Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT16

SLC18B1, MFS-type transporter SLC18B1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18B1Q6NT16 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC18B1Q6NT16 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC18B1Q6NT16 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC18B1Q6NT16 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC18B1Q6NT16 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC18B1Q6NT16 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC18B1Q6NT16 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18B1Q6NT16 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18B1Q6NT16 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18B1Q6NT16 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18B1Q6NT16 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18B1Q6NT16 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18B1Q6NT16 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC18B1Q6NT16 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC18B1Q6NT16 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC18B1Q6NT16 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC18B1Q6NT16 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC18B1Q6NT16 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC18B1Q6NT16 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC18B1Q6NT16 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC18B1Q6NT16 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms