Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFE2L3Q9Y4A8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFE2L3Q9Y4A8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NFE2L3Q9Y4A8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NFE2L3Q9Y4A8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NFE2L3Q9Y4A8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NFE2L3Q9Y4A8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NFE2L3Q9Y4A8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NFE2L3Q9Y4A8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NFE2L3Q9Y4A8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NFE2L3Q9Y4A8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NFE2L3Q9Y4A8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NFE2L3Q9Y4A8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NFE2L3Q9Y4A8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFE2L3Q9Y4A8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NFE2L3Q9Y4A8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NFE2L3Q9Y4A8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NFE2L3Q9Y4A8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NFE2L3Q9Y4A8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFE2L3Q9Y4A8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFE2L3Q9Y4A8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFE2L3Q9Y4A8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFE2L3Q9Y4A8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFE2L3Q9Y4A8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFE2L3Q9Y4A8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFE2L3Q9Y4A8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NFE2L3Q9Y4A8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NFE2L3Q9Y4A8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NFE2L3Q9Y4A8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NFE2L3Q9Y4A8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NFE2L3Q9Y4A8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NFE2L3Q9Y4A8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NFE2L3Q9Y4A8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NFE2L3Q9Y4A8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NFE2L3Q9Y4A8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NFE2L3Q9Y4A8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NFE2L3Q9Y4A8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NFE2L3Q9Y4A8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NFE2L3Q9Y4A8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NFE2L3Q9Y4A8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFE2L3Q9Y4A8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFE2L3Q9Y4A8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFE2L3Q9Y4A8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFE2L3Q9Y4A8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFE2L3Q9Y4A8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFE2L3Q9Y4A8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFE2L3Q9Y4A8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NFE2L3Q9Y4A8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NFE2L3Q9Y4A8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NFE2L3Q9Y4A8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NFE2L3Q9Y4A8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NFE2L3Q9Y4A8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFE2L3Q9Y4A8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NFE2L3Q9Y4A8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NFE2L3Q9Y4A8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NFE2L3Q9Y4A8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NFE2L3Q9Y4A8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NFE2L3Q9Y4A8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NFE2L3Q9Y4A8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NFE2L3Q9Y4A8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NFE2L3Q9Y4A8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NFE2L3Q9Y4A8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NFE2L3Q9Y4A8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFE2L3Q9Y4A8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFE2L3Q9Y4A8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFE2L3Q9Y4A8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFE2L3Q9Y4A8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFE2L3Q9Y4A8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFE2L3Q9Y4A8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFE2L3Q9Y4A8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFE2L3Q9Y4A8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFE2L3Q9Y4A8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFE2L3Q9Y4A8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFE2L3Q9Y4A8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFE2L3Q9Y4A8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NFE2L3Q9Y4A8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NFE2L3Q9Y4A8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NFE2L3Q9Y4A8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NFE2L3Q9Y4A8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NFE2L3Q9Y4A8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFE2L3Q9Y4A8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFE2L3Q9Y4A8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFE2L3Q9Y4A8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFE2L3Q9Y4A8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NFE2L3Q9Y4A8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NFE2L3Q9Y4A8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NFE2L3Q9Y4A8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFE2L3Q9Y4A8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFE2L3Q9Y4A8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFE2L3Q9Y4A8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NFE2L3Q9Y4A8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NFE2L3Q9Y4A8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NFE2L3Q9Y4A8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NFE2L3Q9Y4A8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NFE2L3Q9Y4A8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NFE2L3Q9Y4A8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NFE2L3Q9Y4A8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NFE2L3Q9Y4A8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NFE2L3Q9Y4A8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
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