RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299575.4

ATMIN-201, Transcript of ATM interactor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATMIN, Length 4,884 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMIN-201ENST00000299575 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.74■■■■□ 3.95
ATMIN-201ENST00000299575 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.68■■■■□ 3.94
ATMIN-201ENST00000299575 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.01■■■■□ 3.68
ATMIN-201ENST00000299575 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.6■■■■□ 3.61
ATMIN-201ENST00000299575 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.29■■■■□ 3.4
ATMIN-201ENST00000299575 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.71■■■■□ 3.31
ATMIN-201ENST00000299575 APLP2Q06481 763 aa35.48■■■■□ 3.27
ATMIN-201ENST00000299575 PCGF6Q9BYE7 350 aa35.37■■■■□ 3.25
ATMIN-201ENST00000299575 TRIM41Q8WV44 630 aa35.28■■■■□ 3.24
ATMIN-201ENST00000299575 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.05■■■■□ 3.2
ATMIN-201ENST00000299575 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.74■■■■□ 3.15
ATMIN-201ENST00000299575 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.63■■■■□ 3.13
ATMIN-201ENST00000299575 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP34.61■■■■□ 3.13
ATMIN-201ENST00000299575 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP34.55■■■■□ 3.12
ATMIN-201ENST00000299575 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP34.5■■■■□ 3.11
ATMIN-201ENST00000299575 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.33■■■■□ 3.09
ATMIN-201ENST00000299575 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.28■■■■□ 3.08
ATMIN-201ENST00000299575 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.12■■■■□ 3.05
ATMIN-201ENST00000299575 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP34.09■■■■□ 3.05
ATMIN-201ENST00000299575 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.08■■■■□ 3.05
ATMIN-201ENST00000299575 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP34.05■■■■□ 3.04
ATMIN-201ENST00000299575 HRCP23327 699 aa33.76■■■□□ 2.99
ATMIN-201ENST00000299575 ABCC9O60706 1549 aa33.73■■■□□ 2.99
ATMIN-201ENST00000299575 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP33.42■■■□□ 2.94
ATMIN-201ENST00000299575 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.41■■■□□ 2.94
ATMIN-201ENST00000299575 ITGAEP38570 1179 aa33.36■■■□□ 2.93
ATMIN-201ENST00000299575 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP33.32■■■□□ 2.92
ATMIN-201ENST00000299575 NEFLP07196 543 aa33.14■■■□□ 2.9
ATMIN-201ENST00000299575 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP33.12■■■□□ 2.89
ATMIN-201ENST00000299575 ERICH6Q7L0X2 663 aa32.99■■■□□ 2.87
ATMIN-201ENST00000299575 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.98■■■□□ 2.87
ATMIN-201ENST00000299575 MYT1LQ9UL68 1186 aa32.67■■■□□ 2.82
ATMIN-201ENST00000299575 POLR3GLQ9BT43 218 aa32.65■■■□□ 2.82
ATMIN-201ENST00000299575 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP32.64■■■□□ 2.82
ATMIN-201ENST00000299575 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP32.63■■■□□ 2.81
ATMIN-201ENST00000299575 SCRIBQ14160 1630 aa32.58■■■□□ 2.81
ATMIN-201ENST00000299575 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.58■■■□□ 2.81
ATMIN-201ENST00000299575 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.57■■■□□ 2.81
ATMIN-201ENST00000299575 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP32.35■■■□□ 2.77
ATMIN-201ENST00000299575 TRIM52Q96A61 297 aa32.29■■■□□ 2.76
ATMIN-201ENST00000299575 NEUROD1Q13562 356 aa32.28■■■□□ 2.76
ATMIN-201ENST00000299575 P3H3Q8IVL6 736 aa32.13■■■□□ 2.73
ATMIN-201ENST00000299575 FBLN2P98095 1184 aa32.07■■■□□ 2.72
ATMIN-201ENST00000299575 MYT1Q01538 1121 aa32.07■■■□□ 2.72
ATMIN-201ENST00000299575 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.07■■■□□ 2.72
ATMIN-201ENST00000299575 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP32.05■■■□□ 2.72
ATMIN-201ENST00000299575 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.86■■■□□ 2.69
ATMIN-201ENST00000299575 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP31.85■■■□□ 2.69
ATMIN-201ENST00000299575 ANP32CO43423 234 aa31.84■■■□□ 2.69
ATMIN-201ENST00000299575 ARID3CA6NKF2 412 aa31.83■■■□□ 2.69
ATMIN-201ENST00000299575 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP31.83■■■□□ 2.69
ATMIN-201ENST00000299575 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP31.82■■■□□ 2.68
ATMIN-201ENST00000299575 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa31.8■■■□□ 2.68
ATMIN-201ENST00000299575 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.74■■■□□ 2.67
ATMIN-201ENST00000299575 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.66■■■□□ 2.66
ATMIN-201ENST00000299575 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP31.64■■■□□ 2.66
ATMIN-201ENST00000299575 NACADO15069 1562 aa31.6■■■□□ 2.65
ATMIN-201ENST00000299575 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP31.57■■■□□ 2.64
ATMIN-201ENST00000299575 BCANQ96GW7 911 aa31.54■■■□□ 2.64
ATMIN-201ENST00000299575 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP31.53■■■□□ 2.64
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ATMIN-201ENST00000299575 EEA1Q15075 1411 aa31.42■■■□□ 2.62
ATMIN-201ENST00000299575 CLSPNQ9HAW4 1339 aa31.4■■■□□ 2.62
ATMIN-201ENST00000299575 TONSLQ96HA7 1378 aa31.38■■■□□ 2.61
ATMIN-201ENST00000299575 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.31■■■□□ 2.6
ATMIN-201ENST00000299575 CEP162Q5TB80 1403 aa31.29■■■□□ 2.6
ATMIN-201ENST00000299575 GOLGA3Q08378 1498 aa31.28■■■□□ 2.6
ATMIN-201ENST00000299575 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
ATMIN-201ENST00000299575 CHIC2Q9UKJ5 165 aa31.21■■■□□ 2.59
ATMIN-201ENST00000299575 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.21■■■□□ 2.59
ATMIN-201ENST00000299575 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.19■■■□□ 2.58
ATMIN-201ENST00000299575 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.18■■■□□ 2.58
ATMIN-201ENST00000299575 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
ATMIN-201ENST00000299575 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP31.18■■■□□ 2.58
ATMIN-201ENST00000299575 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.12■■■□□ 2.57
ATMIN-201ENST00000299575 KIF27Q86VH2 1401 aa31.01■■■□□ 2.56
ATMIN-201ENST00000299575 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.01■■■□□ 2.56
ATMIN-201ENST00000299575 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.01■■■□□ 2.55
ATMIN-201ENST00000299575 TSPY4P0CV99 314 aa30.96■■■□□ 2.55
ATMIN-201ENST00000299575 TSPY10P0CW01 314 aa30.96■■■□□ 2.55
ATMIN-201ENST00000299575 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP30.94■■■□□ 2.54
ATMIN-201ENST00000299575 CANXP27824 592 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
ATMIN-201ENST00000299575 FKBP8Q14318 412 aa30.89■■■□□ 2.54
ATMIN-201ENST00000299575 MIER1Q8N108 512 aa30.88■■■□□ 2.53
ATMIN-201ENST00000299575 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.87■■■□□ 2.53
ATMIN-201ENST00000299575 FAM9BQ8IZU0 186 aa30.86■■■□□ 2.53
ATMIN-201ENST00000299575 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP30.85■■■□□ 2.53
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ATMIN-201ENST00000299575 NEFMP07197 916 aa30.85■■■□□ 2.53
ATMIN-201ENST00000299575 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.84■■■□□ 2.53
ATMIN-201ENST00000299575 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.81■■■□□ 2.52
ATMIN-201ENST00000299575 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP30.78■■■□□ 2.52
ATMIN-201ENST00000299575 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP30.78■■■□□ 2.52
ATMIN-201ENST00000299575 SOGA1O94964 1423 aa30.76■■■□□ 2.52
ATMIN-201ENST00000299575 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa30.73■■■□□ 2.51
ATMIN-201ENST00000299575 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP30.69■■■□□ 2.5
ATMIN-201ENST00000299575 TMC1Q8TDI8 760 aa30.69■■■□□ 2.5
ATMIN-201ENST00000299575 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP30.68■■■□□ 2.5
ATMIN-201ENST00000299575 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.67■■■□□ 2.5
ATMIN-201ENST00000299575 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.66■■■□□ 2.5
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