Protein–RNA interactions for Protein: Q9P032

NDUFAF4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF4Q9P032 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDUFAF4Q9P032 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDUFAF4Q9P032 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDUFAF4Q9P032 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NDUFAF4Q9P032 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDUFAF4Q9P032 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDUFAF4Q9P032 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDUFAF4Q9P032 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDUFAF4Q9P032 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDUFAF4Q9P032 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDUFAF4Q9P032 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDUFAF4Q9P032 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDUFAF4Q9P032 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDUFAF4Q9P032 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFAF4Q9P032 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFAF4Q9P032 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFAF4Q9P032 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFAF4Q9P032 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFAF4Q9P032 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFAF4Q9P032 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFAF4Q9P032 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDUFAF4Q9P032 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDUFAF4Q9P032 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDUFAF4Q9P032 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDUFAF4Q9P032 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDUFAF4Q9P032 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDUFAF4Q9P032 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDUFAF4Q9P032 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NDUFAF4Q9P032 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDUFAF4Q9P032 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDUFAF4Q9P032 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NDUFAF4Q9P032 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NDUFAF4Q9P032 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDUFAF4Q9P032 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDUFAF4Q9P032 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDUFAF4Q9P032 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDUFAF4Q9P032 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDUFAF4Q9P032 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NDUFAF4Q9P032 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDUFAF4Q9P032 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDUFAF4Q9P032 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDUFAF4Q9P032 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDUFAF4Q9P032 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDUFAF4Q9P032 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDUFAF4Q9P032 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDUFAF4Q9P032 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDUFAF4Q9P032 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDUFAF4Q9P032 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDUFAF4Q9P032 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDUFAF4Q9P032 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDUFAF4Q9P032 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDUFAF4Q9P032 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDUFAF4Q9P032 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NDUFAF4Q9P032 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NDUFAF4Q9P032 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDUFAF4Q9P032 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDUFAF4Q9P032 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDUFAF4Q9P032 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDUFAF4Q9P032 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDUFAF4Q9P032 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDUFAF4Q9P032 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDUFAF4Q9P032 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDUFAF4Q9P032 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDUFAF4Q9P032 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDUFAF4Q9P032 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDUFAF4Q9P032 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDUFAF4Q9P032 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDUFAF4Q9P032 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDUFAF4Q9P032 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NDUFAF4Q9P032 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDUFAF4Q9P032 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDUFAF4Q9P032 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDUFAF4Q9P032 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDUFAF4Q9P032 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDUFAF4Q9P032 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDUFAF4Q9P032 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDUFAF4Q9P032 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDUFAF4Q9P032 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDUFAF4Q9P032 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NDUFAF4Q9P032 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDUFAF4Q9P032 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDUFAF4Q9P032 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDUFAF4Q9P032 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDUFAF4Q9P032 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFAF4Q9P032 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDUFAF4Q9P032 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDUFAF4Q9P032 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFAF4Q9P032 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFAF4Q9P032 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFAF4Q9P032 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFAF4Q9P032 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFAF4Q9P032 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFAF4Q9P032 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFAF4Q9P032 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFAF4Q9P032 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFAF4Q9P032 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFAF4Q9P032 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFAF4Q9P032 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFAF4Q9P032 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFAF4Q9P032 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms