Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 GNAS-256ENST00000603546 573 ntTSL 542.36■■■■■ 4.374e-16■■■□□ 15.6
DROSHAQ9NRR4 AGPAT3-207ENST00000445582 582 ntTSL 319.7■□□□□ 0.743e-6■■■□□ 15.6
DROSHAQ9NRR4 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.433e-6■■■□□ 15.6
DROSHAQ9NRR4 SLC26A6-214ENST00000462009 825 ntTSL 330.29■■■□□ 2.442e-8■■■□□ 15.6
DROSHAQ9NRR4 SIRT7-210ENST00000572902 909 ntTSL 332.98■■■□□ 2.871e-6■■■□□ 15.6
DROSHAQ9NRR4 LPAR2-204ENST00000588233 558 ntTSL 333.82■■■■□ 36e-7■■■□□ 15.6
DROSHAQ9NRR4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.236e-7■■■□□ 15.6
DROSHAQ9NRR4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.846e-7■■■□□ 15.6
DROSHAQ9NRR4 ATP8B2-203ENST00000368490 473 ntTSL 335.61■■■■□ 3.296e-7■■■□□ 15.6
DROSHAQ9NRR4 SPPL2B-208ENST00000612623 495 ntTSL 525.92■■□□□ 1.743e-7■■■□□ 15.6
DROSHAQ9NRR4 FSCN1-204ENST00000447103 713 ntTSL 430.3■■■□□ 2.445e-10■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 FSCN1-202ENST00000405801 550 ntTSL 428.84■■■□□ 2.215e-10■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.915e-6■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 SLCO4A1-208ENST00000497209 3092 ntTSL 1 (best)20.3■□□□□ 0.845e-6■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 C20orf24-205ENST00000491113 734 ntTSL 239.98■■■■□ 3.999e-8■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.649e-8■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.579e-8■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.579e-8■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 C20orf24-206ENST00000492721 1044 ntTSL 234.17■■■■□ 3.069e-8■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.749e-8■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.459e-8■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 C20orf24-204ENST00000483815 1170 ntTSL 1 (best)28.55■■■□□ 2.169e-8■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 SIN3A-212ENST00000568919 455 ntTSL 227.78■■■□□ 2.049e-8■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.969e-8■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 SIN3A-206ENST00000565264 510 ntTSL 425.51■■□□□ 1.679e-8■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 TOB1-203ENST00000509385 889 ntTSL 223.31■■□□□ 1.329e-8■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.299e-8■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 PYCR1-213ENST00000584848 949 ntTSL 523.08■■□□□ 1.299e-8■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.989e-8■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.919e-8■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.829e-8■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 C10orf88-201ENST00000368891 2991 ntTSL 219.87■□□□□ 0.779e-8■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.719e-8■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 AL365205.1-203ENST00000335515 2871 ntTSL 219.2■□□□□ 0.669e-8■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 AL365205.1-202ENST00000487182 3043 ntTSL 218.26■□□□□ 0.519e-8■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 RPSA-207ENST00000478027 1227 ntTSL 217.74■□□□□ 0.439e-8■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 RPSA-204ENST00000458478 874 ntTSL 217.68■□□□□ 0.429e-8■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 SIN3A-214ENST00000570115 554 ntTSL 417.5■□□□□ 0.399e-8■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 SIN3A-204ENST00000562776 590 ntTSL 416.82■□□□□ 0.289e-8■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 RPSA-201ENST00000301821 1171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.239e-8■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.092e-6■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.092e-6■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 TOB1-201ENST00000268957 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.059e-8■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 SIN3A-205ENST00000564778 617 ntTSL 215.12■□□□□ 0.019e-8■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 SIN3A-208ENST00000567289 4078 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.089e-8■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 TOMM6-201ENST00000398881 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.19e-8■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 TNS1-220ENST00000611415 6509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.162e-6■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 SIN3A-210ENST00000568309 549 ntTSL 413.47□□□□□ -0.259e-8■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.319e-8■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 SIN3A-201ENST00000360439 5050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.329e-8■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 TNS1-221ENST00000615025 6488 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.352e-6■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 SIN3A-209ENST00000568190 567 ntTSL 412.82□□□□□ -0.369e-8■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 SIN3A-211ENST00000568431 565 ntTSL 512.17□□□□□ -0.469e-8■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 RPSA-202ENST00000443003 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.489e-8■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 RPSA-209ENST00000495394 2058 ntTSL 1 (best)11.65□□□□□ -0.549e-8■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.599e-8■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 TNS1-201ENST00000171887 10331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.812e-6■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC7.86□□□□□ -1.159e-8■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 MAFG-203ENST00000574686 570 ntTSL 534.38■■■■□ 3.092e-7■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 HBE1-201ENST00000292896 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.041e-37■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 IDUA-202ENST00000502829 558 ntTSL 242.72■■■■■ 4.435e-6■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 BSG-209ENST00000574970 570 ntTSL 434.09■■■■□ 3.051e-6■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 BSG-208ENST00000573784 559 ntTSL 429.52■■■□□ 2.321e-6■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.234e-7■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.584e-7■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 TRIM65-202ENST00000540128 886 ntTSL 333.91■■■■□ 3.022e-7■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 TRIM65-203ENST00000540812 385 ntTSL 225.61■■□□□ 1.692e-7■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 TRIM65-204ENST00000543309 865 ntTSL 224.54■■□□□ 1.522e-7■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.772e-7■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.71e-7■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.581e-7■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 C11orf80-209ENST00000527368 812 ntTSL 537.17■■■■□ 3.541e-7■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.351e-7■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 C11orf80-202ENST00000524551 548 ntAPPRIS ALT2 TSL 530.87■■■□□ 2.531e-7■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 C11orf80-217ENST00000534325 583 ntAPPRIS ALT2 TSL 329.46■■■□□ 2.311e-7■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.151e-7■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 C11orf80-211ENST00000531400 367 ntTSL 319.85■□□□□ 0.771e-7■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 CPSF1-205ENST00000531042 580 ntTSL 524.63■■□□□ 1.533e-7■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.13e-7■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.313e-7■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 INPPL1-211ENST00000541544 530 ntTSL 236.47■■■■□ 3.435e-8■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.765e-8■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 RBM14-208ENST00000496694 562 ntTSL 510.49□□□□□ -0.737e-7■■■□□ 15.5
DROSHAQ9NRR4 SNX9-202ENST00000614703 542 ntTSL 415.59■□□□□ 0.098e-7■■■□□ 15.4
DROSHAQ9NRR4 SNX9-203ENST00000614800 553 ntTSL 49.88□□□□□ -0.838e-7■■■□□ 15.4
DROSHAQ9NRR4 NDUFV1-210ENST00000527923 594 ntTSL 231.03■■■□□ 2.565e-7■■■□□ 15.4
DROSHAQ9NRR4 NDUFV1-207ENST00000526169 774 ntTSL 1 (best)30.19■■■□□ 2.425e-7■■■□□ 15.4
DROSHAQ9NRR4 NDUFV1-208ENST00000526770 1748 ntTSL 527.69■■■□□ 2.025e-7■■■□□ 15.4
DROSHAQ9NRR4 NDUFV1-226ENST00000533919 774 ntTSL 323.32■■□□□ 1.325e-7■■■□□ 15.4
DROSHAQ9NRR4 NDUFV1-209ENST00000527355 679 ntTSL 223.32■■□□□ 1.325e-7■■■□□ 15.4
DROSHAQ9NRR4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.041e-6■■■□□ 15.4
DROSHAQ9NRR4 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.951e-6■■■□□ 15.4
DROSHAQ9NRR4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.286e-7■■■□□ 15.4
DROSHAQ9NRR4 TCF3-208ENST00000586318 631 ntTSL 325.5■■□□□ 1.676e-7■■■□□ 15.4
DROSHAQ9NRR4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.041e-15■■■□□ 15.4
DROSHAQ9NRR4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.041e-15■■■□□ 15.4
DROSHAQ9NRR4 UBC-208ENST00000540700 627 ntTSL 225.56■■□□□ 1.681e-15■■■□□ 15.4
DROSHAQ9NRR4 UBC-204ENST00000536661 624 ntTSL 223.03■■□□□ 1.281e-15■■■□□ 15.4
DROSHAQ9NRR4 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.821e-15■■■□□ 15.4
DROSHAQ9NRR4 UBC-214ENST00000546271 559 ntTSL 418.36■□□□□ 0.531e-15■■■□□ 15.4
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