RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551992.5

NAP1L1-222, Transcript of nucleosome assembly protein 1 like 1, human

TSL 5

Gene NAP1L1, Length 1,074 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NAP1L1-222	ENST00000551992	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		59.27	■■■■■ 7.08
NAP1L1-222	ENST00000551992	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		52.81	■■■■■ 6.04
NAP1L1-222	ENST00000551992	ABCC9	O60706	1549 aa		51.69	■■■■■ 5.87
NAP1L1-222	ENST00000551992	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		49.7	■■■■■ 5.55
NAP1L1-222	ENST00000551992	NACAD	O15069	1562 aa		49.62	■■■■■ 5.53
NAP1L1-222	ENST00000551992	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		49.42	■■■■■ 5.5
NAP1L1-222	ENST00000551992	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	49.38	■■■■■ 5.5
NAP1L1-222	ENST00000551992	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		49.29	■■■■■ 5.48
NAP1L1-222	ENST00000551992	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		49.04	■■■■■ 5.44
NAP1L1-222	ENST00000551992	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		48.67	■■■■■ 5.38
NAP1L1-222	ENST00000551992	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		48.44	■■■■■ 5.34
NAP1L1-222	ENST00000551992	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		48.25	■■■■■ 5.31
NAP1L1-222	ENST00000551992	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	48.22	■■■■■ 5.31
NAP1L1-222	ENST00000551992	SCRIB	Q14160	1630 aa		48.15	■■■■■ 5.3
NAP1L1-222	ENST00000551992	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		47.71	■■■■■ 5.23
NAP1L1-222	ENST00000551992	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	46.95	■■■■■ 5.11
NAP1L1-222	ENST00000551992	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		46.79	■■■■■ 5.08
NAP1L1-222	ENST00000551992	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		46.58	■■■■■ 5.05
NAP1L1-222	ENST00000551992	SMARCA4	P51532	1647 aa		46.06	■■■■■ 4.96
NAP1L1-222	ENST00000551992	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	45.95	■■■■■ 4.95
NAP1L1-222	ENST00000551992	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		45.78	■■■■■ 4.92
NAP1L1-222	ENST00000551992	NCAPD3	P42695	1498 aa		45.75	■■■■■ 4.91
NAP1L1-222	ENST00000551992	SMARCA2	P51531	1590 aa		45.74	■■■■■ 4.91
NAP1L1-222	ENST00000551992	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		45.68	■■■■■ 4.9
NAP1L1-222	ENST00000551992	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		45.6	■■■■■ 4.89
NAP1L1-222	ENST00000551992	HMGXB3	Q12766	1538 aa		45.58	■■■■■ 4.89
NAP1L1-222	ENST00000551992	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	45.4	■■■■■ 4.86
NAP1L1-222	ENST00000551992	WIZ	O95785	1651 aa		45.21	■■■■■ 4.83
NAP1L1-222	ENST00000551992	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	45.09	■■■■■ 4.81
NAP1L1-222	ENST00000551992	NES	P48681	1621 aa		44.72	■■■■■ 4.75
NAP1L1-222	ENST00000551992	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	44.72	■■■■■ 4.75
NAP1L1-222	ENST00000551992	CUX2	O14529	1486 aa		44.66	■■■■■ 4.74
NAP1L1-222	ENST00000551992	ERCC6	Q03468	1493 aa		44.64	■■■■■ 4.74
NAP1L1-222	ENST00000551992	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		44.62	■■■■■ 4.73
NAP1L1-222	ENST00000551992	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		44.6	■■■■■ 4.73
NAP1L1-222	ENST00000551992	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		44.39	■■■■■ 4.7
NAP1L1-222	ENST00000551992	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		44.26	■■■■■ 4.68
NAP1L1-222	ENST00000551992	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		44.24	■■■■■ 4.67
NAP1L1-222	ENST00000551992	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		44.15	■■■■■ 4.66
NAP1L1-222	ENST00000551992	CFTR	P13569	1480 aa		44.14	■■■■■ 4.66
NAP1L1-222	ENST00000551992	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	44.13	■■■■■ 4.65
NAP1L1-222	ENST00000551992	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		43.92	■■■■■ 4.62
NAP1L1-222	ENST00000551992	PRDM2	Q13029	1718 aa		43.92	■■■■■ 4.62
NAP1L1-222	ENST00000551992	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		43.89	■■■■■ 4.62
NAP1L1-222	ENST00000551992	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		43.85	■■■■■ 4.61
NAP1L1-222	ENST00000551992	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	43.8	■■■■■ 4.6
NAP1L1-222	ENST00000551992	WDR62	O43379	1518 aa		43.73	■■■■■ 4.59
NAP1L1-222	ENST00000551992	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	43.52	■■■■■ 4.56
NAP1L1-222	ENST00000551992	TOPBP1	Q92547	1522 aa		43.22	■■■■■ 4.51
NAP1L1-222	ENST00000551992	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		43.18	■■■■■ 4.5
NAP1L1-222	ENST00000551992	ABCC8	Q09428	1581 aa		43.17	■■■■■ 4.5
NAP1L1-222	ENST00000551992	IFT140	Q96RY7	1462 aa		42.95	■■■■■ 4.47
NAP1L1-222	ENST00000551992	CUX1	P39880	1505 aa		42.87	■■■■■ 4.45
NAP1L1-222	ENST00000551992	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	42.85	■■■■■ 4.45
NAP1L1-222	ENST00000551992	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	42.8	■■■■■ 4.44
NAP1L1-222	ENST00000551992	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	42.79	■■■■■ 4.44
NAP1L1-222	ENST00000551992	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		42.74	■■■■■ 4.43
NAP1L1-222	ENST00000551992	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	42.67	■■■■■ 4.42
NAP1L1-222	ENST00000551992	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		42.65	■■■■■ 4.42
NAP1L1-222	ENST00000551992	SOGA1	O94964	1423 aa		42.62	■■■■■ 4.41
NAP1L1-222	ENST00000551992	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		42.53	■■■■■ 4.4
NAP1L1-222	ENST00000551992	TRIM41	Q8WV44	630 aa		42.53	■■■■■ 4.4
NAP1L1-222	ENST00000551992	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	42.52	■■■■■ 4.4
NAP1L1-222	ENST00000551992	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		42.51	■■■■■ 4.4
NAP1L1-222	ENST00000551992	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	42.5	■■■■■ 4.39	2e-15	■■■□□ 15
NAP1L1-222	ENST00000551992	TOP2B	Q02880	1626 aa		42.49	■■■■■ 4.39
NAP1L1-222	ENST00000551992	SYNJ1	O43426	1573 aa		42.48	■■■■■ 4.39
NAP1L1-222	ENST00000551992	WDR97	A6NE52	1622 aa		42.47	■■■■■ 4.39
NAP1L1-222	ENST00000551992	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	42.39	■■■■■ 4.38
NAP1L1-222	ENST00000551992	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		42.3	■■■■■ 4.36
NAP1L1-222	ENST00000551992	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		42.2	■■■■■ 4.35
NAP1L1-222	ENST00000551992	CHD1	O14646	1710 aa		42.17	■■■■■ 4.34
NAP1L1-222	ENST00000551992	GRIN2B	Q13224	1484 aa		42.17	■■■■■ 4.34
NAP1L1-222	ENST00000551992	PBRM1	Q86U86	1689 aa		42.16	■■■■■ 4.34
NAP1L1-222	ENST00000551992	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		42.15	■■■■■ 4.34
NAP1L1-222	ENST00000551992	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		42.14	■■■■■ 4.34
NAP1L1-222	ENST00000551992	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	42.08	■■■■■ 4.33
NAP1L1-222	ENST00000551992	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		42.01	■■■■■ 4.32
NAP1L1-222	ENST00000551992	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		42.01	■■■■■ 4.32
NAP1L1-222	ENST00000551992	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		42.01	■■■■■ 4.32
NAP1L1-222	ENST00000551992	FBLN2	P98095	1184 aa		41.95	■■■■■ 4.31
NAP1L1-222	ENST00000551992	SYNJ2	O15056	1496 aa		41.92	■■■■■ 4.3
NAP1L1-222	ENST00000551992	ARHGEF11	O15085	1522 aa		41.87	■■■■■ 4.29
NAP1L1-222	ENST00000551992	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	41.82	■■■■■ 4.29
NAP1L1-222	ENST00000551992	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		41.81	■■■■■ 4.28
NAP1L1-222	ENST00000551992	ADAMTS12	P58397	1594 aa		41.8	■■■■■ 4.28
NAP1L1-222	ENST00000551992	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		41.69	■■■■■ 4.26
NAP1L1-222	ENST00000551992	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		41.66	■■■■■ 4.26
NAP1L1-222	ENST00000551992	GRIN2A	Q12879	1464 aa		41.65	■■■■■ 4.26
NAP1L1-222	ENST00000551992	KIF27	Q86VH2	1401 aa		41.62	■■■■■ 4.25
NAP1L1-222	ENST00000551992	CEP170	Q5SW79	1584 aa		41.48	■■■■■ 4.23
NAP1L1-222	ENST00000551992	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		41.48	■■■■■ 4.23
NAP1L1-222	ENST00000551992	NUP160	Q12769	1436 aa		41.46	■■■■■ 4.23
NAP1L1-222	ENST00000551992	IGF1R	P08069	1367 aa		41.45	■■■■■ 4.23
NAP1L1-222	ENST00000551992	ARAP1	Q96P48	1450 aa		41.44	■■■■■ 4.22
NAP1L1-222	ENST00000551992	CUL7	Q14999	1698 aa		41.44	■■■■■ 4.22
NAP1L1-222	ENST00000551992	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		41.24	■■■■■ 4.19
NAP1L1-222	ENST00000551992	SHROOM2	Q13796	1616 aa		41.22	■■■■■ 4.19
NAP1L1-222	ENST00000551992	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		41.2	■■■■■ 4.19
NAP1L1-222	ENST00000551992	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		41.1	■■■■■ 4.17

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