Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP12Q6UXS9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP12Q6UXS9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP12Q6UXS9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP12Q6UXS9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP12Q6UXS9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP12Q6UXS9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP12Q6UXS9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP12Q6UXS9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP12Q6UXS9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP12Q6UXS9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP12Q6UXS9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP12Q6UXS9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP12Q6UXS9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP12Q6UXS9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CASP12Q6UXS9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CASP12Q6UXS9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP12Q6UXS9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP12Q6UXS9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP12Q6UXS9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP12Q6UXS9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP12Q6UXS9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP12Q6UXS9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP12Q6UXS9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP12Q6UXS9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP12Q6UXS9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP12Q6UXS9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP12Q6UXS9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP12Q6UXS9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP12Q6UXS9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP12Q6UXS9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP12Q6UXS9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP12Q6UXS9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP12Q6UXS9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP12Q6UXS9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP12Q6UXS9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP12Q6UXS9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP12Q6UXS9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP12Q6UXS9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP12Q6UXS9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP12Q6UXS9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP12Q6UXS9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP12Q6UXS9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP12Q6UXS9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP12Q6UXS9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP12Q6UXS9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP12Q6UXS9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP12Q6UXS9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP12Q6UXS9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP12Q6UXS9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP12Q6UXS9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP12Q6UXS9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP12Q6UXS9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP12Q6UXS9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP12Q6UXS9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP12Q6UXS9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP12Q6UXS9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP12Q6UXS9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP12Q6UXS9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP12Q6UXS9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP12Q6UXS9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP12Q6UXS9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP12Q6UXS9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP12Q6UXS9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP12Q6UXS9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP12Q6UXS9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP12Q6UXS9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP12Q6UXS9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP12Q6UXS9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP12Q6UXS9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP12Q6UXS9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP12Q6UXS9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP12Q6UXS9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP12Q6UXS9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP12Q6UXS9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP12Q6UXS9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP12Q6UXS9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP12Q6UXS9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP12Q6UXS9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP12Q6UXS9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP12Q6UXS9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP12Q6UXS9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP12Q6UXS9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP12Q6UXS9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP12Q6UXS9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP12Q6UXS9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP12Q6UXS9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP12Q6UXS9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP12Q6UXS9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP12Q6UXS9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP12Q6UXS9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP12Q6UXS9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP12Q6UXS9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP12Q6UXS9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP12Q6UXS9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP12Q6UXS9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP12Q6UXS9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP12Q6UXS9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP12Q6UXS9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP12Q6UXS9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms