Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SAMSN1Q9NSI8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SAMSN1Q9NSI8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SAMSN1Q9NSI8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SAMSN1Q9NSI8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SAMSN1Q9NSI8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SAMSN1Q9NSI8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SAMSN1Q9NSI8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SAMSN1Q9NSI8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SAMSN1Q9NSI8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SAMSN1Q9NSI8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SAMSN1Q9NSI8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SAMSN1Q9NSI8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SAMSN1Q9NSI8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SAMSN1Q9NSI8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SAMSN1Q9NSI8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SAMSN1Q9NSI8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SAMSN1Q9NSI8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SAMSN1Q9NSI8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SAMSN1Q9NSI8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SAMSN1Q9NSI8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SAMSN1Q9NSI8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SAMSN1Q9NSI8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SAMSN1Q9NSI8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SAMSN1Q9NSI8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SAMSN1Q9NSI8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SAMSN1Q9NSI8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SAMSN1Q9NSI8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SAMSN1Q9NSI8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SAMSN1Q9NSI8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SAMSN1Q9NSI8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SAMSN1Q9NSI8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SAMSN1Q9NSI8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SAMSN1Q9NSI8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SAMSN1Q9NSI8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SAMSN1Q9NSI8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SAMSN1Q9NSI8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SAMSN1Q9NSI8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SAMSN1Q9NSI8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SAMSN1Q9NSI8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SAMSN1Q9NSI8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SAMSN1Q9NSI8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SAMSN1Q9NSI8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SAMSN1Q9NSI8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SAMSN1Q9NSI8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SAMSN1Q9NSI8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SAMSN1Q9NSI8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SAMSN1Q9NSI8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SAMSN1Q9NSI8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SAMSN1Q9NSI8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SAMSN1Q9NSI8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SAMSN1Q9NSI8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SAMSN1Q9NSI8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SAMSN1Q9NSI8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SAMSN1Q9NSI8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SAMSN1Q9NSI8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SAMSN1Q9NSI8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SAMSN1Q9NSI8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SAMSN1Q9NSI8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SAMSN1Q9NSI8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SAMSN1Q9NSI8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SAMSN1Q9NSI8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SAMSN1Q9NSI8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SAMSN1Q9NSI8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SAMSN1Q9NSI8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SAMSN1Q9NSI8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SAMSN1Q9NSI8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SAMSN1Q9NSI8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SAMSN1Q9NSI8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SAMSN1Q9NSI8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SAMSN1Q9NSI8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SAMSN1Q9NSI8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SAMSN1Q9NSI8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SAMSN1Q9NSI8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SAMSN1Q9NSI8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SAMSN1Q9NSI8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SAMSN1Q9NSI8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SAMSN1Q9NSI8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SAMSN1Q9NSI8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SAMSN1Q9NSI8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SAMSN1Q9NSI8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SAMSN1Q9NSI8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SAMSN1Q9NSI8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SAMSN1Q9NSI8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SAMSN1Q9NSI8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SAMSN1Q9NSI8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SAMSN1Q9NSI8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SAMSN1Q9NSI8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SAMSN1Q9NSI8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SAMSN1Q9NSI8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SAMSN1Q9NSI8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SAMSN1Q9NSI8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SAMSN1Q9NSI8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SAMSN1Q9NSI8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SAMSN1Q9NSI8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SAMSN1Q9NSI8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SAMSN1Q9NSI8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SAMSN1Q9NSI8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SAMSN1Q9NSI8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SAMSN1Q9NSI8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms