RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370915.5

LSM14B-204, Transcript of LSM family member 14B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LSM14B, Length 1,079 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14B-204ENST00000370915 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.72■■■■■ 7.95
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LSM14B-204ENST00000370915 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.79■■■■■ 6.36
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LSM14B-204ENST00000370915 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.88■■■■■ 5.58
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LSM14B-204ENST00000370915 CFTRP13569 1480 aa48.41■■■■■ 5.34
LSM14B-204ENST00000370915 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.37■■■■■ 5.33
LSM14B-204ENST00000370915 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.29■■■■■ 5.32
LSM14B-204ENST00000370915 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.29■■■■■ 5.32
LSM14B-204ENST00000370915 WDR62O43379 1518 aa48.25■■■■■ 5.31
LSM14B-204ENST00000370915 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.17■■■■■ 5.3
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LSM14B-204ENST00000370915 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.88■■■■■ 5.26
LSM14B-204ENST00000370915 TOPBP1Q92547 1522 aa47.45■■■■■ 5.19
LSM14B-204ENST00000370915 ABCC8Q09428 1581 aa47.34■■■■■ 5.17
LSM14B-204ENST00000370915 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.32■■■■■ 5.17
LSM14B-204ENST00000370915 IFT140Q96RY7 1462 aa47.29■■■■■ 5.16
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LSM14B-204ENST00000370915 SOGA1O94964 1423 aa46.78■■■■■ 5.08
LSM14B-204ENST00000370915 TRIM41Q8WV44 630 aa46.63■■■■■ 5.06
LSM14B-204ENST00000370915 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.62■■■■■ 5.05
LSM14B-204ENST00000370915 CHD1O14646 1710 aa46.57■■■■■ 5.05
LSM14B-204ENST00000370915 WDR97A6NE52 1622 aa46.52■■■■■ 5.04
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LSM14B-204ENST00000370915 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.39■■■■■ 5.02
LSM14B-204ENST00000370915 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.39■■■■■ 5.02
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LSM14B-204ENST00000370915 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.23■■■■■ 4.99
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LSM14B-204ENST00000370915 CEP170Q5SW79 1584 aa45.57■■■■■ 4.89
LSM14B-204ENST00000370915 NUP160Q12769 1436 aa45.55■■■■■ 4.88
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LSM14B-204ENST00000370915 SHROOM2Q13796 1616 aa45.32■■■■■ 4.85
LSM14B-204ENST00000370915 KIF27Q86VH2 1401 aa45.3■■■■■ 4.84
LSM14B-204ENST00000370915 IGF1RP08069 1367 aa45.25■■■■■ 4.83
LSM14B-204ENST00000370915 TRHP20396 242 aaPredicted RBP45.18■■■■■ 4.82
LSM14B-204ENST00000370915 CUL7Q14999 1698 aa45.15■■■■■ 4.82
LSM14B-204ENST00000370915 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.13■■■■■ 4.82
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