Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC73Q6ZRK6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC73Q6ZRK6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC73Q6ZRK6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC73Q6ZRK6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC73Q6ZRK6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC73Q6ZRK6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CCDC73Q6ZRK6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC73Q6ZRK6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC73Q6ZRK6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC73Q6ZRK6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC73Q6ZRK6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC73Q6ZRK6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC73Q6ZRK6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC73Q6ZRK6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC73Q6ZRK6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC73Q6ZRK6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC73Q6ZRK6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC73Q6ZRK6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC73Q6ZRK6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC73Q6ZRK6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC73Q6ZRK6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC73Q6ZRK6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC73Q6ZRK6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC73Q6ZRK6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC73Q6ZRK6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC73Q6ZRK6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC73Q6ZRK6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC73Q6ZRK6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC73Q6ZRK6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC73Q6ZRK6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC73Q6ZRK6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC73Q6ZRK6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC73Q6ZRK6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC73Q6ZRK6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC73Q6ZRK6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC73Q6ZRK6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC73Q6ZRK6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC73Q6ZRK6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC73Q6ZRK6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC73Q6ZRK6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC73Q6ZRK6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC73Q6ZRK6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC73Q6ZRK6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC73Q6ZRK6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC73Q6ZRK6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC73Q6ZRK6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC73Q6ZRK6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC73Q6ZRK6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC73Q6ZRK6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC73Q6ZRK6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC73Q6ZRK6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC73Q6ZRK6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC73Q6ZRK6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC73Q6ZRK6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC73Q6ZRK6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC73Q6ZRK6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC73Q6ZRK6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC73Q6ZRK6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC73Q6ZRK6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC73Q6ZRK6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC73Q6ZRK6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC73Q6ZRK6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC73Q6ZRK6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC73Q6ZRK6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC73Q6ZRK6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC73Q6ZRK6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC73Q6ZRK6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC73Q6ZRK6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC73Q6ZRK6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC73Q6ZRK6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC73Q6ZRK6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC73Q6ZRK6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC73Q6ZRK6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC73Q6ZRK6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC73Q6ZRK6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC73Q6ZRK6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC73Q6ZRK6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC73Q6ZRK6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC73Q6ZRK6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC73Q6ZRK6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC73Q6ZRK6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC73Q6ZRK6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC73Q6ZRK6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC73Q6ZRK6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC73Q6ZRK6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC73Q6ZRK6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC73Q6ZRK6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC73Q6ZRK6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC73Q6ZRK6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC73Q6ZRK6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC73Q6ZRK6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC73Q6ZRK6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC73Q6ZRK6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CCDC73Q6ZRK6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC73Q6ZRK6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC73Q6ZRK6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC73Q6ZRK6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC73Q6ZRK6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC73Q6ZRK6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms