RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368490.2

ATP8B2-203, Transcript of ATPase phospholipid transporting 8B2, humanhuman

TSL 3

Gene ATP8B2, Length 473 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B2-203ENST00000368490 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.23■■■■■ 6.75
ATP8B2-203ENST00000368490 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.17■■■■■ 5.78
ATP8B2-203ENST00000368490 ABCC9O60706 1549 aa50.61■■■■■ 5.69
ATP8B2-203ENST00000368490 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.45■■■■■ 5.35
ATP8B2-203ENST00000368490 NACADO15069 1562 aa48.27■■■■■ 5.32
ATP8B2-203ENST00000368490 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.93■■■■■ 5.26
ATP8B2-203ENST00000368490 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.83■■■■■ 5.25
ATP8B2-203ENST00000368490 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.55■■■■■ 5.2
ATP8B2-203ENST00000368490 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.38■■■■■ 5.18
ATP8B2-203ENST00000368490 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.3■■■■■ 5.16
ATP8B2-203ENST00000368490 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.16■■■■■ 5.14
ATP8B2-203ENST00000368490 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.05■■■■■ 5.12
ATP8B2-203ENST00000368490 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.03■■■■■ 5.12
ATP8B2-203ENST00000368490 SCRIBQ14160 1630 aa46.56■■■■■ 5.04
ATP8B2-203ENST00000368490 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.55■■■■■ 5.04
ATP8B2-203ENST00000368490 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.82■■■■■ 4.93
ATP8B2-203ENST00000368490 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.77■■■■■ 4.92
ATP8B2-203ENST00000368490 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.58■■■■■ 4.89
ATP8B2-203ENST00000368490 NCAPD3P42695 1498 aa44.57■■■■■ 4.73
ATP8B2-203ENST00000368490 SMARCA4P51532 1647 aa44.53■■■■■ 4.72
ATP8B2-203ENST00000368490 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.47■■■■■ 4.71
ATP8B2-203ENST00000368490 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.39■■■■■ 4.7
ATP8B2-203ENST00000368490 SMARCA2P51531 1590 aa44.38■■■■■ 4.69
ATP8B2-203ENST00000368490 HMGXB3Q12766 1538 aa44.28■■■■■ 4.68
ATP8B2-203ENST00000368490 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.16■■■■■ 4.66
ATP8B2-203ENST00000368490 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.07■■■■■ 4.65
ATP8B2-203ENST00000368490 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.03■■■■■ 4.64
ATP8B2-203ENST00000368490 ERCC6Q03468 1493 aa43.67■■■■■ 4.58
ATP8B2-203ENST00000368490 NESP48681 1621 aa43.62■■■■■ 4.57
ATP8B2-203ENST00000368490 WIZO95785 1651 aa43.53■■■■■ 4.56
ATP8B2-203ENST00000368490 CUX2O14529 1486 aa43.51■■■■■ 4.56
ATP8B2-203ENST00000368490 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.46■■■■■ 4.55
ATP8B2-203ENST00000368490 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.36■■■■■ 4.53
ATP8B2-203ENST00000368490 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.21■■■■■ 4.51
ATP8B2-203ENST00000368490 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.19■■■■■ 4.5
ATP8B2-203ENST00000368490 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.13■■■■■ 4.5
ATP8B2-203ENST00000368490 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.08■■■■■ 4.49
ATP8B2-203ENST00000368490 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.07■■■■■ 4.49
ATP8B2-203ENST00000368490 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.9■■■■■ 4.46
ATP8B2-203ENST00000368490 CFTRP13569 1480 aa42.83■■■■■ 4.45
ATP8B2-203ENST00000368490 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.78■■■■■ 4.44
ATP8B2-203ENST00000368490 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.69■■■■■ 4.42
ATP8B2-203ENST00000368490 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.68■■■■■ 4.42
ATP8B2-203ENST00000368490 WDR62O43379 1518 aa42.68■■■■■ 4.42
ATP8B2-203ENST00000368490 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.56■■■■■ 4.4
ATP8B2-203ENST00000368490 PRDM2Q13029 1718 aa42.4■■■■■ 4.38
ATP8B2-203ENST00000368490 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.3■■■■■ 4.36
ATP8B2-203ENST00000368490 TOPBP1Q92547 1522 aa41.94■■■■■ 4.3
ATP8B2-203ENST00000368490 ABCC8Q09428 1581 aa41.93■■■■■ 4.3
ATP8B2-203ENST00000368490 IFT140Q96RY7 1462 aa41.85■■■■■ 4.29
ATP8B2-203ENST00000368490 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.84■■■■■ 4.29
ATP8B2-203ENST00000368490 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.69■■■■■ 4.26
ATP8B2-203ENST00000368490 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.66■■■■■ 4.26
ATP8B2-203ENST00000368490 OSCARQ8IYS5 282 aa41.55■■■■■ 4.24
ATP8B2-203ENST00000368490 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.55■■■■■ 4.24
ATP8B2-203ENST00000368490 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.54■■■■■ 4.24
ATP8B2-203ENST00000368490 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.49■■■■■ 4.23
ATP8B2-203ENST00000368490 CUX1P39880 1505 aa41.39■■■■■ 4.22
ATP8B2-203ENST00000368490 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.36■■■■■ 4.212e-6■■■□□ 17.7
ATP8B2-203ENST00000368490 SOGA1O94964 1423 aa41.35■■■■■ 4.21
ATP8B2-203ENST00000368490 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.34■■■■■ 4.21
ATP8B2-203ENST00000368490 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.34■■■■■ 4.21
ATP8B2-203ENST00000368490 WDR97A6NE52 1622 aa41.22■■■■■ 4.19
ATP8B2-203ENST00000368490 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.18■■■■■ 4.18
ATP8B2-203ENST00000368490 TRIM41Q8WV44 630 aa41.11■■■■■ 4.17
ATP8B2-203ENST00000368490 CHD1O14646 1710 aa41.06■■■■■ 4.16
ATP8B2-203ENST00000368490 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.97■■■■■ 4.15
ATP8B2-203ENST00000368490 GRIN2BQ13224 1484 aa40.96■■■■■ 4.15
ATP8B2-203ENST00000368490 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.94■■■■■ 4.14
ATP8B2-203ENST00000368490 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.94■■■■■ 4.14
ATP8B2-203ENST00000368490 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.94■■■■■ 4.14
ATP8B2-203ENST00000368490 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.94■■■■■ 4.14
ATP8B2-203ENST00000368490 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.93■■■■■ 4.14
ATP8B2-203ENST00000368490 FBLN2P98095 1184 aa40.92■■■■■ 4.14
ATP8B2-203ENST00000368490 ARHGEF11O15085 1522 aa40.89■■■■■ 4.14
ATP8B2-203ENST00000368490 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.88■■■■■ 4.13
ATP8B2-203ENST00000368490 TOP2BQ02880 1626 aa40.87■■■■■ 4.13
ATP8B2-203ENST00000368490 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.87■■■■■ 4.13
ATP8B2-203ENST00000368490 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.86■■■■■ 4.13
ATP8B2-203ENST00000368490 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.82■■■■■ 4.13
ATP8B2-203ENST00000368490 SYNJ1O43426 1573 aa40.8■■■■■ 4.12
ATP8B2-203ENST00000368490 PBRM1Q86U86 1689 aa40.78■■■■■ 4.12
ATP8B2-203ENST00000368490 SYNJ2O15056 1496 aa40.77■■■■■ 4.12
ATP8B2-203ENST00000368490 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.76■■■■■ 4.12
ATP8B2-203ENST00000368490 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.67■■■■■ 4.1
ATP8B2-203ENST00000368490 ARAP1Q96P48 1450 aa40.53■■■■■ 4.08
ATP8B2-203ENST00000368490 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.49■■■■■ 4.07
ATP8B2-203ENST00000368490 ADAMTS12P58397 1594 aa40.48■■■■■ 4.07
ATP8B2-203ENST00000368490 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.44■■■■■ 4.06
ATP8B2-203ENST00000368490 GRIN2AQ12879 1464 aa40.43■■■■■ 4.06
ATP8B2-203ENST00000368490 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.39■■■■■ 4.06
ATP8B2-203ENST00000368490 NUP160Q12769 1436 aa40.31■■■■■ 4.04
ATP8B2-203ENST00000368490 CEP170Q5SW79 1584 aa40.24■■■■■ 4.03
ATP8B2-203ENST00000368490 KIF27Q86VH2 1401 aa40.08■■■■■ 4.01
ATP8B2-203ENST00000368490 SHROOM2Q13796 1616 aa40.06■■■■■ 4
ATP8B2-203ENST00000368490 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.01■■■■■ 4
ATP8B2-203ENST00000368490 IGF1RP08069 1367 aa40.01■■■■■ 4
ATP8B2-203ENST00000368490 CUL7Q14999 1698 aa39.92■■■■□ 3.98
ATP8B2-203ENST00000368490 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.89■■■■□ 3.98
ATP8B2-203ENST00000368490 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.85■■■■□ 3.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.5 ms