RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574970.2

BSG-209, Transcript of basigin (Ok blood group), humanhuman

TSL 4

Gene BSG, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSG-209ENST00000574970 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.35■■■■■ 6.29
BSG-209ENST00000574970 ABCC9O60706 1549 aa48.73■■■■■ 5.39
BSG-209ENST00000574970 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.63■■■■■ 5.38
BSG-209ENST00000574970 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.3■■■■■ 5
BSG-209ENST00000574970 NACADO15069 1562 aa46.01■■■■■ 4.96
BSG-209ENST00000574970 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.85■■■■■ 4.93
BSG-209ENST00000574970 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.85■■■■■ 4.93
BSG-209ENST00000574970 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.44■■■■■ 4.86
BSG-209ENST00000574970 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.42■■■■■ 4.86
BSG-209ENST00000574970 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.29■■■■■ 4.84
BSG-209ENST00000574970 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.08■■■■■ 4.81
BSG-209ENST00000574970 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.05■■■■■ 4.8
BSG-209ENST00000574970 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.86■■■■■ 4.77
BSG-209ENST00000574970 SCRIBQ14160 1630 aa44.39■■■■■ 4.7
BSG-209ENST00000574970 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.33■■■■■ 4.69
BSG-209ENST00000574970 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.99■■■■■ 4.63
BSG-209ENST00000574970 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.92■■■■■ 4.62
BSG-209ENST00000574970 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.87■■■■■ 4.61
BSG-209ENST00000574970 NCAPD3P42695 1498 aa42.56■■■■■ 4.4
BSG-209ENST00000574970 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.44■■■■■ 4.38
BSG-209ENST00000574970 SMARCA4P51532 1647 aa42.35■■■■■ 4.37
BSG-209ENST00000574970 SMARCA2P51531 1590 aa42.22■■■■■ 4.35
BSG-209ENST00000574970 HMGXB3Q12766 1538 aa42.18■■■■■ 4.34
BSG-209ENST00000574970 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.12■■■■■ 4.33
BSG-209ENST00000574970 ERCC6Q03468 1493 aa41.98■■■■■ 4.31
BSG-209ENST00000574970 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.97■■■■■ 4.31
BSG-209ENST00000574970 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.97■■■■■ 4.31
BSG-209ENST00000574970 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.95■■■■■ 4.31
BSG-209ENST00000574970 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.93■■■■■ 4.3
BSG-209ENST00000574970 CUX2O14529 1486 aa41.92■■■■■ 4.3
BSG-209ENST00000574970 NESP48681 1621 aa41.91■■■■■ 4.3
BSG-209ENST00000574970 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.51■■■■■ 4.24
BSG-209ENST00000574970 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.42■■■■■ 4.22
BSG-209ENST00000574970 WIZO95785 1651 aa41.38■■■■■ 4.21
BSG-209ENST00000574970 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.28■■■■■ 4.2
BSG-209ENST00000574970 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.28■■■■■ 4.2
BSG-209ENST00000574970 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.26■■■■■ 4.2
BSG-209ENST00000574970 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.08■■■■■ 4.17
BSG-209ENST00000574970 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.95■■■■■ 4.15
BSG-209ENST00000574970 WDR62O43379 1518 aa40.86■■■■■ 4.13
BSG-209ENST00000574970 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.83■■■■■ 4.13
BSG-209ENST00000574970 CFTRP13569 1480 aa40.81■■■■■ 4.12
BSG-209ENST00000574970 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.77■■■■■ 4.12
BSG-209ENST00000574970 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.77■■■■■ 4.12
BSG-209ENST00000574970 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.48■■■■■ 4.07
BSG-209ENST00000574970 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.44■■■■■ 4.06
BSG-209ENST00000574970 PRDM2Q13029 1718 aa40.24■■■■■ 4.03
BSG-209ENST00000574970 TRIM41Q8WV44 630 aa40.09■■■■■ 4.01
BSG-209ENST00000574970 OSCARQ8IYS5 282 aa40.05■■■■■ 4
BSG-209ENST00000574970 TOPBP1Q92547 1522 aa40.01■■■■■ 4
BSG-209ENST00000574970 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.99■■■■□ 3.99
BSG-209ENST00000574970 IFT140Q96RY7 1462 aa39.97■■■■□ 3.99
BSG-209ENST00000574970 ABCC8Q09428 1581 aa39.84■■■■□ 3.97
BSG-209ENST00000574970 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.82■■■■□ 3.97
BSG-209ENST00000574970 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.67■■■■□ 3.94
BSG-209ENST00000574970 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.66■■■■□ 3.94
BSG-209ENST00000574970 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.63■■■■□ 3.943e-8■■■■□ 23.9
BSG-209ENST00000574970 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.62■■■■□ 3.93
BSG-209ENST00000574970 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.51■■■■□ 3.92
BSG-209ENST00000574970 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.51■■■■□ 3.92
BSG-209ENST00000574970 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.51■■■■□ 3.92
BSG-209ENST00000574970 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.51■■■■□ 3.92
BSG-209ENST00000574970 SOGA1O94964 1423 aa39.43■■■■□ 3.9
BSG-209ENST00000574970 ARHGEF11O15085 1522 aa39.4■■■■□ 3.9
BSG-209ENST00000574970 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.39■■■■□ 3.9
BSG-209ENST00000574970 CUX1P39880 1505 aa39.37■■■■□ 3.89
BSG-209ENST00000574970 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.37■■■■□ 3.89
BSG-209ENST00000574970 CHD1O14646 1710 aa39.35■■■■□ 3.89
BSG-209ENST00000574970 FBLN2P98095 1184 aa39.29■■■■□ 3.88
BSG-209ENST00000574970 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.25■■■■□ 3.87
BSG-209ENST00000574970 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.17■■■■□ 3.86
BSG-209ENST00000574970 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.15■■■■□ 3.86
BSG-209ENST00000574970 WDR97A6NE52 1622 aa39.14■■■■□ 3.86
BSG-209ENST00000574970 ARAP1Q96P48 1450 aa39.06■■■■□ 3.84
BSG-209ENST00000574970 GRIN2BQ13224 1484 aa39.05■■■■□ 3.84
BSG-209ENST00000574970 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.03■■■■□ 3.84
BSG-209ENST00000574970 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.01■■■■□ 3.84
BSG-209ENST00000574970 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.97■■■■□ 3.83
BSG-209ENST00000574970 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.93■■■■□ 3.82
BSG-209ENST00000574970 SYNJ2O15056 1496 aa38.92■■■■□ 3.82
BSG-209ENST00000574970 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.92■■■■□ 3.82
BSG-209ENST00000574970 SYNJ1O43426 1573 aa38.86■■■■□ 3.81
BSG-209ENST00000574970 PBRM1Q86U86 1689 aa38.84■■■■□ 3.81
BSG-209ENST00000574970 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.83■■■■□ 3.81
BSG-209ENST00000574970 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.73■■■■□ 3.79
BSG-209ENST00000574970 TOP2BQ02880 1626 aa38.68■■■■□ 3.78
BSG-209ENST00000574970 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.67■■■■□ 3.78
BSG-209ENST00000574970 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.63■■■■□ 3.77
BSG-209ENST00000574970 GRIN2AQ12879 1464 aa38.57■■■■□ 3.76
BSG-209ENST00000574970 ADAMTS12P58397 1594 aa38.53■■■■□ 3.76
BSG-209ENST00000574970 NUP160Q12769 1436 aa38.47■■■■□ 3.75
BSG-209ENST00000574970 CEP170Q5SW79 1584 aa38.45■■■■□ 3.75
BSG-209ENST00000574970 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.44■■■■□ 3.74
BSG-209ENST00000574970 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.44■■■■□ 3.74
BSG-209ENST00000574970 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.39■■■■□ 3.74
BSG-209ENST00000574970 SHROOM2Q13796 1616 aa38.25■■■■□ 3.71
BSG-209ENST00000574970 JPH4Q96JJ6 628 aa38.09■■■■□ 3.69
BSG-209ENST00000574970 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.07■■■■□ 3.69
BSG-209ENST00000574970 IGF1RP08069 1367 aa38.02■■■■□ 3.68
BSG-209ENST00000574970 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.99■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms