RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446817.1

HLA-V-202, Transcript of major histocompatibility complex, class I, V (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene HLA-V, Length 847 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-V-202ENST00000446817 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.02■■■■■ 8
HLA-V-202ENST00000446817 ABCC9O60706 1549 aa59.06■■■■■ 7.05
HLA-V-202ENST00000446817 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa58.67■■■■■ 6.98
HLA-V-202ENST00000446817 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56.05■■■■■ 6.56
HLA-V-202ENST00000446817 DNAJC5BQ9UF47 199 aa55.65■■■■■ 6.5
HLA-V-202ENST00000446817 NACADO15069 1562 aa55.5■■■■■ 6.48
HLA-V-202ENST00000446817 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.18■■■■■ 6.42
HLA-V-202ENST00000446817 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.89■■■■■ 6.38
HLA-V-202ENST00000446817 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.86■■■■■ 6.37
HLA-V-202ENST00000446817 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.5■■■■■ 6.32
HLA-V-202ENST00000446817 BICRAQ9NZM4 1560 aa54.35■■■■■ 6.29
HLA-V-202ENST00000446817 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.78■■■■■ 6.2
HLA-V-202ENST00000446817 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.65■■■■■ 6.18
HLA-V-202ENST00000446817 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.58■■■■■ 6.17
HLA-V-202ENST00000446817 SCRIBQ14160 1630 aa53.44■■■■■ 6.15
HLA-V-202ENST00000446817 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa53.35■■■■■ 6.13
HLA-V-202ENST00000446817 CECR2Q9BXF3 1484 aa53.23■■■■■ 6.11
HLA-V-202ENST00000446817 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP53.1■■■■■ 6.09
HLA-V-202ENST00000446817 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa51.49■■■■■ 5.83
HLA-V-202ENST00000446817 NCAPD3P42695 1498 aa51.16■■■■■ 5.78
HLA-V-202ENST00000446817 ERCC6Q03468 1493 aa51.09■■■■■ 5.77
HLA-V-202ENST00000446817 CUX2O14529 1486 aa51.07■■■■■ 5.77
HLA-V-202ENST00000446817 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.97■■■■■ 5.75
HLA-V-202ENST00000446817 SMARCA4P51532 1647 aa50.9■■■■■ 5.74
HLA-V-202ENST00000446817 SMARCA2P51531 1590 aa50.89■■■■■ 5.74
HLA-V-202ENST00000446817 HMGXB3Q12766 1538 aa50.82■■■■■ 5.73
HLA-V-202ENST00000446817 NESP48681 1621 aa50.58■■■■■ 5.69
HLA-V-202ENST00000446817 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.55■■■■■ 5.68
HLA-V-202ENST00000446817 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.53■■■■■ 5.68
HLA-V-202ENST00000446817 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.32■■■■■ 5.65
HLA-V-202ENST00000446817 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP50.2■■■■■ 5.63
HLA-V-202ENST00000446817 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.2■■■■■ 5.63
HLA-V-202ENST00000446817 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.1■■■■■ 5.61
HLA-V-202ENST00000446817 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa50.05■■■■■ 5.6
HLA-V-202ENST00000446817 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.88■■■■■ 5.58
HLA-V-202ENST00000446817 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.61■■■■■ 5.53
HLA-V-202ENST00000446817 WIZO95785 1651 aa49.56■■■■■ 5.52
HLA-V-202ENST00000446817 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.5■■■■■ 5.51
HLA-V-202ENST00000446817 WDR62O43379 1518 aa49.37■■■■■ 5.49
HLA-V-202ENST00000446817 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.23■■■■■ 5.47
HLA-V-202ENST00000446817 TRIM41Q8WV44 630 aa49.18■■■■■ 5.46
HLA-V-202ENST00000446817 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.1■■■■■ 5.45
HLA-V-202ENST00000446817 CFTRP13569 1480 aa48.94■■■■■ 5.43
HLA-V-202ENST00000446817 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.86■■■■■ 5.41
HLA-V-202ENST00000446817 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.85■■■■■ 5.41
HLA-V-202ENST00000446817 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.71■■■■■ 5.39
HLA-V-202ENST00000446817 PRDM2Q13029 1718 aa48.67■■■■■ 5.38
HLA-V-202ENST00000446817 OSCARQ8IYS5 282 aa48.64■■■■■ 5.38
HLA-V-202ENST00000446817 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.27■■■■■ 5.32
HLA-V-202ENST00000446817 IFT140Q96RY7 1462 aa48.23■■■■■ 5.31
HLA-V-202ENST00000446817 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.17■■■■■ 5.3
HLA-V-202ENST00000446817 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa48.15■■■■■ 5.3
HLA-V-202ENST00000446817 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa48.15■■■■■ 5.3
HLA-V-202ENST00000446817 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa48.15■■■■■ 5.3
HLA-V-202ENST00000446817 TOPBP1Q92547 1522 aa48.12■■■■■ 5.29
HLA-V-202ENST00000446817 ABCC8Q09428 1581 aa48■■■■■ 5.27
HLA-V-202ENST00000446817 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.98■■■■■ 5.27
HLA-V-202ENST00000446817 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.95■■■■■ 5.27
HLA-V-202ENST00000446817 ARHGEF11O15085 1522 aa47.9■■■■■ 5.26
HLA-V-202ENST00000446817 CHD1O14646 1710 aa47.8■■■■■ 5.24
HLA-V-202ENST00000446817 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.74■■■■■ 5.23
HLA-V-202ENST00000446817 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.69■■■■■ 5.22
HLA-V-202ENST00000446817 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.59■■■■■ 5.21
HLA-V-202ENST00000446817 CYB5RLQ6IPT4 315 aa47.56■■■■■ 5.2
HLA-V-202ENST00000446817 FBLN2P98095 1184 aa47.55■■■■■ 5.2
HLA-V-202ENST00000446817 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.42■■■■■ 5.18
HLA-V-202ENST00000446817 ARAP1Q96P48 1450 aa47.37■■■■■ 5.17
HLA-V-202ENST00000446817 SOGA1O94964 1423 aa47.36■■■■■ 5.17
HLA-V-202ENST00000446817 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.32■■■■■ 5.17
HLA-V-202ENST00000446817 TRHP20396 242 aaPredicted RBP47.26■■■■■ 5.16
HLA-V-202ENST00000446817 WDR97A6NE52 1622 aa47.25■■■■■ 5.15
HLA-V-202ENST00000446817 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.25■■■■■ 5.15
HLA-V-202ENST00000446817 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.22■■■■■ 5.15
HLA-V-202ENST00000446817 CUX1P39880 1505 aa47.11■■■■■ 5.13
HLA-V-202ENST00000446817 SYNJ1O43426 1573 aa47.1■■■■■ 5.13
HLA-V-202ENST00000446817 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.09■■■■■ 5.13
HLA-V-202ENST00000446817 CLASP1Q7Z460 1538 aa47.08■■■■■ 5.13
HLA-V-202ENST00000446817 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.08■■■■■ 5.13
HLA-V-202ENST00000446817 GRIN2BQ13224 1484 aa47.02■■■■■ 5.12
HLA-V-202ENST00000446817 PBRM1Q86U86 1689 aa46.95■■■■■ 5.11
HLA-V-202ENST00000446817 SYNJ2O15056 1496 aa46.92■■■■■ 5.1
HLA-V-202ENST00000446817 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.8■■■■■ 5.08
HLA-V-202ENST00000446817 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.68■■■■■ 5.06
HLA-V-202ENST00000446817 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.65■■■■■ 5.06
HLA-V-202ENST00000446817 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.45■■■■■ 5.03
HLA-V-202ENST00000446817 GRIN2AQ12879 1464 aa46.41■■■■■ 5.02
HLA-V-202ENST00000446817 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.39■■■■■ 5.02
HLA-V-202ENST00000446817 ADAMTS12P58397 1594 aa46.38■■■■■ 5.01
HLA-V-202ENST00000446817 ERCC6L2Q5T890 1561 aa46.33■■■■■ 5.01
HLA-V-202ENST00000446817 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.32■■■■■ 5
HLA-V-202ENST00000446817 CEP170Q5SW79 1584 aa46.29■■■■■ 5
HLA-V-202ENST00000446817 TOP2BQ02880 1626 aa46.28■■■■■ 5
HLA-V-202ENST00000446817 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP46.26■■■■■ 5
HLA-V-202ENST00000446817 NUP160Q12769 1436 aa46.22■■■■■ 4.99
HLA-V-202ENST00000446817 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.17■■■■■ 4.98
HLA-V-202ENST00000446817 SHROOM2Q13796 1616 aa46.14■■■■■ 4.98
HLA-V-202ENST00000446817 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.08■■■■■ 4.97
HLA-V-202ENST00000446817 KIF13AQ9H1H9 1805 aa45.89■■■■■ 4.94
HLA-V-202ENST00000446817 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP45.87■■■■■ 4.93
HLA-V-202ENST00000446817 JPH4Q96JJ6 628 aa45.76■■■■■ 4.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms