RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483230.5

LNPK-210, Transcript of lunapark, ER junction formation factor, humanhuman

TSL 5

Gene LNPK, Length 252 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPK-210ENST00000483230 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.19■■■■■ 7.71
LNPK-210ENST00000483230 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.24■■■■■ 6.59
LNPK-210ENST00000483230 ABCC9O60706 1549 aa55.43■■■■■ 6.46
LNPK-210ENST00000483230 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.17■■■■■ 6.1
LNPK-210ENST00000483230 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.08■■■■■ 6.09
LNPK-210ENST00000483230 NACADO15069 1562 aa53.04■■■■■ 6.08
LNPK-210ENST00000483230 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.64■■■■■ 6.02
LNPK-210ENST00000483230 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.54■■■■■ 6
LNPK-210ENST00000483230 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.27■■■■■ 5.96
LNPK-210ENST00000483230 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.81■■■■■ 5.88
LNPK-210ENST00000483230 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.81■■■■■ 5.88
LNPK-210ENST00000483230 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.51■■■■■ 5.84
LNPK-210ENST00000483230 SCRIBQ14160 1630 aa51.3■■■■■ 5.8
LNPK-210ENST00000483230 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.23■■■■■ 5.79
LNPK-210ENST00000483230 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.02■■■■■ 5.76
LNPK-210ENST00000483230 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.21■■■■■ 5.63
LNPK-210ENST00000483230 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.09■■■■■ 5.61
LNPK-210ENST00000483230 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.86■■■■■ 5.57
LNPK-210ENST00000483230 SMARCA4P51532 1647 aa49.05■■■■■ 5.44
LNPK-210ENST00000483230 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49■■■■■ 5.43
LNPK-210ENST00000483230 NCAPD3P42695 1498 aa48.99■■■■■ 5.43
LNPK-210ENST00000483230 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.93■■■■■ 5.42
LNPK-210ENST00000483230 SMARCA2P51531 1590 aa48.85■■■■■ 5.41
LNPK-210ENST00000483230 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.67■■■■■ 5.38
LNPK-210ENST00000483230 HMGXB3Q12766 1538 aa48.65■■■■■ 5.38
LNPK-210ENST00000483230 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.6■■■■■ 5.37
LNPK-210ENST00000483230 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.52■■■■■ 5.36
LNPK-210ENST00000483230 WIZO95785 1651 aa48.09■■■■■ 5.29
LNPK-210ENST00000483230 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.05■■■■■ 5.28
LNPK-210ENST00000483230 NESP48681 1621 aa47.84■■■■■ 5.25
LNPK-210ENST00000483230 ERCC6Q03468 1493 aa47.84■■■■■ 5.25
LNPK-210ENST00000483230 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.7■■■■■ 5.23
LNPK-210ENST00000483230 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.59■■■■■ 5.21
LNPK-210ENST00000483230 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.57■■■■■ 5.21
LNPK-210ENST00000483230 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.47■■■■■ 5.19
LNPK-210ENST00000483230 CUX2O14529 1486 aa47.44■■■■■ 5.18
LNPK-210ENST00000483230 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.19■■■■■ 5.14
LNPK-210ENST00000483230 CFTRP13569 1480 aa47.18■■■■■ 5.14
LNPK-210ENST00000483230 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.13■■■■■ 5.14
LNPK-210ENST00000483230 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.08■■■■■ 5.13
LNPK-210ENST00000483230 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.97■■■■■ 5.11
LNPK-210ENST00000483230 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.94■■■■■ 5.1
LNPK-210ENST00000483230 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.94■■■■■ 5.1
LNPK-210ENST00000483230 WDR62O43379 1518 aa46.76■■■■■ 5.08
LNPK-210ENST00000483230 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.66■■■■■ 5.06
LNPK-210ENST00000483230 PRDM2Q13029 1718 aa46.62■■■■■ 5.05
LNPK-210ENST00000483230 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.49■■■■■ 5.03
LNPK-210ENST00000483230 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.45■■■■■ 5.03
LNPK-210ENST00000483230 ABCC8Q09428 1581 aa46.22■■■■■ 4.99
LNPK-210ENST00000483230 TOPBP1Q92547 1522 aa46.17■■■■■ 4.98
LNPK-210ENST00000483230 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.06■■■■■ 4.96
LNPK-210ENST00000483230 IFT140Q96RY7 1462 aa45.99■■■■■ 4.95
LNPK-210ENST00000483230 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.77■■■■■ 4.92
LNPK-210ENST00000483230 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.75■■■■■ 4.91
LNPK-210ENST00000483230 CUX1P39880 1505 aa45.67■■■■■ 4.9
LNPK-210ENST00000483230 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.64■■■■■ 4.9
LNPK-210ENST00000483230 SOGA1O94964 1423 aa45.63■■■■■ 4.9
LNPK-210ENST00000483230 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.59■■■■■ 4.89
LNPK-210ENST00000483230 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.57■■■■■ 4.89
LNPK-210ENST00000483230 OSCARQ8IYS5 282 aa45.53■■■■■ 4.88
LNPK-210ENST00000483230 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.52■■■■■ 4.882e-7■■■■■ 31.4
LNPK-210ENST00000483230 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.51■■■■■ 4.88
LNPK-210ENST00000483230 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.4■■■■■ 4.86
LNPK-210ENST00000483230 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.33■■■■■ 4.85
LNPK-210ENST00000483230 WDR97A6NE52 1622 aa45.3■■■■■ 4.84
LNPK-210ENST00000483230 TOP2BQ02880 1626 aa45.19■■■■■ 4.83
LNPK-210ENST00000483230 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.15■■■■■ 4.82
LNPK-210ENST00000483230 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.15■■■■■ 4.82
LNPK-210ENST00000483230 SYNJ1O43426 1573 aa45.13■■■■■ 4.82
LNPK-210ENST00000483230 FBLN2P98095 1184 aa45.12■■■■■ 4.81
LNPK-210ENST00000483230 GRIN2BQ13224 1484 aa45.1■■■■■ 4.81
LNPK-210ENST00000483230 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.06■■■■■ 4.8
LNPK-210ENST00000483230 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.04■■■■■ 4.8
LNPK-210ENST00000483230 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45■■■■■ 4.79
LNPK-210ENST00000483230 CHD1O14646 1710 aa44.97■■■■■ 4.79
LNPK-210ENST00000483230 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.96■■■■■ 4.79
LNPK-210ENST00000483230 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.92■■■■■ 4.78
LNPK-210ENST00000483230 PBRM1Q86U86 1689 aa44.85■■■■■ 4.77
LNPK-210ENST00000483230 SYNJ2O15056 1496 aa44.84■■■■■ 4.77
LNPK-210ENST00000483230 TRIM41Q8WV44 630 aa44.78■■■■■ 4.76
LNPK-210ENST00000483230 ARHGEF11O15085 1522 aa44.65■■■■■ 4.74
LNPK-210ENST00000483230 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.64■■■■■ 4.74
LNPK-210ENST00000483230 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.64■■■■■ 4.74
LNPK-210ENST00000483230 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.64■■■■■ 4.74
LNPK-210ENST00000483230 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.6■■■■■ 4.73
LNPK-210ENST00000483230 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.54■■■■■ 4.72
LNPK-210ENST00000483230 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.54■■■■■ 4.72
LNPK-210ENST00000483230 ADAMTS12P58397 1594 aa44.52■■■■■ 4.72
LNPK-210ENST00000483230 GRIN2AQ12879 1464 aa44.5■■■■■ 4.71
LNPK-210ENST00000483230 KIF27Q86VH2 1401 aa44.43■■■■■ 4.7
LNPK-210ENST00000483230 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.38■■■■■ 4.7
LNPK-210ENST00000483230 NUP160Q12769 1436 aa44.32■■■■■ 4.68
LNPK-210ENST00000483230 IGF1RP08069 1367 aa44.31■■■■■ 4.68
LNPK-210ENST00000483230 ARAP1Q96P48 1450 aa44.26■■■■■ 4.68
LNPK-210ENST00000483230 CEP170Q5SW79 1584 aa44.23■■■■■ 4.67
LNPK-210ENST00000483230 CUL7Q14999 1698 aa44.09■■■■■ 4.65
LNPK-210ENST00000483230 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.04■■■■■ 4.64
LNPK-210ENST00000483230 JPH4Q96JJ6 628 aa43.97■■■■■ 4.63
LNPK-210ENST00000483230 SHROOM2Q13796 1616 aa43.95■■■■■ 4.63
LNPK-210ENST00000483230 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.88■■■■■ 4.61
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