Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC6A13Q9NSD5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC6A13Q9NSD5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC6A13Q9NSD5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC6A13Q9NSD5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC6A13Q9NSD5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC6A13Q9NSD5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC6A13Q9NSD5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC6A13Q9NSD5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC6A13Q9NSD5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC6A13Q9NSD5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC6A13Q9NSD5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC6A13Q9NSD5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC6A13Q9NSD5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC6A13Q9NSD5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC6A13Q9NSD5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC6A13Q9NSD5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC6A13Q9NSD5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC6A13Q9NSD5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC6A13Q9NSD5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC6A13Q9NSD5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC6A13Q9NSD5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC6A13Q9NSD5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC6A13Q9NSD5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC6A13Q9NSD5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC6A13Q9NSD5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC6A13Q9NSD5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC6A13Q9NSD5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC6A13Q9NSD5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC6A13Q9NSD5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A13Q9NSD5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A13Q9NSD5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A13Q9NSD5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A13Q9NSD5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC6A13Q9NSD5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC6A13Q9NSD5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC6A13Q9NSD5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC6A13Q9NSD5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A13Q9NSD5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A13Q9NSD5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A13Q9NSD5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A13Q9NSD5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A13Q9NSD5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A13Q9NSD5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC6A13Q9NSD5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC6A13Q9NSD5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC6A13Q9NSD5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC6A13Q9NSD5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC6A13Q9NSD5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC6A13Q9NSD5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC6A13Q9NSD5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC6A13Q9NSD5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC6A13Q9NSD5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A13Q9NSD5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A13Q9NSD5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A13Q9NSD5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A13Q9NSD5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A13Q9NSD5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC6A13Q9NSD5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC6A13Q9NSD5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC6A13Q9NSD5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC6A13Q9NSD5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC6A13Q9NSD5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC6A13Q9NSD5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC6A13Q9NSD5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC6A13Q9NSD5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC6A13Q9NSD5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC6A13Q9NSD5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC6A13Q9NSD5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC6A13Q9NSD5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC6A13Q9NSD5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A13Q9NSD5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A13Q9NSD5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A13Q9NSD5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A13Q9NSD5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A13Q9NSD5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A13Q9NSD5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC6A13Q9NSD5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC6A13Q9NSD5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC6A13Q9NSD5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC6A13Q9NSD5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC6A13Q9NSD5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC6A13Q9NSD5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC6A13Q9NSD5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC6A13Q9NSD5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC6A13Q9NSD5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A13Q9NSD5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A13Q9NSD5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A13Q9NSD5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A13Q9NSD5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A13Q9NSD5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A13Q9NSD5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A13Q9NSD5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC6A13Q9NSD5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC6A13Q9NSD5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A13Q9NSD5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A13Q9NSD5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A13Q9NSD5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A13Q9NSD5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A13Q9NSD5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms