Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDK11BP21127 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK11BP21127 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK11BP21127 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK11BP21127 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK11BP21127 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDK11BP21127 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CDK11BP21127 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDK11BP21127 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDK11BP21127 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDK11BP21127 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK11BP21127 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK11BP21127 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK11BP21127 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK11BP21127 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK11BP21127 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK11BP21127 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK11BP21127 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK11BP21127 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK11BP21127 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK11BP21127 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK11BP21127 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDK11BP21127 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDK11BP21127 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CDK11BP21127 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDK11BP21127 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDK11BP21127 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDK11BP21127 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDK11BP21127 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK11BP21127 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK11BP21127 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDK11BP21127 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CDK11BP21127 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CDK11BP21127 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK11BP21127 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK11BP21127 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK11BP21127 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK11BP21127 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDK11BP21127 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDK11BP21127 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDK11BP21127 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CDK11BP21127 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CDK11BP21127 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CDK11BP21127 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CDK11BP21127 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDK11BP21127 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDK11BP21127 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK11BP21127 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK11BP21127 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK11BP21127 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK11BP21127 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK11BP21127 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK11BP21127 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK11BP21127 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK11BP21127 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK11BP21127 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK11BP21127 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK11BP21127 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK11BP21127 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDK11BP21127 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDK11BP21127 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK11BP21127 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK11BP21127 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDK11BP21127 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDK11BP21127 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CDK11BP21127 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK11BP21127 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK11BP21127 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK11BP21127 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK11BP21127 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK11BP21127 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK11BP21127 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK11BP21127 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDK11BP21127 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDK11BP21127 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDK11BP21127 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDK11BP21127 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDK11BP21127 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDK11BP21127 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDK11BP21127 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDK11BP21127 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK11BP21127 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK11BP21127 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK11BP21127 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK11BP21127 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK11BP21127 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK11BP21127 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK11BP21127 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDK11BP21127 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK11BP21127 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK11BP21127 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK11BP21127 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK11BP21127 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK11BP21127 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK11BP21127 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK11BP21127 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK11BP21127 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK11BP21127 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK11BP21127 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK11BP21127 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms