Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWU1

OXSM, 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXSMQ9NWU1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OXSMQ9NWU1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OXSMQ9NWU1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OXSMQ9NWU1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OXSMQ9NWU1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
OXSMQ9NWU1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
OXSMQ9NWU1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
OXSMQ9NWU1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
OXSMQ9NWU1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OXSMQ9NWU1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OXSMQ9NWU1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
OXSMQ9NWU1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
OXSMQ9NWU1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
OXSMQ9NWU1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
OXSMQ9NWU1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
OXSMQ9NWU1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
OXSMQ9NWU1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
OXSMQ9NWU1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
OXSMQ9NWU1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
OXSMQ9NWU1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
OXSMQ9NWU1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
OXSMQ9NWU1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
OXSMQ9NWU1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
OXSMQ9NWU1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
OXSMQ9NWU1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
OXSMQ9NWU1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
OXSMQ9NWU1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
OXSMQ9NWU1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OXSMQ9NWU1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OXSMQ9NWU1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OXSMQ9NWU1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OXSMQ9NWU1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OXSMQ9NWU1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OXSMQ9NWU1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OXSMQ9NWU1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
OXSMQ9NWU1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
OXSMQ9NWU1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
OXSMQ9NWU1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
OXSMQ9NWU1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
OXSMQ9NWU1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
OXSMQ9NWU1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
OXSMQ9NWU1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
OXSMQ9NWU1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
OXSMQ9NWU1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
OXSMQ9NWU1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
OXSMQ9NWU1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
OXSMQ9NWU1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
OXSMQ9NWU1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OXSMQ9NWU1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OXSMQ9NWU1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
OXSMQ9NWU1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
OXSMQ9NWU1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OXSMQ9NWU1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OXSMQ9NWU1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OXSMQ9NWU1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
OXSMQ9NWU1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OXSMQ9NWU1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
OXSMQ9NWU1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OXSMQ9NWU1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OXSMQ9NWU1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
OXSMQ9NWU1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OXSMQ9NWU1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OXSMQ9NWU1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OXSMQ9NWU1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
OXSMQ9NWU1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
OXSMQ9NWU1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
OXSMQ9NWU1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
OXSMQ9NWU1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
OXSMQ9NWU1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
OXSMQ9NWU1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OXSMQ9NWU1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OXSMQ9NWU1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
OXSMQ9NWU1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
OXSMQ9NWU1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
OXSMQ9NWU1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OXSMQ9NWU1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OXSMQ9NWU1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
OXSMQ9NWU1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OXSMQ9NWU1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
OXSMQ9NWU1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
OXSMQ9NWU1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25■■□□□ 1.59
OXSMQ9NWU1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
OXSMQ9NWU1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OXSMQ9NWU1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OXSMQ9NWU1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OXSMQ9NWU1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OXSMQ9NWU1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OXSMQ9NWU1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
OXSMQ9NWU1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
OXSMQ9NWU1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
OXSMQ9NWU1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
OXSMQ9NWU1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
OXSMQ9NWU1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
OXSMQ9NWU1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
OXSMQ9NWU1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
OXSMQ9NWU1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
OXSMQ9NWU1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
OXSMQ9NWU1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
OXSMQ9NWU1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OXSMQ9NWU1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.2 ms