Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP84

TNFRSF12A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 12A, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF12AQ9NP84 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF12AQ9NP84 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF12AQ9NP84 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFRSF12AQ9NP84 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFRSF12AQ9NP84 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFRSF12AQ9NP84 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF12AQ9NP84 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF12AQ9NP84 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF12AQ9NP84 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF12AQ9NP84 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF12AQ9NP84 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF12AQ9NP84 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TNFRSF12AQ9NP84 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF12AQ9NP84 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF12AQ9NP84 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF12AQ9NP84 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF12AQ9NP84 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF12AQ9NP84 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF12AQ9NP84 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF12AQ9NP84 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF12AQ9NP84 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF12AQ9NP84 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF12AQ9NP84 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF12AQ9NP84 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF12AQ9NP84 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF12AQ9NP84 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF12AQ9NP84 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF12AQ9NP84 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF12AQ9NP84 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF12AQ9NP84 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF12AQ9NP84 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF12AQ9NP84 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFRSF12AQ9NP84 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFRSF12AQ9NP84 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFRSF12AQ9NP84 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
TNFRSF12AQ9NP84 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNFRSF12AQ9NP84 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFRSF12AQ9NP84 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFRSF12AQ9NP84 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFRSF12AQ9NP84 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFRSF12AQ9NP84 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFRSF12AQ9NP84 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFRSF12AQ9NP84 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFRSF12AQ9NP84 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFRSF12AQ9NP84 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFRSF12AQ9NP84 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFRSF12AQ9NP84 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFRSF12AQ9NP84 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFRSF12AQ9NP84 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFRSF12AQ9NP84 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFRSF12AQ9NP84 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFRSF12AQ9NP84 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFRSF12AQ9NP84 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFRSF12AQ9NP84 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFRSF12AQ9NP84 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFRSF12AQ9NP84 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFRSF12AQ9NP84 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFRSF12AQ9NP84 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFRSF12AQ9NP84 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFRSF12AQ9NP84 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFRSF12AQ9NP84 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFRSF12AQ9NP84 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFRSF12AQ9NP84 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFRSF12AQ9NP84 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TNFRSF12AQ9NP84 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TNFRSF12AQ9NP84 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFRSF12AQ9NP84 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFRSF12AQ9NP84 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFRSF12AQ9NP84 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF12AQ9NP84 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF12AQ9NP84 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF12AQ9NP84 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF12AQ9NP84 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF12AQ9NP84 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF12AQ9NP84 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF12AQ9NP84 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF12AQ9NP84 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF12AQ9NP84 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFRSF12AQ9NP84 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF12AQ9NP84 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF12AQ9NP84 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF12AQ9NP84 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF12AQ9NP84 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF12AQ9NP84 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF12AQ9NP84 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF12AQ9NP84 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF12AQ9NP84 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF12AQ9NP84 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF12AQ9NP84 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF12AQ9NP84 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF12AQ9NP84 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF12AQ9NP84 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF12AQ9NP84 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF12AQ9NP84 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFRSF12AQ9NP84 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFRSF12AQ9NP84 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFRSF12AQ9NP84 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFRSF12AQ9NP84 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF12AQ9NP84 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF12AQ9NP84 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms