RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376918.7

EMC10-202, Transcript of ER membrane protein complex subunit 10, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene EMC10, Length 2,014 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC10-202ENST00000376918 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.53■■■■■ 6.8
EMC10-202ENST00000376918 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.73■■■■■ 5.55
EMC10-202ENST00000376918 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.5■■■■■ 5.36
EMC10-202ENST00000376918 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.66■■■■■ 5.22
EMC10-202ENST00000376918 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.51■■■■■ 5.2
EMC10-202ENST00000376918 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.36■■■■■ 5.17
EMC10-202ENST00000376918 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.61■■■■■ 5.05
EMC10-202ENST00000376918 ABCC9O60706 1549 aa46.41■■■■■ 5.02
EMC10-202ENST00000376918 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.24■■■■■ 4.99
EMC10-202ENST00000376918 NACADO15069 1562 aa46.13■■■■■ 4.98
EMC10-202ENST00000376918 SCRIBQ14160 1630 aa45.97■■■■■ 4.95
EMC10-202ENST00000376918 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.56■■■■■ 4.88
EMC10-202ENST00000376918 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.98■■■■■ 4.79
EMC10-202ENST00000376918 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.71■■■■■ 4.75
EMC10-202ENST00000376918 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.69■■■■■ 4.75
EMC10-202ENST00000376918 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.65■■■■■ 4.74
EMC10-202ENST00000376918 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.52■■■■■ 4.72
EMC10-202ENST00000376918 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.35■■■■■ 4.69
EMC10-202ENST00000376918 WIZO95785 1651 aa44.21■■■■■ 4.67
EMC10-202ENST00000376918 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.21■■■■■ 4.67
EMC10-202ENST00000376918 SMARCA4P51532 1647 aa44.07■■■■■ 4.64
EMC10-202ENST00000376918 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.97■■■■■ 4.63
EMC10-202ENST00000376918 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.73■■■■■ 4.59
EMC10-202ENST00000376918 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.44■■■■■ 4.54
EMC10-202ENST00000376918 SMARCA2P51531 1590 aa43.37■■■■■ 4.53
EMC10-202ENST00000376918 TRIM41Q8WV44 630 aa43.37■■■■■ 4.53
EMC10-202ENST00000376918 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.35■■■■■ 4.53
EMC10-202ENST00000376918 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.33■■■■■ 4.53
EMC10-202ENST00000376918 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.13■■■■■ 4.5
EMC10-202ENST00000376918 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.03■■■■■ 4.48
EMC10-202ENST00000376918 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.95■■■■■ 4.47
EMC10-202ENST00000376918 ABCC8Q09428 1581 aa42.73■■■■■ 4.43
EMC10-202ENST00000376918 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.67■■■■■ 4.42
EMC10-202ENST00000376918 HMGXB3Q12766 1538 aa42.6■■■■■ 4.41
EMC10-202ENST00000376918 NCAPD3P42695 1498 aa42.59■■■■■ 4.41
EMC10-202ENST00000376918 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.31■■■■■ 4.36
EMC10-202ENST00000376918 SYNJ1O43426 1573 aa42.13■■■■■ 4.33
EMC10-202ENST00000376918 EEA1Q15075 1411 aa42.11■■■■■ 4.33
EMC10-202ENST00000376918 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.1■■■■■ 4.33
EMC10-202ENST00000376918 SOGA1O94964 1423 aa42.09■■■■■ 4.33
EMC10-202ENST00000376918 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.98■■■■■ 4.31
EMC10-202ENST00000376918 PCGF6Q9BYE7 350 aa41.93■■■■■ 4.3
EMC10-202ENST00000376918 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.89■■■■■ 4.3
EMC10-202ENST00000376918 CFTRP13569 1480 aa41.89■■■■■ 4.3
EMC10-202ENST00000376918 TOP2BQ02880 1626 aa41.85■■■■■ 4.29
EMC10-202ENST00000376918 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.84■■■■■ 4.29
EMC10-202ENST00000376918 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.79■■■■■ 4.28
EMC10-202ENST00000376918 PRDM2Q13029 1718 aa41.71■■■■■ 4.27
EMC10-202ENST00000376918 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP41.68■■■■■ 4.26
EMC10-202ENST00000376918 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.62■■■■■ 4.25
EMC10-202ENST00000376918 GOLGA3Q08378 1498 aa41.6■■■■■ 4.25
EMC10-202ENST00000376918 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.58■■■■■ 4.25
EMC10-202ENST00000376918 CUX1P39880 1505 aa41.58■■■■■ 4.25
EMC10-202ENST00000376918 KIF21BO75037 1637 aa41.54■■■■■ 4.24
EMC10-202ENST00000376918 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.52■■■■■ 4.24
EMC10-202ENST00000376918 CEP162Q5TB80 1403 aa41.5■■■■■ 4.23
EMC10-202ENST00000376918 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.42■■■■■ 4.22
EMC10-202ENST00000376918 HRCP23327 699 aa41.39■■■■■ 4.22
EMC10-202ENST00000376918 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.19■■■■■ 4.18
EMC10-202ENST00000376918 KIF27Q86VH2 1401 aa41.16■■■■■ 4.18
EMC10-202ENST00000376918 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.15■■■■■ 4.18
EMC10-202ENST00000376918 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.09■■■■■ 4.17
EMC10-202ENST00000376918 PRXQ9BXM0 1461 aa41.09■■■■■ 4.17
EMC10-202ENST00000376918 NESP48681 1621 aa41.01■■■■■ 4.16
EMC10-202ENST00000376918 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.01■■■■■ 4.15
EMC10-202ENST00000376918 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.99■■■■■ 4.15
EMC10-202ENST00000376918 CLIP1P30622 1438 aa40.98■■■■■ 4.15
EMC10-202ENST00000376918 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP40.98■■■■■ 4.15
EMC10-202ENST00000376918 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.91■■■■■ 4.14
EMC10-202ENST00000376918 CUX2O14529 1486 aa40.9■■■■■ 4.14
EMC10-202ENST00000376918 TOPBP1Q92547 1522 aa40.8■■■■■ 4.12
EMC10-202ENST00000376918 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.74■■■■■ 4.11
EMC10-202ENST00000376918 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.73■■■■■ 4.11
EMC10-202ENST00000376918 IGF1RP08069 1367 aa40.71■■■■■ 4.11
EMC10-202ENST00000376918 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.68■■■■■ 4.1
EMC10-202ENST00000376918 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
EMC10-202ENST00000376918 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.62■■■■■ 4.09
EMC10-202ENST00000376918 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.6■■■■■ 4.09
EMC10-202ENST00000376918 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.57■■■■■ 4.09
EMC10-202ENST00000376918 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.56■■■■■ 4.08
EMC10-202ENST00000376918 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.54■■■■■ 4.08
EMC10-202ENST00000376918 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.51■■■■■ 4.08
EMC10-202ENST00000376918 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.49■■■■■ 4.07
EMC10-202ENST00000376918 ARAP1Q96P48 1450 aa40.48■■■■■ 4.07
EMC10-202ENST00000376918 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP40.42■■■■■ 4.06
EMC10-202ENST00000376918 WDR97A6NE52 1622 aa40.41■■■■■ 4.06
EMC10-202ENST00000376918 APLP2Q06481 763 aa40.36■■■■■ 4.05
EMC10-202ENST00000376918 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.31■■■■■ 4.04
EMC10-202ENST00000376918 CUL7Q14999 1698 aa40.31■■■■■ 4.04
EMC10-202ENST00000376918 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.23■■■■■ 4.03
EMC10-202ENST00000376918 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.13■■■■■ 4.01
EMC10-202ENST00000376918 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.11■■■■■ 4.01
EMC10-202ENST00000376918 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.1■■■■■ 4.01
EMC10-202ENST00000376918 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.1■■■■■ 4.01
EMC10-202ENST00000376918 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa39.99■■■■□ 3.99
EMC10-202ENST00000376918 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP39.99■■■■□ 3.99
EMC10-202ENST00000376918 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP39.92■■■■□ 3.98
EMC10-202ENST00000376918 EFCAB5A4FU69 1503 aa39.9■■■■□ 3.98
EMC10-202ENST00000376918 WDR62O43379 1518 aa39.87■■■■□ 3.97
EMC10-202ENST00000376918 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP39.87■■■■□ 3.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms