RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000171887.8

TNS1-201, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 10,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-201ENST00000171887 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
TNS1-201ENST00000171887 DCAF8L2P0C7V8 631 aa15.11■□□□□ 0.01
TNS1-201ENST00000171887 ERICH6Q7L0X2 663 aa14.65□□□□□ -0.06
TNS1-201ENST00000171887 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
TNS1-201ENST00000171887 MYT1Q01538 1121 aa14.53□□□□□ -0.08
TNS1-201ENST00000171887 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
TNS1-201ENST00000171887 EHMT2Q96KQ7 1210 aa14.37□□□□□ -0.11
TNS1-201ENST00000171887 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
TNS1-201ENST00000171887 APLP2Q06481 763 aa14.32□□□□□ -0.12
TNS1-201ENST00000171887 NEFLP07196 543 aa14.13□□□□□ -0.15
TNS1-201ENST00000171887 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa14.12□□□□□ -0.15
TNS1-201ENST00000171887 PCGF6Q9BYE7 350 aa14.04□□□□□ -0.16
TNS1-201ENST00000171887 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.17
TNS1-201ENST00000171887 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.17
TNS1-201ENST00000171887 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP14.01□□□□□ -0.17
TNS1-201ENST00000171887 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
TNS1-201ENST00000171887 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
TNS1-201ENST00000171887 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
TNS1-201ENST00000171887 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
TNS1-201ENST00000171887 NISCHQ9Y2I1 1504 aa13.61□□□□□ -0.23
TNS1-201ENST00000171887 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
TNS1-201ENST00000171887 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
TNS1-201ENST00000171887 UBTFP17480 764 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
TNS1-201ENST00000171887 TRIM41Q8WV44 630 aa13.42□□□□□ -0.26
TNS1-201ENST00000171887 CLSPNQ9HAW4 1339 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-201ENST00000171887 POLR3GLQ9BT43 218 aa13.37□□□□□ -0.27
TNS1-201ENST00000171887 HRCP23327 699 aa13.3□□□□□ -0.28
TNS1-201ENST00000171887 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
TNS1-201ENST00000171887 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
TNS1-201ENST00000171887 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
TNS1-201ENST00000171887 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
TNS1-201ENST00000171887 MYT1LQ9UL68 1186 aa13.13□□□□□ -0.31
TNS1-201ENST00000171887 ITGAEP38570 1179 aa13.13□□□□□ -0.31
TNS1-201ENST00000171887 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa13.08□□□□□ -0.32
TNS1-201ENST00000171887 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
TNS1-201ENST00000171887 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
TNS1-201ENST00000171887 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
TNS1-201ENST00000171887 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
TNS1-201ENST00000171887 BCANQ96GW7 911 aa13.03□□□□□ -0.32
TNS1-201ENST00000171887 CHIC1Q5VXU3 224 aa13.03□□□□□ -0.32
TNS1-201ENST00000171887 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
TNS1-201ENST00000171887 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
TNS1-201ENST00000171887 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
TNS1-201ENST00000171887 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
TNS1-201ENST00000171887 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa12.95□□□□□ -0.34
TNS1-201ENST00000171887 CANXP27824 592 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
TNS1-201ENST00000171887 BCL11AQ9H165 835 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-201ENST00000171887 ANP32CO43423 234 aa12.85□□□□□ -0.35
TNS1-201ENST00000171887 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
TNS1-201ENST00000171887 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
TNS1-201ENST00000171887 SLC24A1O60721 1099 aa12.79□□□□□ -0.36
TNS1-201ENST00000171887 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
TNS1-201ENST00000171887 NEUROD1Q13562 356 aa12.73□□□□□ -0.37
TNS1-201ENST00000171887 NEFMP07197 916 aa12.71□□□□□ -0.37
TNS1-201ENST00000171887 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
TNS1-201ENST00000171887 TRIM52Q96A61 297 aa12.7□□□□□ -0.38
TNS1-201ENST00000171887 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
TNS1-201ENST00000171887 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa12.7□□□□□ -0.38
TNS1-201ENST00000171887 NBR1Q14596 966 aa12.65□□□□□ -0.38
TNS1-201ENST00000171887 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
TNS1-201ENST00000171887 ARXQ96QS3 562 aa12.62□□□□□ -0.39
TNS1-201ENST00000171887 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
TNS1-201ENST00000171887 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
TNS1-201ENST00000171887 FKBP8Q14318 412 aa12.51□□□□□ -0.41
TNS1-201ENST00000171887 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
TNS1-201ENST00000171887 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
TNS1-201ENST00000171887 CCDC136Q96JN2 1154 aa12.43□□□□□ -0.42
TNS1-201ENST00000171887 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP12.38□□□□□ -0.43
TNS1-201ENST00000171887 ANP32EQ9BTT0 268 aa12.38□□□□□ -0.43
TNS1-201ENST00000171887 BECN1Q14457 450 aa12.38□□□□□ -0.43
TNS1-201ENST00000171887 MYH16Q9H6N6 1097 aa12.36□□□□□ -0.43
TNS1-201ENST00000171887 NCLP19338 710 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
TNS1-201ENST00000171887 PTMAP06454 111 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
TNS1-201ENST00000171887 DDRGK1Q96HY6 314 aa12.35□□□□□ -0.43
TNS1-201ENST00000171887 GOLGA6L22H0YM25 854 aa12.34□□□□□ -0.43
TNS1-201ENST00000171887 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
TNS1-201ENST00000171887 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
TNS1-201ENST00000171887 TONSLQ96HA7 1378 aa12.31□□□□□ -0.44
TNS1-201ENST00000171887 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
TNS1-201ENST00000171887 FAM9BQ8IZU0 186 aa12.31□□□□□ -0.44
TNS1-201ENST00000171887 ERICH6BQ5W0A0 696 aa12.3□□□□□ -0.44
TNS1-201ENST00000171887 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
TNS1-201ENST00000171887 TMC1Q8TDI8 760 aa12.23□□□□□ -0.45
TNS1-201ENST00000171887 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP12.22□□□□□ -0.45
TNS1-201ENST00000171887 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa12.22□□□□□ -0.45
TNS1-201ENST00000171887 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
TNS1-201ENST00000171887 CASC1Q6TDU7 716 aa12.19□□□□□ -0.46
TNS1-201ENST00000171887 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
TNS1-201ENST00000171887 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
TNS1-201ENST00000171887 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
TNS1-201ENST00000171887 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
TNS1-201ENST00000171887 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
TNS1-201ENST00000171887 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
TNS1-201ENST00000171887 TPRNQ4KMQ1 711 aa12.16□□□□□ -0.46
TNS1-201ENST00000171887 STAG3Q9UJ98 1225 aa12.16□□□□□ -0.46
TNS1-201ENST00000171887 MRS2Q9HD23 443 aa12.15□□□□□ -0.47
TNS1-201ENST00000171887 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
TNS1-201ENST00000171887 NRDCO43847 1150 aa12.14□□□□□ -0.47
TNS1-201ENST00000171887 FBLN2P98095 1184 aa12.13□□□□□ -0.47
TNS1-201ENST00000171887 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms