Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWU1

OXSM, 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXSMQ9NWU1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
OXSMQ9NWU1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
OXSMQ9NWU1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
OXSMQ9NWU1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
OXSMQ9NWU1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
OXSMQ9NWU1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
OXSMQ9NWU1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
OXSMQ9NWU1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
OXSMQ9NWU1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
OXSMQ9NWU1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
OXSMQ9NWU1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
OXSMQ9NWU1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
OXSMQ9NWU1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
OXSMQ9NWU1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
OXSMQ9NWU1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
OXSMQ9NWU1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
OXSMQ9NWU1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
OXSMQ9NWU1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
OXSMQ9NWU1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
OXSMQ9NWU1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
OXSMQ9NWU1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
OXSMQ9NWU1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
OXSMQ9NWU1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
OXSMQ9NWU1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
OXSMQ9NWU1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
OXSMQ9NWU1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
OXSMQ9NWU1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
OXSMQ9NWU1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
OXSMQ9NWU1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
OXSMQ9NWU1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
OXSMQ9NWU1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
OXSMQ9NWU1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
OXSMQ9NWU1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
OXSMQ9NWU1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
OXSMQ9NWU1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
OXSMQ9NWU1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
OXSMQ9NWU1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
OXSMQ9NWU1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
OXSMQ9NWU1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
OXSMQ9NWU1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
OXSMQ9NWU1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
OXSMQ9NWU1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
OXSMQ9NWU1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
OXSMQ9NWU1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
OXSMQ9NWU1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
OXSMQ9NWU1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
OXSMQ9NWU1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
OXSMQ9NWU1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
OXSMQ9NWU1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
OXSMQ9NWU1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
OXSMQ9NWU1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
OXSMQ9NWU1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
OXSMQ9NWU1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
OXSMQ9NWU1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
OXSMQ9NWU1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
OXSMQ9NWU1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
OXSMQ9NWU1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
OXSMQ9NWU1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
OXSMQ9NWU1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
OXSMQ9NWU1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
OXSMQ9NWU1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
OXSMQ9NWU1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
OXSMQ9NWU1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
OXSMQ9NWU1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
OXSMQ9NWU1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
OXSMQ9NWU1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
OXSMQ9NWU1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
OXSMQ9NWU1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
OXSMQ9NWU1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
OXSMQ9NWU1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
OXSMQ9NWU1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
OXSMQ9NWU1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
OXSMQ9NWU1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
OXSMQ9NWU1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
OXSMQ9NWU1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
OXSMQ9NWU1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
OXSMQ9NWU1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
OXSMQ9NWU1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
OXSMQ9NWU1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
OXSMQ9NWU1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
OXSMQ9NWU1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
OXSMQ9NWU1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
OXSMQ9NWU1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
OXSMQ9NWU1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
OXSMQ9NWU1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
OXSMQ9NWU1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
OXSMQ9NWU1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
OXSMQ9NWU1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
OXSMQ9NWU1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
OXSMQ9NWU1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
OXSMQ9NWU1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
OXSMQ9NWU1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
OXSMQ9NWU1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
OXSMQ9NWU1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
OXSMQ9NWU1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
OXSMQ9NWU1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
OXSMQ9NWU1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
OXSMQ9NWU1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
OXSMQ9NWU1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
OXSMQ9NWU1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms