Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms