Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NOP2P46087 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NOP2P46087 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NOP2P46087 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NOP2P46087 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NOP2P46087 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NOP2P46087 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NOP2P46087 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NOP2P46087 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NOP2P46087 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NOP2P46087 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NOP2P46087 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NOP2P46087 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NOP2P46087 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NOP2P46087 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOP2P46087 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOP2P46087 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOP2P46087 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOP2P46087 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOP2P46087 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOP2P46087 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NOP2P46087 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NOP2P46087 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NOP2P46087 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NOP2P46087 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NOP2P46087 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NOP2P46087 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NOP2P46087 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NOP2P46087 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NOP2P46087 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NOP2P46087 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NOP2P46087 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NOP2P46087 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NOP2P46087 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NOP2P46087 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NOP2P46087 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NOP2P46087 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NOP2P46087 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NOP2P46087 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NOP2P46087 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NOP2P46087 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NOP2P46087 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NOP2P46087 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NOP2P46087 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NOP2P46087 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NOP2P46087 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
NOP2P46087 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NOP2P46087 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NOP2P46087 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NOP2P46087 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
NOP2P46087 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NOP2P46087 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NOP2P46087 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NOP2P46087 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NOP2P46087 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NOP2P46087 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NOP2P46087 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NOP2P46087 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NOP2P46087 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NOP2P46087 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NOP2P46087 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NOP2P46087 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NOP2P46087 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NOP2P46087 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NOP2P46087 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOP2P46087 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOP2P46087 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOP2P46087 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOP2P46087 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOP2P46087 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOP2P46087 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NOP2P46087 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NOP2P46087 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NOP2P46087 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NOP2P46087 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NOP2P46087 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NOP2P46087 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NOP2P46087 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NOP2P46087 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NOP2P46087 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NOP2P46087 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NOP2P46087 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NOP2P46087 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NOP2P46087 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NOP2P46087 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NOP2P46087 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NOP2P46087 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NOP2P46087 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NOP2P46087 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NOP2P46087 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NOP2P46087 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NOP2P46087 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NOP2P46087 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOP2P46087 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOP2P46087 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOP2P46087 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOP2P46087 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOP2P46087 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOP2P46087 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NOP2P46087 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms