Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SALL4Q9UJQ4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SALL4Q9UJQ4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SALL4Q9UJQ4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SALL4Q9UJQ4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SALL4Q9UJQ4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SALL4Q9UJQ4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SALL4Q9UJQ4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SALL4Q9UJQ4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SALL4Q9UJQ4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SALL4Q9UJQ4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SALL4Q9UJQ4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SALL4Q9UJQ4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SALL4Q9UJQ4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SALL4Q9UJQ4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SALL4Q9UJQ4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SALL4Q9UJQ4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SALL4Q9UJQ4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SALL4Q9UJQ4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SALL4Q9UJQ4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SALL4Q9UJQ4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SALL4Q9UJQ4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SALL4Q9UJQ4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SALL4Q9UJQ4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SALL4Q9UJQ4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SALL4Q9UJQ4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SALL4Q9UJQ4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SALL4Q9UJQ4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SALL4Q9UJQ4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SALL4Q9UJQ4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SALL4Q9UJQ4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SALL4Q9UJQ4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SALL4Q9UJQ4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SALL4Q9UJQ4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SALL4Q9UJQ4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SALL4Q9UJQ4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SALL4Q9UJQ4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SALL4Q9UJQ4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SALL4Q9UJQ4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SALL4Q9UJQ4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SALL4Q9UJQ4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SALL4Q9UJQ4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SALL4Q9UJQ4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SALL4Q9UJQ4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SALL4Q9UJQ4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SALL4Q9UJQ4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SALL4Q9UJQ4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SALL4Q9UJQ4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SALL4Q9UJQ4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SALL4Q9UJQ4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SALL4Q9UJQ4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SALL4Q9UJQ4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SALL4Q9UJQ4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SALL4Q9UJQ4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SALL4Q9UJQ4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SALL4Q9UJQ4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SALL4Q9UJQ4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SALL4Q9UJQ4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SALL4Q9UJQ4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SALL4Q9UJQ4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SALL4Q9UJQ4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SALL4Q9UJQ4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SALL4Q9UJQ4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SALL4Q9UJQ4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SALL4Q9UJQ4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SALL4Q9UJQ4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SALL4Q9UJQ4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SALL4Q9UJQ4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SALL4Q9UJQ4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SALL4Q9UJQ4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SALL4Q9UJQ4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SALL4Q9UJQ4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SALL4Q9UJQ4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SALL4Q9UJQ4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SALL4Q9UJQ4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SALL4Q9UJQ4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SALL4Q9UJQ4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SALL4Q9UJQ4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SALL4Q9UJQ4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SALL4Q9UJQ4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SALL4Q9UJQ4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SALL4Q9UJQ4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SALL4Q9UJQ4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SALL4Q9UJQ4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SALL4Q9UJQ4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SALL4Q9UJQ4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SALL4Q9UJQ4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SALL4Q9UJQ4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SALL4Q9UJQ4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SALL4Q9UJQ4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SALL4Q9UJQ4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SALL4Q9UJQ4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SALL4Q9UJQ4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SALL4Q9UJQ4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SALL4Q9UJQ4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SALL4Q9UJQ4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SALL4Q9UJQ4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SALL4Q9UJQ4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SALL4Q9UJQ4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SALL4Q9UJQ4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms