Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQN3

CHMP2B, Charged multivesicular body protein 2b, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2BQ9UQN3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMP2BQ9UQN3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP2BQ9UQN3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP2BQ9UQN3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP2BQ9UQN3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP2BQ9UQN3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP2BQ9UQN3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP2BQ9UQN3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP2BQ9UQN3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP2BQ9UQN3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP2BQ9UQN3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP2BQ9UQN3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP2BQ9UQN3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP2BQ9UQN3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP2BQ9UQN3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP2BQ9UQN3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP2BQ9UQN3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP2BQ9UQN3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP2BQ9UQN3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP2BQ9UQN3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP2BQ9UQN3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP2BQ9UQN3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP2BQ9UQN3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP2BQ9UQN3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP2BQ9UQN3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP2BQ9UQN3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP2BQ9UQN3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP2BQ9UQN3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP2BQ9UQN3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP2BQ9UQN3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP2BQ9UQN3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP2BQ9UQN3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHMP2BQ9UQN3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHMP2BQ9UQN3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMP2BQ9UQN3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMP2BQ9UQN3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP2BQ9UQN3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP2BQ9UQN3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP2BQ9UQN3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP2BQ9UQN3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP2BQ9UQN3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP2BQ9UQN3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP2BQ9UQN3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP2BQ9UQN3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP2BQ9UQN3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP2BQ9UQN3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP2BQ9UQN3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP2BQ9UQN3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP2BQ9UQN3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP2BQ9UQN3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP2BQ9UQN3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP2BQ9UQN3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP2BQ9UQN3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP2BQ9UQN3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP2BQ9UQN3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP2BQ9UQN3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHMP2BQ9UQN3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP2BQ9UQN3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP2BQ9UQN3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP2BQ9UQN3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP2BQ9UQN3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP2BQ9UQN3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP2BQ9UQN3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP2BQ9UQN3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP2BQ9UQN3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP2BQ9UQN3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMP2BQ9UQN3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP2BQ9UQN3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP2BQ9UQN3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP2BQ9UQN3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP2BQ9UQN3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP2BQ9UQN3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMP2BQ9UQN3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMP2BQ9UQN3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMP2BQ9UQN3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMP2BQ9UQN3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMP2BQ9UQN3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMP2BQ9UQN3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMP2BQ9UQN3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMP2BQ9UQN3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMP2BQ9UQN3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CHMP2BQ9UQN3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP2BQ9UQN3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP2BQ9UQN3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP2BQ9UQN3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP2BQ9UQN3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP2BQ9UQN3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMP2BQ9UQN3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMP2BQ9UQN3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP2BQ9UQN3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP2BQ9UQN3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP2BQ9UQN3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP2BQ9UQN3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP2BQ9UQN3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP2BQ9UQN3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP2BQ9UQN3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP2BQ9UQN3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP2BQ9UQN3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP2BQ9UQN3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP2BQ9UQN3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms