Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NOP2P46087 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NOP2P46087 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NOP2P46087 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NOP2P46087 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NOP2P46087 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NOP2P46087 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NOP2P46087 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NOP2P46087 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NOP2P46087 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NOP2P46087 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NOP2P46087 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NOP2P46087 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NOP2P46087 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NOP2P46087 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOP2P46087 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOP2P46087 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOP2P46087 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOP2P46087 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOP2P46087 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOP2P46087 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NOP2P46087 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NOP2P46087 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NOP2P46087 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NOP2P46087 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NOP2P46087 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NOP2P46087 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NOP2P46087 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NOP2P46087 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NOP2P46087 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NOP2P46087 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NOP2P46087 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NOP2P46087 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NOP2P46087 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NOP2P46087 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NOP2P46087 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NOP2P46087 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NOP2P46087 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NOP2P46087 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NOP2P46087 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NOP2P46087 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NOP2P46087 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NOP2P46087 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NOP2P46087 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NOP2P46087 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NOP2P46087 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
NOP2P46087 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NOP2P46087 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NOP2P46087 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NOP2P46087 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
NOP2P46087 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NOP2P46087 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NOP2P46087 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NOP2P46087 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NOP2P46087 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NOP2P46087 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NOP2P46087 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NOP2P46087 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NOP2P46087 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NOP2P46087 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NOP2P46087 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NOP2P46087 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NOP2P46087 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NOP2P46087 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NOP2P46087 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOP2P46087 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOP2P46087 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOP2P46087 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOP2P46087 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOP2P46087 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOP2P46087 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NOP2P46087 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NOP2P46087 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NOP2P46087 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NOP2P46087 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NOP2P46087 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NOP2P46087 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NOP2P46087 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NOP2P46087 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NOP2P46087 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NOP2P46087 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NOP2P46087 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NOP2P46087 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NOP2P46087 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NOP2P46087 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NOP2P46087 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NOP2P46087 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NOP2P46087 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NOP2P46087 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NOP2P46087 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NOP2P46087 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NOP2P46087 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NOP2P46087 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOP2P46087 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOP2P46087 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOP2P46087 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOP2P46087 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOP2P46087 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOP2P46087 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NOP2P46087 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms