Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF6Q9Y4K3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF6Q9Y4K3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF6Q9Y4K3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF6Q9Y4K3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF6Q9Y4K3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF6Q9Y4K3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF6Q9Y4K3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF6Q9Y4K3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAF6Q9Y4K3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAF6Q9Y4K3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAF6Q9Y4K3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAF6Q9Y4K3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF6Q9Y4K3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF6Q9Y4K3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF6Q9Y4K3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF6Q9Y4K3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF6Q9Y4K3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF6Q9Y4K3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF6Q9Y4K3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF6Q9Y4K3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF6Q9Y4K3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF6Q9Y4K3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAF6Q9Y4K3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAF6Q9Y4K3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAF6Q9Y4K3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAF6Q9Y4K3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAF6Q9Y4K3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAF6Q9Y4K3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF6Q9Y4K3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF6Q9Y4K3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF6Q9Y4K3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF6Q9Y4K3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAF6Q9Y4K3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAF6Q9Y4K3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAF6Q9Y4K3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAF6Q9Y4K3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF6Q9Y4K3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF6Q9Y4K3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF6Q9Y4K3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF6Q9Y4K3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAF6Q9Y4K3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAF6Q9Y4K3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAF6Q9Y4K3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAF6Q9Y4K3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRAF6Q9Y4K3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAF6Q9Y4K3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAF6Q9Y4K3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAF6Q9Y4K3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAF6Q9Y4K3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAF6Q9Y4K3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF6Q9Y4K3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF6Q9Y4K3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF6Q9Y4K3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF6Q9Y4K3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF6Q9Y4K3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF6Q9Y4K3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF6Q9Y4K3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF6Q9Y4K3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF6Q9Y4K3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF6Q9Y4K3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF6Q9Y4K3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF6Q9Y4K3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF6Q9Y4K3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF6Q9Y4K3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF6Q9Y4K3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF6Q9Y4K3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF6Q9Y4K3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF6Q9Y4K3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF6Q9Y4K3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF6Q9Y4K3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF6Q9Y4K3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF6Q9Y4K3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF6Q9Y4K3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF6Q9Y4K3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF6Q9Y4K3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF6Q9Y4K3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF6Q9Y4K3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF6Q9Y4K3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF6Q9Y4K3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF6Q9Y4K3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF6Q9Y4K3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF6Q9Y4K3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF6Q9Y4K3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF6Q9Y4K3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF6Q9Y4K3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF6Q9Y4K3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF6Q9Y4K3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF6Q9Y4K3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF6Q9Y4K3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF6Q9Y4K3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF6Q9Y4K3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF6Q9Y4K3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF6Q9Y4K3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF6Q9Y4K3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF6Q9Y4K3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF6Q9Y4K3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF6Q9Y4K3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF6Q9Y4K3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 827.6 ms