Q9NW64 ACSM3-209ENST00000564701 756 ntTSL 39.03□□□□□ -0.967e-10■■■■□ 23.1
RBM22Q9NW64 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.757e-10■■■■□ 23.1
RBM22Q9NW64 TARS-210ENST00000508361 2481 ntTSL 29.8□□□□□ -0.842e-7■■■■□ 23.1
RBM22Q9NW64 TARS-204ENST00000502553 2534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.882e-7■■■■□ 23.1
RBM22Q9NW64 TARS-202ENST00000455217 2523 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.932e-7■■■■□ 23.1
RBM22Q9NW64 TARS-201ENST00000265112 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -12e-7■■■■□ 23.1
RBM22Q9NW64 TARS-209ENST00000507716 2475 ntTSL 28.13□□□□□ -1.112e-7■■■■□ 23.1
RBM22Q9NW64 XPO1-208ENST00000437159 537 ntTSL 51.9□□□□□ -2.112e-6■■■■□ 23.1
RBM22Q9NW64 HNRNPH1-221ENST00000513230 248 ntTSL 323.21■■□□□ 1.319e-27■■■■□ 23.1
RBM22Q9NW64 NCOR2-213ENST00000448614 582 ntTSL 315.45■□□□□ 0.067e-7■■■■□ 23.1
RBM22Q9NW64 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.217e-7■■■■□ 23.1
RBM22Q9NW64 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.237e-7■■■■□ 23.1
RBM22Q9NW64 IL17RB-201ENST00000288167 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.46e-10■■■■□ 23.1
RBM22Q9NW64 IL17RB-203ENST00000494338 1048 ntTSL 512.11□□□□□ -0.476e-10■■■■□ 23.1
RBM22Q9NW64 IL17RB-202ENST00000475124 2822 ntTSL 29.81□□□□□ -0.846e-10■■■■□ 23.1
RBM22Q9NW64 NUP85-201ENST00000245544 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.223e-6■■■■□ 23.1
RBM22Q9NW64 NUP85-211ENST00000579324 2010 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.643e-6■■■■□ 23.1
RBM22Q9NW64 NUP85-220ENST00000583070 907 ntTSL 510.87□□□□□ -0.673e-6■■■■□ 23.1
RBM22Q9NW64 NUP85-210ENST00000579298 1890 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.763e-6■■■■□ 23.1
RBM22Q9NW64 NUP85-206ENST00000577645 869 ntTSL 39.76□□□□□ -0.853e-6■■■■□ 23.1
RBM22Q9NW64 NUP85-216ENST00000581104 2233 ntTSL 29.57□□□□□ -0.883e-6■■■■□ 23.1
RBM22Q9NW64 NUP85-212ENST00000579557 817 ntTSL 59.55□□□□□ -0.883e-6■■■■□ 23.1
RBM22Q9NW64 NUP85-208ENST00000578830 922 ntTSL 58.64□□□□□ -1.033e-6■■■■□ 23.1
RBM22Q9NW64 MYH9-201ENST00000216181 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.551e-6■■■■□ 23
RBM22Q9NW64 NAP1L1-222ENST00000551992 1074 ntTSL 524.41■■□□□ 1.52e-6■■■■□ 23
RBM22Q9NW64 NAP1L1-214ENST00000548273 818 ntTSL 312.81□□□□□ -0.362e-6■■■■□ 23
RBM22Q9NW64 NAP1L1-218ENST00000550934 851 ntTSL 51.86□□□□□ -2.112e-6■■■■□ 23
RBM22Q9NW64 MTA1-214ENST00000494026 852 ntTSL 517.9■□□□□ 0.461e-6■■■■□ 23
RBM22Q9NW64 MTA1-216ENST00000498644 871 ntTSL 216.79■□□□□ 0.281e-6■■■■□ 23
RBM22Q9NW64 MTA1-204ENST00000424723 904 ntTSL 1 (best)15.24■□□□□ 0.031e-6■■■■□ 23
RBM22Q9NW64 PABPC4-217ENST00000492519 323 ntTSL 21.9□□□□□ -2.118e-14■■■■□ 23
RBM22Q9NW64 STAT3-214ENST00000590776 1483 nt18.82■□□□□ 0.65e-11■■■■□ 23
RBM22Q9NW64 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.265e-11■■■■□ 23
RBM22Q9NW64 STAT3-212ENST00000588065 571 ntTSL 414.82□□□□□ -0.045e-11■■■■□ 23
RBM22Q9NW64 STAT3-202ENST00000389272 2615 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.225e-11■■■■□ 23
RBM22Q9NW64 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.265e-11■■■■□ 23
RBM22Q9NW64 STAT3-213ENST00000588969 2772 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.455e-11■■■■□ 23
RBM22Q9NW64 STAT3-211ENST00000585517 3319 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.575e-11■■■■□ 23
RBM22Q9NW64 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.53e-8■■■■□ 23
RBM22Q9NW64 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.213e-8■■■■□ 23
RBM22Q9NW64 GSE1-212ENST00000562659 756 ntTSL 213.23□□□□□ -0.296e-8■■■■□ 23
RBM22Q9NW64 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.742e-6■■■■□ 22.9
RBM22Q9NW64 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.182e-9■■■■□ 22.9
RBM22Q9NW64 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.862e-9■■■■□ 22.9
RBM22Q9NW64 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.462e-9■■■■□ 22.9
RBM22Q9NW64 SLC6A8-207ENST00000466243 544 ntTSL 213.73□□□□□ -0.212e-9■■■■□ 22.9
RBM22Q9NW64 SLC6A6-203ENST00000610642 1983 ntTSL 219.3■□□□□ 0.684e-10■■■■□ 22.9
RBM22Q9NW64 SLC6A6-210ENST00000622186 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.434e-10■■■■□ 22.9
RBM22Q9NW64 SLC6A6-204ENST00000613060 6526 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.464e-10■■■■□ 22.9
RBM22Q9NW64 SLC6A6-207ENST00000618278 6401 ntTSL 511.3□□□□□ -0.64e-10■■■■□ 22.9
RBM22Q9NW64 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.84e-7■■■■□ 22.8
RBM22Q9NW64 PFKL-206ENST00000467315 1947 ntTSL 219.78■□□□□ 0.767e-8■■■■□ 22.8
RBM22Q9NW64 PFKL-211ENST00000498841 3122 ntTSL 1 (best)16.89■□□□□ 0.297e-8■■■■□ 22.8
RBM22Q9NW64 ILF3-223ENST00000593061 475 ntTSL 319.26■□□□□ 0.675e-13■■■■□ 22.8
RBM22Q9NW64 AP002990.1-201ENST00000526409 1954 ntTSL 517.95■□□□□ 0.466e-10■■■■□ 22.8
RBM22Q9NW64 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.046e-10■■■■□ 22.8
RBM22Q9NW64 EEF1G-203ENST00000525340 2496 ntTSL 1 (best)14.85□□□□□ -0.036e-10■■■■□ 22.8
RBM22Q9NW64 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.086e-10■■■■□ 22.8
RBM22Q9NW64 USP3-221ENST00000561442 542 ntTSL 514.52□□□□□ -0.096e-10■■■■□ 22.8
RBM22Q9NW64 USP3-205ENST00000557884 958 ntTSL 314.52□□□□□ -0.096e-10■■■■□ 22.8
RBM22Q9NW64 SFPQ-207ENST00000471991 440 ntTSL 214□□□□□ -0.176e-10■■■■□ 22.8
RBM22Q9NW64 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.276e-10■■■■□ 22.8
RBM22Q9NW64 ILF3-220ENST00000590869 531 ntTSL 512.43□□□□□ -0.425e-13■■■■□ 22.8
RBM22Q9NW64 USP3-202ENST00000380324 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.456e-10■■■■□ 22.8
RBM22Q9NW64 USP3-203ENST00000538686 2077 ntTSL 1 (best)11.73□□□□□ -0.536e-10■■■■□ 22.8
RBM22Q9NW64 USP3-219ENST00000561326 543 ntTSL 410.52□□□□□ -0.736e-10■■■■□ 22.8
RBM22Q9NW64 USP3-206ENST00000558157 2439 ntTSL 1 (best)10.43□□□□□ -0.746e-10■■■■□ 22.8
RBM22Q9NW64 USP3-216ENST00000559873 584 ntTSL 510.23□□□□□ -0.776e-10■■■■□ 22.8
RBM22Q9NW64 USP3-208ENST00000558285 1742 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.016e-10■■■■□ 22.8
RBM22Q9NW64 USP3-217ENST00000560070 545 ntTSL 48.67□□□□□ -1.026e-10■■■■□ 22.8
RBM22Q9NW64 USP3-211ENST00000559257 2217 ntTSL 57.91□□□□□ -1.146e-10■■■■□ 22.8
RBM22Q9NW64 USP3-201ENST00000268049 5311 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.156e-10■■■■□ 22.8
RBM22Q9NW64 USP3-210ENST00000559192 5499 ntTSL 1 (best)7.18□□□□□ -1.266e-10■■■■□ 22.8
RBM22Q9NW64 SFPQ-205ENST00000468598 2835 ntTSL 1 (best)7□□□□□ -1.296e-10■■■■□ 22.8
RBM22Q9NW64 SFPQ-203ENST00000466213 1431 ntTSL 1 (best)6.01□□□□□ -1.456e-10■■■■□ 22.8
RBM22Q9NW64 USP3-215ENST00000559771 561 ntTSL 45.72□□□□□ -1.496e-10■■■■□ 22.8
RBM22Q9NW64 SFPQ-208ENST00000485365 693 ntTSL 24.69□□□□□ -1.666e-10■■■■□ 22.8
RBM22Q9NW64 SFPQ-204ENST00000466745 662 ntTSL 24.69□□□□□ -1.666e-10■■■■□ 22.8
RBM22Q9NW64 SFPQ-210ENST00000490668 434 ntTSL 24.31□□□□□ -1.726e-10■■■■□ 22.8
RBM22Q9NW64 SFPQ-209ENST00000485454 339 ntTSL 20.74□□□□□ -2.296e-10■■■■□ 22.8
RBM22Q9NW64 RFNG-205ENST00000580793 1755 ntTSL 1 (best)17.74■□□□□ 0.433e-7■■■■□ 22.8
RBM22Q9NW64 RFNG-209ENST00000583784 2886 nt14.77□□□□□ -0.053e-7■■■■□ 22.8
RBM22Q9NW64 RFNG-212ENST00000584838 721 ntTSL 514.32□□□□□ -0.123e-7■■■■□ 22.8
RBM22Q9NW64 HSP90AB1-202ENST00000371554 2674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.768e-8■■■■□ 22.8
RBM22Q9NW64 HSP90AB1-203ENST00000371646 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.888e-8■■■■□ 22.8
RBM22Q9NW64 HSP90AB1-201ENST00000353801 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.928e-8■■■■□ 22.8
RBM22Q9NW64 HSP90AB1-204ENST00000620073 2644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.988e-8■■■■□ 22.8
RBM22Q9NW64 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.13e-6■■■■□ 22.8
RBM22Q9NW64 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.083e-6■■■■□ 22.8
RBM22Q9NW64 KDM3A-216ENST00000542128 4311 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.453e-6■■■■□ 22.8
RBM22Q9NW64 KDM3A-205ENST00000441719 8741 ntTSL 211.08□□□□□ -0.643e-6■■■■□ 22.8
RBM22Q9NW64 KDM3A-202ENST00000409064 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.743e-6■■■■□ 22.8
RBM22Q9NW64 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.571e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.831e-6■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 LNPK-210ENST00000483230 252 ntTSL 526.02■■□□□ 1.761e-5■■■■□ 22.7
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