Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F2

TMEM38A, Trimeric intracellular cation channel type A, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM38AQ9H6F2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM38AQ9H6F2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM38AQ9H6F2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM38AQ9H6F2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM38AQ9H6F2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM38AQ9H6F2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM38AQ9H6F2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM38AQ9H6F2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM38AQ9H6F2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM38AQ9H6F2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM38AQ9H6F2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM38AQ9H6F2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM38AQ9H6F2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM38AQ9H6F2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM38AQ9H6F2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM38AQ9H6F2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM38AQ9H6F2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM38AQ9H6F2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM38AQ9H6F2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM38AQ9H6F2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM38AQ9H6F2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM38AQ9H6F2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM38AQ9H6F2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM38AQ9H6F2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM38AQ9H6F2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM38AQ9H6F2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM38AQ9H6F2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM38AQ9H6F2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM38AQ9H6F2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM38AQ9H6F2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM38AQ9H6F2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM38AQ9H6F2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM38AQ9H6F2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM38AQ9H6F2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM38AQ9H6F2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM38AQ9H6F2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM38AQ9H6F2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM38AQ9H6F2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM38AQ9H6F2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM38AQ9H6F2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM38AQ9H6F2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM38AQ9H6F2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM38AQ9H6F2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM38AQ9H6F2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM38AQ9H6F2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMEM38AQ9H6F2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMEM38AQ9H6F2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMEM38AQ9H6F2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMEM38AQ9H6F2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM38AQ9H6F2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM38AQ9H6F2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM38AQ9H6F2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM38AQ9H6F2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM38AQ9H6F2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM38AQ9H6F2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM38AQ9H6F2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM38AQ9H6F2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM38AQ9H6F2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM38AQ9H6F2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM38AQ9H6F2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM38AQ9H6F2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM38AQ9H6F2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM38AQ9H6F2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM38AQ9H6F2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM38AQ9H6F2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM38AQ9H6F2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM38AQ9H6F2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM38AQ9H6F2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM38AQ9H6F2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM38AQ9H6F2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM38AQ9H6F2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM38AQ9H6F2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM38AQ9H6F2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM38AQ9H6F2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM38AQ9H6F2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM38AQ9H6F2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM38AQ9H6F2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM38AQ9H6F2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM38AQ9H6F2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM38AQ9H6F2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM38AQ9H6F2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM38AQ9H6F2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM38AQ9H6F2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM38AQ9H6F2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM38AQ9H6F2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM38AQ9H6F2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM38AQ9H6F2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM38AQ9H6F2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM38AQ9H6F2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM38AQ9H6F2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM38AQ9H6F2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM38AQ9H6F2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM38AQ9H6F2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM38AQ9H6F2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM38AQ9H6F2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM38AQ9H6F2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM38AQ9H6F2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM38AQ9H6F2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM38AQ9H6F2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM38AQ9H6F2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms