Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAA8

TSNAXIP1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNAXIP1Q2TAA8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSNAXIP1Q2TAA8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSNAXIP1Q2TAA8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSNAXIP1Q2TAA8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSNAXIP1Q2TAA8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSNAXIP1Q2TAA8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSNAXIP1Q2TAA8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSNAXIP1Q2TAA8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSNAXIP1Q2TAA8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSNAXIP1Q2TAA8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSNAXIP1Q2TAA8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSNAXIP1Q2TAA8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSNAXIP1Q2TAA8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSNAXIP1Q2TAA8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TSNAXIP1Q2TAA8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSNAXIP1Q2TAA8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TSNAXIP1Q2TAA8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSNAXIP1Q2TAA8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSNAXIP1Q2TAA8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSNAXIP1Q2TAA8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSNAXIP1Q2TAA8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSNAXIP1Q2TAA8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSNAXIP1Q2TAA8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSNAXIP1Q2TAA8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSNAXIP1Q2TAA8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSNAXIP1Q2TAA8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSNAXIP1Q2TAA8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSNAXIP1Q2TAA8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSNAXIP1Q2TAA8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSNAXIP1Q2TAA8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSNAXIP1Q2TAA8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSNAXIP1Q2TAA8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSNAXIP1Q2TAA8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSNAXIP1Q2TAA8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSNAXIP1Q2TAA8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSNAXIP1Q2TAA8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSNAXIP1Q2TAA8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSNAXIP1Q2TAA8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSNAXIP1Q2TAA8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TSNAXIP1Q2TAA8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSNAXIP1Q2TAA8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSNAXIP1Q2TAA8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSNAXIP1Q2TAA8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSNAXIP1Q2TAA8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSNAXIP1Q2TAA8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSNAXIP1Q2TAA8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSNAXIP1Q2TAA8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSNAXIP1Q2TAA8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSNAXIP1Q2TAA8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSNAXIP1Q2TAA8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSNAXIP1Q2TAA8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSNAXIP1Q2TAA8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSNAXIP1Q2TAA8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TSNAXIP1Q2TAA8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TSNAXIP1Q2TAA8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSNAXIP1Q2TAA8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSNAXIP1Q2TAA8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSNAXIP1Q2TAA8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSNAXIP1Q2TAA8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSNAXIP1Q2TAA8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSNAXIP1Q2TAA8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSNAXIP1Q2TAA8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TSNAXIP1Q2TAA8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSNAXIP1Q2TAA8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSNAXIP1Q2TAA8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSNAXIP1Q2TAA8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSNAXIP1Q2TAA8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSNAXIP1Q2TAA8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSNAXIP1Q2TAA8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSNAXIP1Q2TAA8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSNAXIP1Q2TAA8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSNAXIP1Q2TAA8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSNAXIP1Q2TAA8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSNAXIP1Q2TAA8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSNAXIP1Q2TAA8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSNAXIP1Q2TAA8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSNAXIP1Q2TAA8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSNAXIP1Q2TAA8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSNAXIP1Q2TAA8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSNAXIP1Q2TAA8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSNAXIP1Q2TAA8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSNAXIP1Q2TAA8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSNAXIP1Q2TAA8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSNAXIP1Q2TAA8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TSNAXIP1Q2TAA8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSNAXIP1Q2TAA8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSNAXIP1Q2TAA8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSNAXIP1Q2TAA8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSNAXIP1Q2TAA8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSNAXIP1Q2TAA8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TSNAXIP1Q2TAA8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSNAXIP1Q2TAA8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSNAXIP1Q2TAA8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TSNAXIP1Q2TAA8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSNAXIP1Q2TAA8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSNAXIP1Q2TAA8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSNAXIP1Q2TAA8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms