RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430930.5

TNS1-207, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 5,900 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-207ENST00000430930 DCAF8L2P0C7V8 631 aa22.43■■□□□ 1.18
TNS1-207ENST00000430930 NISCHQ9Y2I1 1504 aa21.55■■□□□ 1.04
TNS1-207ENST00000430930 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
TNS1-207ENST00000430930 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa20.87■□□□□ 0.93
TNS1-207ENST00000430930 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
TNS1-207ENST00000430930 APLP2Q06481 763 aa20.59■□□□□ 0.89
TNS1-207ENST00000430930 EHMT2Q96KQ7 1210 aa20.52■□□□□ 0.87
TNS1-207ENST00000430930 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
TNS1-207ENST00000430930 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
TNS1-207ENST00000430930 PCGF6Q9BYE7 350 aa19.91■□□□□ 0.78
TNS1-207ENST00000430930 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
TNS1-207ENST00000430930 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
TNS1-207ENST00000430930 TRIM41Q8WV44 630 aa19.87■□□□□ 0.77
TNS1-207ENST00000430930 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
TNS1-207ENST00000430930 ERICH6Q7L0X2 663 aa19.77■□□□□ 0.76
TNS1-207ENST00000430930 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
TNS1-207ENST00000430930 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
TNS1-207ENST00000430930 UBTFP17480 764 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
TNS1-207ENST00000430930 NEFLP07196 543 aa19.51■□□□□ 0.71
TNS1-207ENST00000430930 MYT1Q01538 1121 aa19.31■□□□□ 0.68
TNS1-207ENST00000430930 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.67
TNS1-207ENST00000430930 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
TNS1-207ENST00000430930 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
TNS1-207ENST00000430930 MYT1LQ9UL68 1186 aa19.03■□□□□ 0.64
TNS1-207ENST00000430930 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
TNS1-207ENST00000430930 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
TNS1-207ENST00000430930 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
TNS1-207ENST00000430930 HRCP23327 699 aa18.93■□□□□ 0.62
TNS1-207ENST00000430930 ITGAEP38570 1179 aa18.93■□□□□ 0.62
TNS1-207ENST00000430930 POLR3GLQ9BT43 218 aa18.88■□□□□ 0.61
TNS1-207ENST00000430930 CHIC1Q5VXU3 224 aa18.85■□□□□ 0.61
TNS1-207ENST00000430930 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa18.75■□□□□ 0.59
TNS1-207ENST00000430930 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
TNS1-207ENST00000430930 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
TNS1-207ENST00000430930 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
TNS1-207ENST00000430930 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
TNS1-207ENST00000430930 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
TNS1-207ENST00000430930 TRIM52Q96A61 297 aa18.5■□□□□ 0.55
TNS1-207ENST00000430930 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
TNS1-207ENST00000430930 CLSPNQ9HAW4 1339 aa18.48■□□□□ 0.55
TNS1-207ENST00000430930 ABCC9O60706 1549 aa18.46■□□□□ 0.55
TNS1-207ENST00000430930 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP18.38■□□□□ 0.53
TNS1-207ENST00000430930 ANP32CO43423 234 aa18.35■□□□□ 0.53
TNS1-207ENST00000430930 NEUROD1Q13562 356 aa18.34■□□□□ 0.53
TNS1-207ENST00000430930 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
TNS1-207ENST00000430930 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
TNS1-207ENST00000430930 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
TNS1-207ENST00000430930 FBLN2P98095 1184 aa18.17■□□□□ 0.5
TNS1-207ENST00000430930 NEFMP07197 916 aa18.14■□□□□ 0.49
TNS1-207ENST00000430930 CANXP27824 592 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
TNS1-207ENST00000430930 CSRNP3Q8WYN3 585 aa18.1■□□□□ 0.49
TNS1-207ENST00000430930 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa18.07■□□□□ 0.48
TNS1-207ENST00000430930 BCANQ96GW7 911 aa18.05■□□□□ 0.48
TNS1-207ENST00000430930 P3H3Q8IVL6 736 aa17.96■□□□□ 0.47
TNS1-207ENST00000430930 SLC24A1O60721 1099 aa17.96■□□□□ 0.47
TNS1-207ENST00000430930 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
TNS1-207ENST00000430930 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
TNS1-207ENST00000430930 SCRIBQ14160 1630 aa17.9■□□□□ 0.46
TNS1-207ENST00000430930 TONSLQ96HA7 1378 aa17.89■□□□□ 0.45
TNS1-207ENST00000430930 ARID3CA6NKF2 412 aa17.87■□□□□ 0.45
TNS1-207ENST00000430930 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
TNS1-207ENST00000430930 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
TNS1-207ENST00000430930 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
TNS1-207ENST00000430930 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa17.84■□□□□ 0.45
TNS1-207ENST00000430930 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa17.77■□□□□ 0.43
TNS1-207ENST00000430930 BCL11AQ9H165 835 aa17.76■□□□□ 0.43
TNS1-207ENST00000430930 STAG3Q9UJ98 1225 aa17.76■□□□□ 0.43
TNS1-207ENST00000430930 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP17.75■□□□□ 0.43
TNS1-207ENST00000430930 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
TNS1-207ENST00000430930 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
TNS1-207ENST00000430930 CHGAP10645 457 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
TNS1-207ENST00000430930 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP17.66■□□□□ 0.42
TNS1-207ENST00000430930 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
TNS1-207ENST00000430930 FKBP8Q14318 412 aa17.64■□□□□ 0.41
TNS1-207ENST00000430930 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP17.64■□□□□ 0.41
TNS1-207ENST00000430930 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
TNS1-207ENST00000430930 MTUS2Q5JR59 1369 aa17.59■□□□□ 0.41
TNS1-207ENST00000430930 TSPY4P0CV99 314 aa17.58■□□□□ 0.41
TNS1-207ENST00000430930 TSPY10P0CW01 314 aa17.58■□□□□ 0.41
TNS1-207ENST00000430930 FAM9BQ8IZU0 186 aa17.58■□□□□ 0.41
TNS1-207ENST00000430930 TMC1Q8TDI8 760 aa17.58■□□□□ 0.4
TNS1-207ENST00000430930 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP17.57■□□□□ 0.4
TNS1-207ENST00000430930 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
TNS1-207ENST00000430930 EEA1Q15075 1411 aa17.55■□□□□ 0.4
TNS1-207ENST00000430930 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa17.53■□□□□ 0.4
TNS1-207ENST00000430930 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP17.53■□□□□ 0.42e-8■□□□□ 9.6
TNS1-207ENST00000430930 CHIC2Q9UKJ5 165 aa17.52■□□□□ 0.4
TNS1-207ENST00000430930 CLIP1P30622 1438 aa17.52■□□□□ 0.4
TNS1-207ENST00000430930 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.39
TNS1-207ENST00000430930 CCDC136Q96JN2 1154 aa17.5■□□□□ 0.39
TNS1-207ENST00000430930 GOLGA3Q08378 1498 aa17.47■□□□□ 0.39
TNS1-207ENST00000430930 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
TNS1-207ENST00000430930 MRS2Q9HD23 443 aa17.46■□□□□ 0.39
TNS1-207ENST00000430930 MYH16Q9H6N6 1097 aa17.43■□□□□ 0.38
TNS1-207ENST00000430930 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP17.42■□□□□ 0.381e-8■■■■■ 49.3
TNS1-207ENST00000430930 PLPPR3Q6T4P5 718 aa17.42■□□□□ 0.38
TNS1-207ENST00000430930 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa17.41■□□□□ 0.38
TNS1-207ENST00000430930 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
TNS1-207ENST00000430930 CEP162Q5TB80 1403 aa17.33■□□□□ 0.36
TNS1-207ENST00000430930 NACADO15069 1562 aa17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms