Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4B7

TUBB1, Tubulin beta-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB1Q9H4B7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBB1Q9H4B7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBB1Q9H4B7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBB1Q9H4B7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBB1Q9H4B7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBB1Q9H4B7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBB1Q9H4B7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBB1Q9H4B7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBB1Q9H4B7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBB1Q9H4B7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBB1Q9H4B7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBB1Q9H4B7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBB1Q9H4B7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBB1Q9H4B7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBB1Q9H4B7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBB1Q9H4B7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBB1Q9H4B7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBB1Q9H4B7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBB1Q9H4B7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBB1Q9H4B7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBB1Q9H4B7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBB1Q9H4B7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB1Q9H4B7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB1Q9H4B7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB1Q9H4B7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB1Q9H4B7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB1Q9H4B7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB1Q9H4B7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB1Q9H4B7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBB1Q9H4B7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBB1Q9H4B7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBB1Q9H4B7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBB1Q9H4B7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBB1Q9H4B7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBB1Q9H4B7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBB1Q9H4B7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBB1Q9H4B7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBB1Q9H4B7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB1Q9H4B7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB1Q9H4B7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB1Q9H4B7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB1Q9H4B7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB1Q9H4B7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB1Q9H4B7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBB1Q9H4B7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBB1Q9H4B7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TUBB1Q9H4B7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TUBB1Q9H4B7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TUBB1Q9H4B7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBB1Q9H4B7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBB1Q9H4B7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBB1Q9H4B7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBB1Q9H4B7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBB1Q9H4B7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBB1Q9H4B7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBB1Q9H4B7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBB1Q9H4B7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBB1Q9H4B7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB1Q9H4B7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB1Q9H4B7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB1Q9H4B7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB1Q9H4B7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB1Q9H4B7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBB1Q9H4B7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBB1Q9H4B7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBB1Q9H4B7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBB1Q9H4B7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBB1Q9H4B7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBB1Q9H4B7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBB1Q9H4B7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBB1Q9H4B7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBB1Q9H4B7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBB1Q9H4B7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBB1Q9H4B7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBB1Q9H4B7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBB1Q9H4B7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBB1Q9H4B7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBB1Q9H4B7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBB1Q9H4B7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB1Q9H4B7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB1Q9H4B7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB1Q9H4B7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB1Q9H4B7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB1Q9H4B7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB1Q9H4B7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB1Q9H4B7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB1Q9H4B7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB1Q9H4B7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBB1Q9H4B7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBB1Q9H4B7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBB1Q9H4B7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBB1Q9H4B7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBB1Q9H4B7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBB1Q9H4B7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBB1Q9H4B7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBB1Q9H4B7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBB1Q9H4B7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBB1Q9H4B7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBB1Q9H4B7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
TUBB1Q9H4B7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms