Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SLC4A4Q9Y6R1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SLC4A4Q9Y6R1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SLC4A4Q9Y6R1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.53
SLC4A4Q9Y6R1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.53
SLC4A4Q9Y6R1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SLC4A4Q9Y6R1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SLC4A4Q9Y6R1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SLC4A4Q9Y6R1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SLC4A4Q9Y6R1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SLC4A4Q9Y6R1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SLC4A4Q9Y6R1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SLC4A4Q9Y6R1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SLC4A4Q9Y6R1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SLC4A4Q9Y6R1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SLC4A4Q9Y6R1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SLC4A4Q9Y6R1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SLC4A4Q9Y6R1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SLC4A4Q9Y6R1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SLC4A4Q9Y6R1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SLC4A4Q9Y6R1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SLC4A4Q9Y6R1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SLC4A4Q9Y6R1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SLC4A4Q9Y6R1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SLC4A4Q9Y6R1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
SLC4A4Q9Y6R1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SLC4A4Q9Y6R1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SLC4A4Q9Y6R1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SLC4A4Q9Y6R1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
SLC4A4Q9Y6R1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SLC4A4Q9Y6R1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SLC4A4Q9Y6R1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SLC4A4Q9Y6R1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SLC4A4Q9Y6R1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
SLC4A4Q9Y6R1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SLC4A4Q9Y6R1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
SLC4A4Q9Y6R1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SLC4A4Q9Y6R1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SLC4A4Q9Y6R1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SLC4A4Q9Y6R1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
SLC4A4Q9Y6R1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SLC4A4Q9Y6R1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SLC4A4Q9Y6R1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
SLC4A4Q9Y6R1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SLC4A4Q9Y6R1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SLC4A4Q9Y6R1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SLC4A4Q9Y6R1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SLC4A4Q9Y6R1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SLC4A4Q9Y6R1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SLC4A4Q9Y6R1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SLC4A4Q9Y6R1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SLC4A4Q9Y6R1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SLC4A4Q9Y6R1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SLC4A4Q9Y6R1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SLC4A4Q9Y6R1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SLC4A4Q9Y6R1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SLC4A4Q9Y6R1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SLC4A4Q9Y6R1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SLC4A4Q9Y6R1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SLC4A4Q9Y6R1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SLC4A4Q9Y6R1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SLC4A4Q9Y6R1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
SLC4A4Q9Y6R1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
SLC4A4Q9Y6R1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SLC4A4Q9Y6R1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
SLC4A4Q9Y6R1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SLC4A4Q9Y6R1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SLC4A4Q9Y6R1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SLC4A4Q9Y6R1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SLC4A4Q9Y6R1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SLC4A4Q9Y6R1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SLC4A4Q9Y6R1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SLC4A4Q9Y6R1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SLC4A4Q9Y6R1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SLC4A4Q9Y6R1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SLC4A4Q9Y6R1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SLC4A4Q9Y6R1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SLC4A4Q9Y6R1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SLC4A4Q9Y6R1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SLC4A4Q9Y6R1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SLC4A4Q9Y6R1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
SLC4A4Q9Y6R1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SLC4A4Q9Y6R1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SLC4A4Q9Y6R1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SLC4A4Q9Y6R1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SLC4A4Q9Y6R1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SLC4A4Q9Y6R1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SLC4A4Q9Y6R1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SLC4A4Q9Y6R1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
SLC4A4Q9Y6R1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SLC4A4Q9Y6R1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SLC4A4Q9Y6R1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SLC4A4Q9Y6R1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SLC4A4Q9Y6R1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SLC4A4Q9Y6R1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SLC4A4Q9Y6R1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms