Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV79

PCMTD2, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD2Q9NV79 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCMTD2Q9NV79 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCMTD2Q9NV79 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCMTD2Q9NV79 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCMTD2Q9NV79 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCMTD2Q9NV79 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCMTD2Q9NV79 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCMTD2Q9NV79 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCMTD2Q9NV79 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCMTD2Q9NV79 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCMTD2Q9NV79 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCMTD2Q9NV79 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCMTD2Q9NV79 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCMTD2Q9NV79 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCMTD2Q9NV79 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCMTD2Q9NV79 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCMTD2Q9NV79 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PCMTD2Q9NV79 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCMTD2Q9NV79 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCMTD2Q9NV79 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCMTD2Q9NV79 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCMTD2Q9NV79 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCMTD2Q9NV79 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCMTD2Q9NV79 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCMTD2Q9NV79 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCMTD2Q9NV79 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCMTD2Q9NV79 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCMTD2Q9NV79 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PCMTD2Q9NV79 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCMTD2Q9NV79 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCMTD2Q9NV79 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCMTD2Q9NV79 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCMTD2Q9NV79 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCMTD2Q9NV79 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCMTD2Q9NV79 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCMTD2Q9NV79 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCMTD2Q9NV79 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PCMTD2Q9NV79 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCMTD2Q9NV79 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PCMTD2Q9NV79 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCMTD2Q9NV79 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCMTD2Q9NV79 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCMTD2Q9NV79 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCMTD2Q9NV79 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCMTD2Q9NV79 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCMTD2Q9NV79 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCMTD2Q9NV79 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCMTD2Q9NV79 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCMTD2Q9NV79 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCMTD2Q9NV79 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCMTD2Q9NV79 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCMTD2Q9NV79 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCMTD2Q9NV79 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCMTD2Q9NV79 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCMTD2Q9NV79 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCMTD2Q9NV79 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCMTD2Q9NV79 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCMTD2Q9NV79 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCMTD2Q9NV79 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCMTD2Q9NV79 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCMTD2Q9NV79 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCMTD2Q9NV79 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCMTD2Q9NV79 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCMTD2Q9NV79 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCMTD2Q9NV79 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCMTD2Q9NV79 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCMTD2Q9NV79 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCMTD2Q9NV79 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCMTD2Q9NV79 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCMTD2Q9NV79 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCMTD2Q9NV79 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCMTD2Q9NV79 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCMTD2Q9NV79 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCMTD2Q9NV79 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCMTD2Q9NV79 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCMTD2Q9NV79 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCMTD2Q9NV79 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCMTD2Q9NV79 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCMTD2Q9NV79 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCMTD2Q9NV79 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCMTD2Q9NV79 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCMTD2Q9NV79 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCMTD2Q9NV79 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCMTD2Q9NV79 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCMTD2Q9NV79 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCMTD2Q9NV79 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCMTD2Q9NV79 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCMTD2Q9NV79 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCMTD2Q9NV79 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCMTD2Q9NV79 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCMTD2Q9NV79 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCMTD2Q9NV79 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PCMTD2Q9NV79 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCMTD2Q9NV79 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCMTD2Q9NV79 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCMTD2Q9NV79 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCMTD2Q9NV79 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCMTD2Q9NV79 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCMTD2Q9NV79 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCMTD2Q9NV79 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms