Protein–RNA interactions for Protein: P0CG20

PRR35, Proline-rich protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR35P0CG20 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRR35P0CG20 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRR35P0CG20 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRR35P0CG20 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRR35P0CG20 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRR35P0CG20 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRR35P0CG20 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRR35P0CG20 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PRR35P0CG20 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRR35P0CG20 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRR35P0CG20 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRR35P0CG20 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRR35P0CG20 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRR35P0CG20 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRR35P0CG20 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRR35P0CG20 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRR35P0CG20 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRR35P0CG20 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRR35P0CG20 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRR35P0CG20 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRR35P0CG20 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PRR35P0CG20 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRR35P0CG20 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRR35P0CG20 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRR35P0CG20 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRR35P0CG20 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRR35P0CG20 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PRR35P0CG20 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRR35P0CG20 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRR35P0CG20 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRR35P0CG20 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRR35P0CG20 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRR35P0CG20 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRR35P0CG20 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRR35P0CG20 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRR35P0CG20 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRR35P0CG20 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRR35P0CG20 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRR35P0CG20 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRR35P0CG20 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRR35P0CG20 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRR35P0CG20 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRR35P0CG20 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRR35P0CG20 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRR35P0CG20 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRR35P0CG20 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRR35P0CG20 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRR35P0CG20 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRR35P0CG20 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRR35P0CG20 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRR35P0CG20 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRR35P0CG20 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRR35P0CG20 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRR35P0CG20 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRR35P0CG20 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRR35P0CG20 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRR35P0CG20 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRR35P0CG20 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRR35P0CG20 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRR35P0CG20 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRR35P0CG20 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRR35P0CG20 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRR35P0CG20 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRR35P0CG20 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRR35P0CG20 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRR35P0CG20 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRR35P0CG20 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRR35P0CG20 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRR35P0CG20 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRR35P0CG20 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRR35P0CG20 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRR35P0CG20 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRR35P0CG20 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRR35P0CG20 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRR35P0CG20 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRR35P0CG20 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRR35P0CG20 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRR35P0CG20 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRR35P0CG20 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRR35P0CG20 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRR35P0CG20 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRR35P0CG20 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRR35P0CG20 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRR35P0CG20 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRR35P0CG20 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRR35P0CG20 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRR35P0CG20 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRR35P0CG20 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRR35P0CG20 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRR35P0CG20 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRR35P0CG20 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRR35P0CG20 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRR35P0CG20 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRR35P0CG20 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRR35P0CG20 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRR35P0CG20 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRR35P0CG20 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRR35P0CG20 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRR35P0CG20 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRR35P0CG20 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms