RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378075.3

LRRC10B-201, Transcript of leucine rich repeat containing 10B, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene LRRC10B, Length 2,219 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC10B-201ENST00000378075 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.67■■■■■ 6.5
LRRC10B-201ENST00000378075 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.47■■■■■ 5.19
LRRC10B-201ENST00000378075 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.15■■■■■ 5.14
LRRC10B-201ENST00000378075 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.13■■■■■ 5.14
LRRC10B-201ENST00000378075 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.31■■■■■ 5
LRRC10B-201ENST00000378075 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.87■■■■■ 4.93
LRRC10B-201ENST00000378075 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.65■■■■■ 4.9
LRRC10B-201ENST00000378075 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.27■■■■■ 4.84
LRRC10B-201ENST00000378075 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.1■■■■■ 4.81
LRRC10B-201ENST00000378075 ABCC9O60706 1549 aa44.53■■■■■ 4.72
LRRC10B-201ENST00000378075 SCRIBQ14160 1630 aa44.2■■■■■ 4.67
LRRC10B-201ENST00000378075 HRCP23327 699 aa44.11■■■■■ 4.65
LRRC10B-201ENST00000378075 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.02■■■■■ 4.64
LRRC10B-201ENST00000378075 PCGF6Q9BYE7 350 aa43.85■■■■■ 4.61
LRRC10B-201ENST00000378075 NACADO15069 1562 aa43.78■■■■■ 4.6
LRRC10B-201ENST00000378075 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.76■■■■■ 4.6
LRRC10B-201ENST00000378075 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.67■■■■■ 4.58
LRRC10B-201ENST00000378075 TRIM41Q8WV44 630 aa43.27■■■■■ 4.52
LRRC10B-201ENST00000378075 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.26■■■■■ 4.52
LRRC10B-201ENST00000378075 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP43.2■■■■■ 4.51
LRRC10B-201ENST00000378075 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.19■■■■■ 4.5
LRRC10B-201ENST00000378075 WIZO95785 1651 aa42.99■■■■■ 4.47
LRRC10B-201ENST00000378075 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP42.92■■■■■ 4.46
LRRC10B-201ENST00000378075 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.86■■■■■ 4.45
LRRC10B-201ENST00000378075 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.71■■■■■ 4.43
LRRC10B-201ENST00000378075 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.61■■■■■ 4.41
LRRC10B-201ENST00000378075 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.42■■■■■ 4.38
LRRC10B-201ENST00000378075 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP42.41■■■■■ 4.38
LRRC10B-201ENST00000378075 SMARCA4P51532 1647 aa42.39■■■■■ 4.38
LRRC10B-201ENST00000378075 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.38■■■■■ 4.37
LRRC10B-201ENST00000378075 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.16■■■■■ 4.34
LRRC10B-201ENST00000378075 SMARCA2P51531 1590 aa42.16■■■■■ 4.34
LRRC10B-201ENST00000378075 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.13■■■■■ 4.34
LRRC10B-201ENST00000378075 ABCC8Q09428 1581 aa41.99■■■■■ 4.31
LRRC10B-201ENST00000378075 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.77■■■■■ 4.28
LRRC10B-201ENST00000378075 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.69■■■■■ 4.27
LRRC10B-201ENST00000378075 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.68■■■■■ 4.26
LRRC10B-201ENST00000378075 EEA1Q15075 1411 aa41.68■■■■■ 4.26
LRRC10B-201ENST00000378075 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.61■■■■■ 4.25
LRRC10B-201ENST00000378075 SOGA1O94964 1423 aa41.6■■■■■ 4.25
LRRC10B-201ENST00000378075 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.55■■■■■ 4.24
LRRC10B-201ENST00000378075 CEP162Q5TB80 1403 aa41.55■■■■■ 4.24
LRRC10B-201ENST00000378075 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.42■■■■■ 4.22
LRRC10B-201ENST00000378075 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.37■■■■■ 4.21
LRRC10B-201ENST00000378075 GOLGA3Q08378 1498 aa41.29■■■■■ 4.2
LRRC10B-201ENST00000378075 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.25■■■■■ 4.19
LRRC10B-201ENST00000378075 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP41.22■■■■■ 4.19
LRRC10B-201ENST00000378075 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.21■■■■■ 4.19
LRRC10B-201ENST00000378075 SYNJ1O43426 1573 aa41.16■■■■■ 4.18
LRRC10B-201ENST00000378075 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.15■■■■■ 4.18
LRRC10B-201ENST00000378075 KIF21BO75037 1637 aa41.1■■■■■ 4.17
LRRC10B-201ENST00000378075 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.09■■■■■ 4.17
LRRC10B-201ENST00000378075 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.06■■■■■ 4.16
LRRC10B-201ENST00000378075 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.9■■■■■ 4.14
LRRC10B-201ENST00000378075 CLIP1P30622 1438 aa40.75■■■■■ 4.11
LRRC10B-201ENST00000378075 TOP2BQ02880 1626 aa40.74■■■■■ 4.11
LRRC10B-201ENST00000378075 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.65■■■■■ 4.1
LRRC10B-201ENST00000378075 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.65■■■■■ 4.1
LRRC10B-201ENST00000378075 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.63■■■■■ 4.1
LRRC10B-201ENST00000378075 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP40.6■■■■■ 4.09
LRRC10B-201ENST00000378075 HMGXB3Q12766 1538 aa40.52■■■■■ 4.08
LRRC10B-201ENST00000378075 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP40.51■■■■■ 4.08
LRRC10B-201ENST00000378075 NCAPD3P42695 1498 aa40.45■■■■■ 4.07
LRRC10B-201ENST00000378075 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.43■■■■■ 4.06
LRRC10B-201ENST00000378075 PRXQ9BXM0 1461 aa40.34■■■■■ 4.05
LRRC10B-201ENST00000378075 APLP2Q06481 763 aa40.34■■■■■ 4.05
LRRC10B-201ENST00000378075 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP40.29■■■■■ 4.04
LRRC10B-201ENST00000378075 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP40.25■■■■■ 4.03
LRRC10B-201ENST00000378075 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.24■■■■■ 4.03
LRRC10B-201ENST00000378075 CUX1P39880 1505 aa40.22■■■■■ 4.03
LRRC10B-201ENST00000378075 CFTRP13569 1480 aa40.15■■■■■ 4.02
LRRC10B-201ENST00000378075 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP40.14■■■■■ 4.02
LRRC10B-201ENST00000378075 NEUROD1Q13562 356 aa40.13■■■■■ 4.01
LRRC10B-201ENST00000378075 ARAP1Q96P48 1450 aa40.11■■■■■ 4.01
LRRC10B-201ENST00000378075 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP40.1■■■■■ 4.01
LRRC10B-201ENST00000378075 KIF27Q86VH2 1401 aa40.09■■■■■ 4.01
LRRC10B-201ENST00000378075 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.06■■■■■ 4
LRRC10B-201ENST00000378075 PRDM2Q13029 1718 aa40.02■■■■■ 4
LRRC10B-201ENST00000378075 CLSPNQ9HAW4 1339 aa39.85■■■■□ 3.97
LRRC10B-201ENST00000378075 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.82■■■■□ 3.96
LRRC10B-201ENST00000378075 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP39.77■■■■□ 3.96
LRRC10B-201ENST00000378075 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP39.76■■■■□ 3.95
LRRC10B-201ENST00000378075 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa39.75■■■■□ 3.95
LRRC10B-201ENST00000378075 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa39.73■■■■□ 3.95
LRRC10B-201ENST00000378075 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP39.69■■■■□ 3.94
LRRC10B-201ENST00000378075 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.61■■■■□ 3.93
LRRC10B-201ENST00000378075 CUX2O14529 1486 aa39.61■■■■□ 3.93
LRRC10B-201ENST00000378075 IGF1RP08069 1367 aa39.59■■■■□ 3.93
LRRC10B-201ENST00000378075 MIER1Q8N108 512 aa39.57■■■■□ 3.93
LRRC10B-201ENST00000378075 CCNB3Q8WWL7 1395 aa39.51■■■■□ 3.91
LRRC10B-201ENST00000378075 MAP3K1Q13233 1512 aa39.5■■■■□ 3.91
LRRC10B-201ENST00000378075 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.48■■■■□ 3.91
LRRC10B-201ENST00000378075 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.42■■■■□ 3.9
LRRC10B-201ENST00000378075 TIAM1Q13009 1591 aa39.41■■■■□ 3.9
LRRC10B-201ENST00000378075 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP39.36■■■■□ 3.89
LRRC10B-201ENST00000378075 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa39.22■■■■□ 3.87
LRRC10B-201ENST00000378075 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.22■■■■□ 3.87
LRRC10B-201ENST00000378075 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.21■■■■□ 3.87
LRRC10B-201ENST00000378075 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.19■■■■□ 3.86
LRRC10B-201ENST00000378075 CFAP43Q8NDM7 1665 aa39.18■■■■□ 3.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 313.7 ms