Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRR1P24046 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRR1P24046 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRR1P24046 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRR1P24046 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRR1P24046 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRR1P24046 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRR1P24046 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRR1P24046 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRR1P24046 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRR1P24046 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRR1P24046 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRR1P24046 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRR1P24046 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GABRR1P24046 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GABRR1P24046 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRR1P24046 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRR1P24046 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRR1P24046 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRR1P24046 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRR1P24046 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRR1P24046 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRR1P24046 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRR1P24046 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRR1P24046 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRR1P24046 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRR1P24046 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRR1P24046 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRR1P24046 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRR1P24046 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRR1P24046 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRR1P24046 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRR1P24046 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRR1P24046 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRR1P24046 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRR1P24046 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRR1P24046 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRR1P24046 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRR1P24046 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRR1P24046 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRR1P24046 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRR1P24046 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRR1P24046 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRR1P24046 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRR1P24046 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GABRR1P24046 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GABRR1P24046 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRR1P24046 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRR1P24046 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRR1P24046 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRR1P24046 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRR1P24046 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRR1P24046 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRR1P24046 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRR1P24046 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRR1P24046 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRR1P24046 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRR1P24046 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRR1P24046 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRR1P24046 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRR1P24046 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRR1P24046 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRR1P24046 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRR1P24046 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRR1P24046 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRR1P24046 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRR1P24046 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRR1P24046 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRR1P24046 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRR1P24046 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRR1P24046 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRR1P24046 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GABRR1P24046 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABRR1P24046 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABRR1P24046 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABRR1P24046 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRR1P24046 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRR1P24046 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRR1P24046 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRR1P24046 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRR1P24046 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRR1P24046 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRR1P24046 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRR1P24046 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRR1P24046 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRR1P24046 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRR1P24046 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRR1P24046 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRR1P24046 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRR1P24046 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRR1P24046 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRR1P24046 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRR1P24046 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRR1P24046 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRR1P24046 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRR1P24046 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRR1P24046 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRR1P24046 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRR1P24046 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRR1P24046 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms