Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4B7

TUBB1, Tubulin beta-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB1Q9H4B7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TUBB1Q9H4B7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TUBB1Q9H4B7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TUBB1Q9H4B7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
TUBB1Q9H4B7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TUBB1Q9H4B7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TUBB1Q9H4B7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TUBB1Q9H4B7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TUBB1Q9H4B7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TUBB1Q9H4B7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TUBB1Q9H4B7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TUBB1Q9H4B7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TUBB1Q9H4B7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TUBB1Q9H4B7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TUBB1Q9H4B7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TUBB1Q9H4B7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TUBB1Q9H4B7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TUBB1Q9H4B7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TUBB1Q9H4B7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TUBB1Q9H4B7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TUBB1Q9H4B7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TUBB1Q9H4B7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TUBB1Q9H4B7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TUBB1Q9H4B7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TUBB1Q9H4B7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TUBB1Q9H4B7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TUBB1Q9H4B7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TUBB1Q9H4B7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
TUBB1Q9H4B7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TUBB1Q9H4B7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TUBB1Q9H4B7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TUBB1Q9H4B7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TUBB1Q9H4B7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TUBB1Q9H4B7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TUBB1Q9H4B7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TUBB1Q9H4B7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TUBB1Q9H4B7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TUBB1Q9H4B7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TUBB1Q9H4B7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TUBB1Q9H4B7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TUBB1Q9H4B7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TUBB1Q9H4B7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TUBB1Q9H4B7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TUBB1Q9H4B7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TUBB1Q9H4B7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TUBB1Q9H4B7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TUBB1Q9H4B7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TUBB1Q9H4B7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TUBB1Q9H4B7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TUBB1Q9H4B7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TUBB1Q9H4B7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TUBB1Q9H4B7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TUBB1Q9H4B7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TUBB1Q9H4B7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TUBB1Q9H4B7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TUBB1Q9H4B7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TUBB1Q9H4B7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TUBB1Q9H4B7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TUBB1Q9H4B7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TUBB1Q9H4B7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TUBB1Q9H4B7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TUBB1Q9H4B7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TUBB1Q9H4B7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TUBB1Q9H4B7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TUBB1Q9H4B7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TUBB1Q9H4B7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TUBB1Q9H4B7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TUBB1Q9H4B7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TUBB1Q9H4B7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TUBB1Q9H4B7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TUBB1Q9H4B7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TUBB1Q9H4B7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
TUBB1Q9H4B7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TUBB1Q9H4B7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TUBB1Q9H4B7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TUBB1Q9H4B7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TUBB1Q9H4B7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TUBB1Q9H4B7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TUBB1Q9H4B7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TUBB1Q9H4B7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TUBB1Q9H4B7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TUBB1Q9H4B7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TUBB1Q9H4B7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TUBB1Q9H4B7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TUBB1Q9H4B7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TUBB1Q9H4B7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TUBB1Q9H4B7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TUBB1Q9H4B7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TUBB1Q9H4B7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TUBB1Q9H4B7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TUBB1Q9H4B7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TUBB1Q9H4B7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TUBB1Q9H4B7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TUBB1Q9H4B7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TUBB1Q9H4B7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TUBB1Q9H4B7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TUBB1Q9H4B7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TUBB1Q9H4B7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUBB1Q9H4B7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUBB1Q9H4B7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1316.7 ms