RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615025.4

TNS1-221, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TNS1, Length 6,488 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-221ENST00000615025 DCAF8L2P0C7V8 631 aa19.29■□□□□ 0.68
TNS1-221ENST00000615025 NISCHQ9Y2I1 1504 aa18.08■□□□□ 0.48
TNS1-221ENST00000615025 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
TNS1-221ENST00000615025 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa17.77■□□□□ 0.44
TNS1-221ENST00000615025 EHMT2Q96KQ7 1210 aa17.58■□□□□ 0.4
TNS1-221ENST00000615025 APLP2Q06481 763 aa17.32■□□□□ 0.36
TNS1-221ENST00000615025 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
TNS1-221ENST00000615025 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
TNS1-221ENST00000615025 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
TNS1-221ENST00000615025 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
TNS1-221ENST00000615025 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
TNS1-221ENST00000615025 TRIM41Q8WV44 630 aa16.74■□□□□ 0.27
TNS1-221ENST00000615025 ERICH6Q7L0X2 663 aa16.67■□□□□ 0.26
TNS1-221ENST00000615025 PCGF6Q9BYE7 350 aa16.66■□□□□ 0.26
TNS1-221ENST00000615025 UBTFP17480 764 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
TNS1-221ENST00000615025 MYT1Q01538 1121 aa16.52■□□□□ 0.24
TNS1-221ENST00000615025 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
TNS1-221ENST00000615025 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
TNS1-221ENST00000615025 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
TNS1-221ENST00000615025 MYT1LQ9UL68 1186 aa16.31■□□□□ 0.2
TNS1-221ENST00000615025 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
TNS1-221ENST00000615025 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
TNS1-221ENST00000615025 NEFLP07196 543 aa16.2■□□□□ 0.18
TNS1-221ENST00000615025 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
TNS1-221ENST00000615025 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
TNS1-221ENST00000615025 ITGAEP38570 1179 aa16.1■□□□□ 0.17
TNS1-221ENST00000615025 POLR3GLQ9BT43 218 aa16.02■□□□□ 0.15
TNS1-221ENST00000615025 CHIC1Q5VXU3 224 aa15.98■□□□□ 0.15
TNS1-221ENST00000615025 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TNS1-221ENST00000615025 ABCC9O60706 1549 aa15.9■□□□□ 0.14
TNS1-221ENST00000615025 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP15.89■□□□□ 0.13
TNS1-221ENST00000615025 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
TNS1-221ENST00000615025 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
TNS1-221ENST00000615025 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa15.82■□□□□ 0.12
TNS1-221ENST00000615025 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
TNS1-221ENST00000615025 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
TNS1-221ENST00000615025 FBLN2P98095 1184 aa15.67■□□□□ 0.1
TNS1-221ENST00000615025 TRIM52Q96A61 297 aa15.66■□□□□ 0.1
TNS1-221ENST00000615025 HRCP23327 699 aa15.62■□□□□ 0.09
TNS1-221ENST00000615025 NEUROD1Q13562 356 aa15.5■□□□□ 0.07
TNS1-221ENST00000615025 CLSPNQ9HAW4 1339 aa15.5■□□□□ 0.07
TNS1-221ENST00000615025 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
TNS1-221ENST00000615025 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
TNS1-221ENST00000615025 BCANQ96GW7 911 aa15.42■□□□□ 0.06
TNS1-221ENST00000615025 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
TNS1-221ENST00000615025 ARID3CA6NKF2 412 aa15.38■□□□□ 0.05
TNS1-221ENST00000615025 P3H3Q8IVL6 736 aa15.37■□□□□ 0.05
TNS1-221ENST00000615025 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
TNS1-221ENST00000615025 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
TNS1-221ENST00000615025 SLC24A1O60721 1099 aa15.32■□□□□ 0.04
TNS1-221ENST00000615025 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
TNS1-221ENST00000615025 ANP32CO43423 234 aa15.27■□□□□ 0.03
TNS1-221ENST00000615025 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.03
TNS1-221ENST00000615025 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
TNS1-221ENST00000615025 NEFMP07197 916 aa15.24■□□□□ 0.03
TNS1-221ENST00000615025 CSRNP3Q8WYN3 585 aa15.21■□□□□ 0.03
TNS1-221ENST00000615025 SCRIBQ14160 1630 aa15.2■□□□□ 0.02
TNS1-221ENST00000615025 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP15.18■□□□□ 0.02
TNS1-221ENST00000615025 CANXP27824 592 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
TNS1-221ENST00000615025 PLPPR3Q6T4P5 718 aa15.15■□□□□ 0.02
TNS1-221ENST00000615025 STAG3Q9UJ98 1225 aa15.15■□□□□ 0.02
TNS1-221ENST00000615025 BCL11AQ9H165 835 aa15.14■□□□□ 0.01
TNS1-221ENST00000615025 CHGAP10645 457 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
TNS1-221ENST00000615025 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP14.96□□□□□ -0.022e-8■□□□□ 9.6
TNS1-221ENST00000615025 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
TNS1-221ENST00000615025 TONSLQ96HA7 1378 aa14.95□□□□□ -0.02
TNS1-221ENST00000615025 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa14.91□□□□□ -0.02
TNS1-221ENST00000615025 CHIC2Q9UKJ5 165 aa14.91□□□□□ -0.02
TNS1-221ENST00000615025 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TNS1-221ENST00000615025 TSPY4P0CV99 314 aa14.87□□□□□ -0.03
TNS1-221ENST00000615025 TSPY10P0CW01 314 aa14.87□□□□□ -0.03
TNS1-221ENST00000615025 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
TNS1-221ENST00000615025 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TNS1-221ENST00000615025 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TNS1-221ENST00000615025 MTUS2Q5JR59 1369 aa14.82□□□□□ -0.04
TNS1-221ENST00000615025 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa14.82□□□□□ -0.04
TNS1-221ENST00000615025 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa14.81□□□□□ -0.04
TNS1-221ENST00000615025 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa14.8□□□□□ -0.04
TNS1-221ENST00000615025 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa14.79□□□□□ -0.04
TNS1-221ENST00000615025 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
TNS1-221ENST00000615025 KCNH8Q96L42 1107 aa14.77□□□□□ -0.05
TNS1-221ENST00000615025 FAM9BQ8IZU0 186 aa14.76□□□□□ -0.05
TNS1-221ENST00000615025 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
TNS1-221ENST00000615025 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TNS1-221ENST00000615025 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TNS1-221ENST00000615025 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TNS1-221ENST00000615025 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
TNS1-221ENST00000615025 A0A0G2JS52 829 aa14.72□□□□□ -0.05
TNS1-221ENST00000615025 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TNS1-221ENST00000615025 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
TNS1-221ENST00000615025 TMC1Q8TDI8 760 aa14.71□□□□□ -0.05
TNS1-221ENST00000615025 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TNS1-221ENST00000615025 ZBTB7CA1YPR0 619 aa14.7□□□□□ -0.06
TNS1-221ENST00000615025 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TNS1-221ENST00000615025 PLEKHD1A6NEE1 506 aa14.7□□□□□ -0.06
TNS1-221ENST00000615025 C14orf37Q86TY3 774 aa14.68□□□□□ -0.06
TNS1-221ENST00000615025 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TNS1-221ENST00000615025 PLEKHG5O94827 1062 aa14.67□□□□□ -0.06
TNS1-221ENST00000615025 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TNS1-221ENST00000615025 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms