Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LSM14BQ9BX40 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LSM14BQ9BX40 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LSM14BQ9BX40 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LSM14BQ9BX40 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LSM14BQ9BX40 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LSM14BQ9BX40 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LSM14BQ9BX40 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LSM14BQ9BX40 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LSM14BQ9BX40 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LSM14BQ9BX40 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LSM14BQ9BX40 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LSM14BQ9BX40 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LSM14BQ9BX40 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LSM14BQ9BX40 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LSM14BQ9BX40 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LSM14BQ9BX40 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LSM14BQ9BX40 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LSM14BQ9BX40 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LSM14BQ9BX40 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LSM14BQ9BX40 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LSM14BQ9BX40 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LSM14BQ9BX40 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LSM14BQ9BX40 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2
LSM14BQ9BX40 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LSM14BQ9BX40 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LSM14BQ9BX40 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LSM14BQ9BX40 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LSM14BQ9BX40 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LSM14BQ9BX40 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LSM14BQ9BX40 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LSM14BQ9BX40 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LSM14BQ9BX40 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LSM14BQ9BX40 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LSM14BQ9BX40 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LSM14BQ9BX40 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LSM14BQ9BX40 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LSM14BQ9BX40 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LSM14BQ9BX40 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LSM14BQ9BX40 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LSM14BQ9BX40 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LSM14BQ9BX40 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LSM14BQ9BX40 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
LSM14BQ9BX40 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LSM14BQ9BX40 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LSM14BQ9BX40 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LSM14BQ9BX40 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LSM14BQ9BX40 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LSM14BQ9BX40 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LSM14BQ9BX40 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LSM14BQ9BX40 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LSM14BQ9BX40 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LSM14BQ9BX40 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LSM14BQ9BX40 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LSM14BQ9BX40 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LSM14BQ9BX40 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LSM14BQ9BX40 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LSM14BQ9BX40 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LSM14BQ9BX40 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LSM14BQ9BX40 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LSM14BQ9BX40 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LSM14BQ9BX40 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LSM14BQ9BX40 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LSM14BQ9BX40 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LSM14BQ9BX40 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LSM14BQ9BX40 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LSM14BQ9BX40 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LSM14BQ9BX40 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LSM14BQ9BX40 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LSM14BQ9BX40 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LSM14BQ9BX40 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LSM14BQ9BX40 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LSM14BQ9BX40 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LSM14BQ9BX40 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LSM14BQ9BX40 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LSM14BQ9BX40 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LSM14BQ9BX40 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LSM14BQ9BX40 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LSM14BQ9BX40 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LSM14BQ9BX40 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LSM14BQ9BX40 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LSM14BQ9BX40 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LSM14BQ9BX40 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LSM14BQ9BX40 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LSM14BQ9BX40 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LSM14BQ9BX40 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LSM14BQ9BX40 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LSM14BQ9BX40 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LSM14BQ9BX40 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LSM14BQ9BX40 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LSM14BQ9BX40 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LSM14BQ9BX40 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
LSM14BQ9BX40 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LSM14BQ9BX40 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LSM14BQ9BX40 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LSM14BQ9BX40 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LSM14BQ9BX40 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
LSM14BQ9BX40 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LSM14BQ9BX40 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LSM14BQ9BX40 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms