Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MID2Q9UJV3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MID2Q9UJV3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MID2Q9UJV3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MID2Q9UJV3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MID2Q9UJV3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MID2Q9UJV3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MID2Q9UJV3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MID2Q9UJV3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MID2Q9UJV3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MID2Q9UJV3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MID2Q9UJV3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MID2Q9UJV3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MID2Q9UJV3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MID2Q9UJV3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MID2Q9UJV3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MID2Q9UJV3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MID2Q9UJV3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MID2Q9UJV3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MID2Q9UJV3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MID2Q9UJV3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MID2Q9UJV3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MID2Q9UJV3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MID2Q9UJV3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MID2Q9UJV3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MID2Q9UJV3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MID2Q9UJV3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MID2Q9UJV3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MID2Q9UJV3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MID2Q9UJV3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MID2Q9UJV3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MID2Q9UJV3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MID2Q9UJV3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MID2Q9UJV3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MID2Q9UJV3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MID2Q9UJV3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MID2Q9UJV3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MID2Q9UJV3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MID2Q9UJV3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MID2Q9UJV3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MID2Q9UJV3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MID2Q9UJV3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MID2Q9UJV3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MID2Q9UJV3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MID2Q9UJV3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MID2Q9UJV3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MID2Q9UJV3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MID2Q9UJV3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MID2Q9UJV3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MID2Q9UJV3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MID2Q9UJV3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MID2Q9UJV3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MID2Q9UJV3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MID2Q9UJV3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MID2Q9UJV3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MID2Q9UJV3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MID2Q9UJV3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MID2Q9UJV3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MID2Q9UJV3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MID2Q9UJV3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MID2Q9UJV3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
MID2Q9UJV3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MID2Q9UJV3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MID2Q9UJV3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MID2Q9UJV3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MID2Q9UJV3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MID2Q9UJV3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MID2Q9UJV3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MID2Q9UJV3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MID2Q9UJV3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MID2Q9UJV3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MID2Q9UJV3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MID2Q9UJV3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MID2Q9UJV3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MID2Q9UJV3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MID2Q9UJV3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MID2Q9UJV3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MID2Q9UJV3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MID2Q9UJV3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MID2Q9UJV3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MID2Q9UJV3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MID2Q9UJV3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MID2Q9UJV3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MID2Q9UJV3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MID2Q9UJV3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MID2Q9UJV3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MID2Q9UJV3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MID2Q9UJV3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MID2Q9UJV3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MID2Q9UJV3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MID2Q9UJV3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MID2Q9UJV3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MID2Q9UJV3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MID2Q9UJV3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MID2Q9UJV3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MID2Q9UJV3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MID2Q9UJV3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MID2Q9UJV3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MID2Q9UJV3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MID2Q9UJV3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms