Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.051e-6■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 RPS13-203ENST00000525828 664 ntTSL 219.21■□□□□ 0.671e-14■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 RPS13-205ENST00000527571 777 ntTSL 218.76■□□□□ 0.591e-14■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 RPS13-206ENST00000528074 583 ntTSL 217.97■□□□□ 0.471e-14■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 RPS13-204ENST00000526895 561 ntTSL 316.11■□□□□ 0.171e-14■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 RPS13-210ENST00000534329 568 ntTSL 215.33■□□□□ 0.041e-14■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 RPS13-209ENST00000533969 355 ntTSL 315.25■□□□□ 0.031e-14■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 RPS13-201ENST00000228140 491 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.541e-14■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 RPS13-202ENST00000525634 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.751e-14■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 16e-8■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.686e-8■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.486e-8■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 RTN4-210ENST00000427710 589 ntTSL 416.4■□□□□ 0.226e-8■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.196e-8■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 RTN4-206ENST00000394611 4161 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.086e-8■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.776e-8■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 LGALS3BP-207ENST00000587311 1905 ntTSL 218.43■□□□□ 0.543e-9■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 LGALS3BP-204ENST00000586720 1736 ntTSL 518■□□□□ 0.473e-9■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.413e-9■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 LGALS3BP-205ENST00000587251 2091 ntTSL 517.4■□□□□ 0.383e-9■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 LGALS3BP-201ENST00000262776 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.353e-9■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 EGFL7-207ENST00000492862 723 ntTSL 519.96■□□□□ 0.793e-8■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 EGFL7-205ENST00000490469 456 ntTSL 518.93■□□□□ 0.623e-8■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 CD46P1-201ENST00000441364 763 ntBASIC10.3□□□□□ -0.763e-9■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 CR1L-205ENST00000531844 663 ntTSL 29.08□□□□□ -0.963e-9■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 NOP58-203ENST00000433543 714 ntTSL 36.58□□□□□ -1.363e-9■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.963e-9■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.33□□□□□ -2.043e-9■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 ATXN2L-207ENST00000561732 643 ntTSL 221.07■□□□□ 0.963e-13■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.778e-7■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 LMBR1-209ENST00000434453 2229 ntTSL 525.55■■□□□ 1.682e-7■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 LMBR1-217ENST00000485985 644 ntTSL 223.16■■□□□ 1.32e-7■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 LMBR1-207ENST00000433968 578 ntTSL 422.99■■□□□ 1.272e-7■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 LMBR1-203ENST00000414218 451 ntTSL 522.9■■□□□ 1.262e-7■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 LMBR1-219ENST00000498034 478 ntTSL 322.58■■□□□ 1.212e-7■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.246e-8■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.166e-8■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.76e-8■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.76e-8■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 ATP5G2-203ENST00000495596 1976 ntTSL 1 (best)14.43□□□□□ -0.16e-8■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 ATP5G2-202ENST00000394349 878 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.276e-8■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 ATP5G2-205ENST00000549748 728 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.086e-8■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.552e-8■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 DNM2-210ENST00000587830 868 ntTSL 512.47□□□□□ -0.417e-7■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 DNM2-214ENST00000590787 4299 ntTSL 211.54□□□□□ -0.567e-7■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 HLA-C-205ENST00000466892 754 nt18.1■□□□□ 0.492e-25■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 HLA-C-206ENST00000470363 1279 nt12.79□□□□□ -0.362e-25■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 ATP2A2-203ENST00000377685 5702 ntTSL 521.83■■□□□ 1.097e-15■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.497e-15■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.486e-15■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 C3-218ENST00000602229 585 ntTSL 211.78□□□□□ -0.521e-24■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 C3-216ENST00000601475 368 ntTSL 29.95□□□□□ -0.821e-24■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 C3-211ENST00000599668 627 ntTSL 39.92□□□□□ -0.821e-24■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 C3-215ENST00000601008 303 ntTSL 59.16□□□□□ -0.941e-24■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 C3-212ENST00000599899 1992 ntTSL 28.68□□□□□ -1.021e-24■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 MIIP-207ENST00000498685 1392 ntTSL 219.38■□□□□ 0.699e-7■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 MIIP-203ENST00000466860 1709 ntTSL 519.03■□□□□ 0.649e-7■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 MIIP-202ENST00000460823 955 ntTSL 516.77■□□□□ 0.289e-7■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.279e-7■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.092e-6■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.332e-6■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.163e-8■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.013e-8■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 TMBIM6-219ENST00000549471 484 ntTSL 25.09□□□□□ -1.596e-21■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 GSTP1-207ENST00000498765 723 ntTSL 310.87□□□□□ -0.671e-6■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.412e-7■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.082e-7■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 TALDO1-205ENST00000530440 710 ntTSL 312.08□□□□□ -0.482e-7■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 MAZ-211ENST00000567444 635 ntTSL 225.02■■□□□ 1.64e-21■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.17e-15■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 HLA-C-208ENST00000487245 1880 nt27.27■■□□□ 1.965e-7■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 HLA-C-202ENST00000376237 1538 nt25.18■■□□□ 1.625e-7■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.315e-7■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.245e-7■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 SF3B3-206ENST00000565990 967 ntTSL 213.92□□□□□ -0.186e-11■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 DDX39B-203ENST00000417023 561 ntTSL 514.31□□□□□ -0.121e-6■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 DDX39B-210ENST00000431908 914 ntTSL 513.24□□□□□ -0.291e-6■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 DDX39B-201ENST00000376177 1529 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.491e-6■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 ATP6V1G2-DDX39B-201ENST00000376185 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.51e-6■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 DDX39B-219ENST00000481456 5158 ntTSL 211.51□□□□□ -0.571e-6■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 DDX39B-214ENST00000458640 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.571e-6■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 DDX39B-220ENST00000482195 1232 ntTSL 211.44□□□□□ -0.581e-6■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 DDX39B-202ENST00000396172 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.671e-6■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 DDX39B-215ENST00000462256 4027 ntTSL 210.04□□□□□ -0.81e-6■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 DDX39B-221ENST00000484566 857 ntTSL 59.47□□□□□ -0.891e-6■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 DDX39B-207ENST00000427214 1005 ntTSL 57.37□□□□□ -1.231e-6■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 TTR-204ENST00000610404 1040 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.863e-8■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 TTR-205ENST00000613781 556 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.863e-8■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 TTR-201ENST00000237014 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.123e-8■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 GAPDH-209ENST00000492719 930 ntTSL 314.93□□□□□ -0.021e-15■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 11e-6■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 LRRC42-204ENST00000444987 1044 ntTSL 521.08■□□□□ 0.971e-6■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 LRRC42-202ENST00000371368 838 ntTSL 319.01■□□□□ 0.631e-6■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.521e-6■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 MIIP-204ENST00000478299 595 ntTSL 217.65■□□□□ 0.421e-7■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 BCL6-210ENST00000496823 1138 ntTSL 315.32■□□□□ 0.042e-14■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 BCL6-211ENST00000621333 3399 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.522e-14■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 BCL6-202ENST00000406870 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.722e-14■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 BCL6-209ENST00000480458 342 ntTSL 59.2□□□□□ -0.942e-14■■□□□ 14.4
PCBP1Q15365 BCL6-207ENST00000470319 526 ntTSL 43.79□□□□□ -1.82e-14■■□□□ 14.4
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